More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1714 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1714  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  100 
 
 
309 aa  613  9.999999999999999e-175  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.280932  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2852  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  91.78 
 
 
297 aa  528  1e-149  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0134215  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1923  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  65.29 
 
 
296 aa  386  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238794  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2614  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  54.61 
 
 
300 aa  310  2e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0081  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  50.69 
 
 
292 aa  286  4e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.280871 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4460  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  50.69 
 
 
294 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0555  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  54.51 
 
 
299 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3379  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  49.83 
 
 
291 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0410434 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7094  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  50 
 
 
293 aa  281  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444897  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08160  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  51.89 
 
 
298 aa  278  7e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0172  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  48.14 
 
 
309 aa  278  7e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.798657  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0594  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  46.74 
 
 
299 aa  276  4e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.84188  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6528  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  46.58 
 
 
297 aa  275  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186276  normal  0.100696 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1159  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  48.11 
 
 
292 aa  276  5e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.997729  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1777  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  49.66 
 
 
295 aa  275  9e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581987  normal  0.552551 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5561  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  50.53 
 
 
283 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.560852  normal  0.0590725 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4859  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  47.6 
 
 
297 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.748222  normal  0.158599 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1409  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  52.65 
 
 
284 aa  272  4.0000000000000004e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0135816  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3864  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  47.1 
 
 
297 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0721878  normal  0.335239 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0958  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  45.7 
 
 
299 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4299  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  46.76 
 
 
297 aa  269  5e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6206  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  49.66 
 
 
293 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107985  normal  0.646779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1570  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  46.76 
 
 
297 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101448  normal  0.880113 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0722  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  51.39 
 
 
296 aa  268  8.999999999999999e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3624  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  46.76 
 
 
297 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1933  oxidoreductase protein  47.57 
 
 
290 aa  268  1e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.508408  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1133  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  48.26 
 
 
301 aa  267  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.24797 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3450  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  46.31 
 
 
307 aa  265  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3102  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  47.6 
 
 
293 aa  265  7e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1600  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  46.92 
 
 
293 aa  264  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.36162  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2369  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  46.74 
 
 
292 aa  264  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1297  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  47.08 
 
 
294 aa  263  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4310  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  45.86 
 
 
294 aa  263  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0860064 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3456  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  51.92 
 
 
291 aa  263  3e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.236209  normal  0.0188789 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3343  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  48.97 
 
 
303 aa  263  3e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0845  tartronate semialdehyde reductase  47.92 
 
 
294 aa  262  4.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1622  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  45.24 
 
 
302 aa  262  6e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438237  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1500  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  44.79 
 
 
299 aa  261  8e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.921564  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1632  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  44.98 
 
 
303 aa  261  8e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00459  tartronate semialdehyde reductase, NADH-dependent  46.05 
 
 
292 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3546  tartronate semialdehyde reductase  45.36 
 
 
296 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.370176  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3510  tartronate semialdehyde reductase  45.36 
 
 
296 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3438  tartronate semialdehyde reductase  45.36 
 
 
296 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0552  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  46.05 
 
 
292 aa  261  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3607  tartronate semialdehyde reductase  45.36 
 
 
296 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  0.959534 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3441  tartronate semialdehyde reductase  45.36 
 
 
296 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1780  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  45.92 
 
 
302 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3990  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  49.66 
 
 
303 aa  261  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00464  hypothetical protein  46.05 
 
 
292 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43420  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  46.94 
 
 
296 aa  261  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.164862  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3103  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  46.05 
 
 
292 aa  260  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3113  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  46.05 
 
 
292 aa  260  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.327741 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0568  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  45.36 
 
 
292 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2462  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  45.58 
 
 
302 aa  260  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.394551  normal  0.60461 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0573  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  45.36 
 
 
292 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0566  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  45.36 
 
 
292 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0546  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  46.05 
 
 
292 aa  260  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0627  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  45.36 
 
 
292 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02990  tartronate semialdehyde reductase  45.36 
 
 
296 aa  259  4e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0580  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  45.36 
 
 
296 aa  259  4e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02941  hypothetical protein  45.36 
 
 
296 aa  259  4e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0575  tartronate semialdehyde reductase  45.36 
 
 
296 aa  259  4e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0583  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  46.39 
 
 
292 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0610  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  45.7 
 
 
292 aa  258  7e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1817  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  46.9 
 
 
297 aa  258  7e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4437  tartronate semialdehyde reductase  45.49 
 
 
294 aa  258  9e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.211957 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3233  tartronate semialdehyde reductase  45.49 
 
 
294 aa  258  9e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3314  tartronate semialdehyde reductase  45.49 
 
 
294 aa  258  9e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3603  tartronate semialdehyde reductase  45.49 
 
 
294 aa  258  9e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3420  tartronate semialdehyde reductase  45.49 
 
 
294 aa  258  9e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1789  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  46.9 
 
 
297 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3293  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  44.97 
 
 
306 aa  256  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3831  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  46.08 
 
 
296 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4497  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  47.06 
 
 
292 aa  256  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0494062  normal  0.295932 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4629  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  47.06 
 
 
292 aa  256  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0195507  hitchhiker  0.00760416 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45020  putative oxidoreductase  46.08 
 
 
296 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.820061  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3089  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  44.56 
 
 
297 aa  256  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1394  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  46.21 
 
 
296 aa  256  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125188  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4729  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  47.47 
 
 
301 aa  256  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3690  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  46.23 
 
 
292 aa  256  3e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0811  tartronate semialdehyde reductase  46.53 
 
 
294 aa  256  4e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2389  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  46.34 
 
 
289 aa  255  6e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2119  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  46.34 
 
 
304 aa  255  7e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0276919 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5180  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  46.21 
 
 
297 aa  255  8e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.312851  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0975  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  47.3 
 
 
299 aa  255  8e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.247687  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3437  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  46.23 
 
 
292 aa  255  8e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1596  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  45.73 
 
 
297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00205037  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2310  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  45.73 
 
 
294 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.167544  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3153  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  44.63 
 
 
304 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.636013 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6199  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  46.55 
 
 
297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0390445  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1880  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  46.55 
 
 
297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109553  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1903  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  46.55 
 
 
297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00006568 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2426  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  45.83 
 
 
301 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2171  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  45.17 
 
 
301 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.611002  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2301  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  45.83 
 
 
301 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1123  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  47.72 
 
 
299 aa  253  3e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.356226 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3480  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  44.3 
 
 
304 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3742  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  46.37 
 
 
303 aa  253  4.0000000000000004e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2261  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  45.49 
 
 
301 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.35206  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4563  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  44.48 
 
 
309 aa  252  5.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.386042 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>