More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7152 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_7152  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  100 
 
 
291 aa  593  1e-168  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1923  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  39.37 
 
 
296 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238794  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2852  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.5 
 
 
297 aa  187  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0134215  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2389  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  37.96 
 
 
289 aa  181  1e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2197  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  39.37 
 
 
290 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206144  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2547  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  36.36 
 
 
286 aa  179  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0364167 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1714  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.89 
 
 
309 aa  178  9e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.280932  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1173  tartronate semialdehyde reductase  36.9 
 
 
296 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2614  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.15 
 
 
300 aa  174  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3551  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  37.28 
 
 
292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000115044  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0628  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  35.54 
 
 
293 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3742  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.61 
 
 
303 aa  165  9e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1372  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase family protein  36.62 
 
 
286 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.90333  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1979  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.49 
 
 
288 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3356  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.01 
 
 
286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0320622 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0722  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.89 
 
 
296 aa  161  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3379  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.59 
 
 
291 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0410434 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0209  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  34.81 
 
 
294 aa  160  2e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1903  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  32.99 
 
 
282 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.25845  hitchhiker  0.00938968 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2741  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  38.11 
 
 
292 aa  159  6e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0379773  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3011  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  35.52 
 
 
287 aa  159  6e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000101253  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05191  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.68 
 
 
292 aa  157  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0588  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.6 
 
 
287 aa  158  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3456  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  38.79 
 
 
291 aa  158  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.236209  normal  0.0188789 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1704  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.93 
 
 
308 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.542696  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0845  tartronate semialdehyde reductase  32.29 
 
 
294 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0081  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.93 
 
 
292 aa  157  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.280871 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4310  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.6 
 
 
294 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0860064 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5561  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.66 
 
 
283 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.560852  normal  0.0590725 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0555  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.36 
 
 
299 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3485  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35.54 
 
 
293 aa  156  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.575249 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3343  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  36.93 
 
 
303 aa  157  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4475  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  36.33 
 
 
318 aa  156  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1318  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  38.89 
 
 
291 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.676438  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2221  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  36.07 
 
 
297 aa  155  7e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3690  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.36 
 
 
292 aa  155  9e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2233  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.38 
 
 
294 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0351  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  33.56 
 
 
287 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0635  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  31.47 
 
 
292 aa  154  1e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0898  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  33.7 
 
 
314 aa  154  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00998968  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2760  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  34.38 
 
 
298 aa  154  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0685188  normal  0.814405 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2972  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.21 
 
 
310 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.856928  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0261  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  37.04 
 
 
305 aa  153  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0646517 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0331  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.56 
 
 
287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-16 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3393  tartronate semialdehyde reductase  32.64 
 
 
294 aa  153  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2693  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.03 
 
 
294 aa  153  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1316  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  32.99 
 
 
296 aa  152  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.823499  normal  0.0105684 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4437  tartronate semialdehyde reductase  33.33 
 
 
294 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.211957 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3420  tartronate semialdehyde reductase  33.33 
 
 
294 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3233  tartronate semialdehyde reductase  33.33 
 
 
294 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3603  tartronate semialdehyde reductase  33.33 
 
 
294 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3314  tartronate semialdehyde reductase  33.33 
 
 
294 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02990  tartronate semialdehyde reductase  33.33 
 
 
296 aa  152  7e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0580  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.33 
 
 
296 aa  152  7e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0575  tartronate semialdehyde reductase  33.33 
 
 
296 aa  152  7e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02941  hypothetical protein  33.33 
 
 
296 aa  152  7e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43420  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.19 
 
 
296 aa  152  8e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.164862  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1587  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  32.87 
 
 
291 aa  152  8e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.169784  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3760  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.84 
 
 
293 aa  152  8.999999999999999e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.814396  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0127  hypothetical protein  34.24 
 
 
298 aa  152  8.999999999999999e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2821  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  33.45 
 
 
289 aa  152  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0284  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  31.85 
 
 
292 aa  151  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0142  hypothetical protein  34.24 
 
 
298 aa  151  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0338  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.97 
 
 
298 aa  150  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3089  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  32.53 
 
 
297 aa  150  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0811  tartronate semialdehyde reductase  32.99 
 
 
294 aa  150  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1764  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  32.18 
 
 
291 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.113165  normal  0.438738 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1721  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  32.18 
 
 
291 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00783731  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1333  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  35.1 
 
 
299 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000839454 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4729  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.59 
 
 
301 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3990  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  36.24 
 
 
303 aa  149  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4460  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.15 
 
 
294 aa  149  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0568  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.22 
 
 
292 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1305  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.69 
 
 
299 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0958  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.22 
 
 
299 aa  149  5e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1609  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  32.64 
 
 
291 aa  149  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000179577 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0573  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.22 
 
 
292 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0566  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.22 
 
 
292 aa  149  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1087  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.1 
 
 
292 aa  149  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00459  tartronate semialdehyde reductase, NADH-dependent  33.22 
 
 
292 aa  149  7e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3607  tartronate semialdehyde reductase  32.64 
 
 
296 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  0.959534 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00464  hypothetical protein  33.22 
 
 
292 aa  149  7e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3441  tartronate semialdehyde reductase  32.64 
 
 
296 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4151  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.1 
 
 
292 aa  149  7e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3510  tartronate semialdehyde reductase  32.64 
 
 
296 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3438  tartronate semialdehyde reductase  32.64 
 
 
296 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3546  tartronate semialdehyde reductase  32.64 
 
 
296 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.370176  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2700  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.49 
 
 
302 aa  149  8e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0699  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  32.63 
 
 
286 aa  148  8e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000621245 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3103  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.22 
 
 
292 aa  148  9e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4109  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.06 
 
 
292 aa  148  9e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4173  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.1 
 
 
292 aa  148  9e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000525805  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0583  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.22 
 
 
292 aa  148  9e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0546  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.22 
 
 
292 aa  148  9e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3113  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.22 
 
 
292 aa  148  9e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.327741 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2568  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  31.49 
 
 
291 aa  148  9e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.138617  hitchhiker  0.00176659 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2771  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.11 
 
 
296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0891841  normal  0.489794 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1159  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.69 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.997729  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0594  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  32.65 
 
 
299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.84188  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1724  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  31.49 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>