More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2614 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2614  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  100 
 
 
300 aa  594  1e-169  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1409  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  61.79 
 
 
284 aa  322  6e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0135816  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1923  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  57.29 
 
 
296 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238794  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3379  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  55.33 
 
 
291 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0410434 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0594  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  52.9 
 
 
299 aa  311  1e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.84188  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1714  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  54.61 
 
 
309 aa  310  2e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.280932  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2852  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  54.83 
 
 
297 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0134215  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3864  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  53.76 
 
 
297 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0721878  normal  0.335239 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4299  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  53.76 
 
 
297 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1570  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  53.76 
 
 
297 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101448  normal  0.880113 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3624  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  53.05 
 
 
297 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4460  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  52.61 
 
 
294 aa  297  2e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1133  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  53 
 
 
301 aa  295  4e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.24797 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0958  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  51.55 
 
 
299 aa  296  4e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43420  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  53.05 
 
 
296 aa  295  6e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.164862  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4310  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  51.05 
 
 
294 aa  295  6e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0860064 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3102  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  52.86 
 
 
293 aa  294  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2119  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  53.02 
 
 
304 aa  294  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0276919 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3450  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  51.38 
 
 
307 aa  293  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1600  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  52.69 
 
 
293 aa  293  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.36162  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02990  tartronate semialdehyde reductase  51.38 
 
 
296 aa  293  3e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0580  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  51.38 
 
 
296 aa  293  3e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3314  tartronate semialdehyde reductase  51.38 
 
 
294 aa  293  3e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02941  hypothetical protein  51.38 
 
 
296 aa  293  3e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3603  tartronate semialdehyde reductase  51.38 
 
 
294 aa  293  3e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3233  tartronate semialdehyde reductase  51.38 
 
 
294 aa  293  3e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3420  tartronate semialdehyde reductase  51.38 
 
 
294 aa  293  3e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2369  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  51.97 
 
 
292 aa  293  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4437  tartronate semialdehyde reductase  51.38 
 
 
294 aa  293  3e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.211957 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0575  tartronate semialdehyde reductase  51.38 
 
 
296 aa  293  3e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00459  tartronate semialdehyde reductase, NADH-dependent  51.97 
 
 
292 aa  291  7e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00464  hypothetical protein  51.97 
 
 
292 aa  291  7e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3103  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  51.97 
 
 
292 aa  291  8e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3113  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  51.97 
 
 
292 aa  291  8e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.327741 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0546  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  51.97 
 
 
292 aa  291  8e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0583  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  51.97 
 
 
292 aa  290  2e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0081  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  51.61 
 
 
292 aa  290  2e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.280871 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0552  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  51.61 
 
 
292 aa  290  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5561  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  53.05 
 
 
283 aa  290  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.560852  normal  0.0590725 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3831  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  52.33 
 
 
296 aa  289  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3510  tartronate semialdehyde reductase  50.34 
 
 
296 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3546  tartronate semialdehyde reductase  50.34 
 
 
296 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.370176  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3438  tartronate semialdehyde reductase  50.34 
 
 
296 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3441  tartronate semialdehyde reductase  50.34 
 
 
296 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3607  tartronate semialdehyde reductase  50.34 
 
 
296 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  0.959534 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45020  putative oxidoreductase  52.33 
 
 
296 aa  289  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.820061  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0975  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  53.56 
 
 
299 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.247687  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0566  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  50.54 
 
 
292 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0573  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  50.54 
 
 
292 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0568  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  50.54 
 
 
292 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0610  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  51.61 
 
 
292 aa  288  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0627  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  50.18 
 
 
292 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3293  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  50 
 
 
306 aa  287  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1123  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  53.41 
 
 
299 aa  287  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.356226 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1159  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  51.22 
 
 
292 aa  287  1e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.997729  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2771  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  51.97 
 
 
296 aa  287  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0891841  normal  0.489794 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3089  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  49.31 
 
 
297 aa  287  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1933  oxidoreductase protein  50 
 
 
290 aa  287  2e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.508408  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2426  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  53.6 
 
 
301 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0460  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  52.61 
 
 
294 aa  286  4e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0485372  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2301  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  53.6 
 
 
301 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2171  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  53.6 
 
 
301 aa  285  5e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.611002  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1394  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  51.8 
 
 
296 aa  285  5e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125188  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2310  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  52.14 
 
 
294 aa  285  5e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.167544  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1817  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  51.44 
 
 
297 aa  285  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7094  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  53.6 
 
 
293 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444897  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1789  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  51.8 
 
 
297 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3153  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  50.17 
 
 
304 aa  285  8e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.636013 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1596  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  52.33 
 
 
297 aa  285  8e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00205037  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2261  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  53.24 
 
 
301 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.35206  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1903  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  51.44 
 
 
297 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00006568 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3480  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  49.83 
 
 
304 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4864  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase GcxR  52.5 
 
 
295 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.902474  normal  0.691773 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6199  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  51.44 
 
 
297 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0390445  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1880  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  51.44 
 
 
297 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109553  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6528  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  51.26 
 
 
297 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186276  normal  0.100696 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5180  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  50.72 
 
 
297 aa  281  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.312851  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1297  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  51.03 
 
 
294 aa  281  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4859  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  50.71 
 
 
297 aa  279  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.748222  normal  0.158599 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0172  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  48.81 
 
 
309 aa  280  3e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.798657  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4629  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  52.88 
 
 
292 aa  279  4e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0195507  hitchhiker  0.00760416 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4563  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  48.68 
 
 
309 aa  279  4e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.386042 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1632  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  49.29 
 
 
303 aa  279  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4497  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  52.88 
 
 
292 aa  279  4e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0494062  normal  0.295932 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1780  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  51.25 
 
 
302 aa  279  5e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0845  tartronate semialdehyde reductase  51.72 
 
 
294 aa  279  5e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3283  transmembrane 2-hydroxy-3-oxopropionate reductase oxidoreductase protein  51.4 
 
 
303 aa  277  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2462  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  50.9 
 
 
302 aa  277  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.394551  normal  0.60461 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1173  tartronate semialdehyde reductase  49.31 
 
 
296 aa  276  3e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1777  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  54.12 
 
 
295 aa  276  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581987  normal  0.552551 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1500  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  48.39 
 
 
299 aa  276  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.921564  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1622  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  50.18 
 
 
302 aa  276  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438237  normal  0.406893 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2389  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  47.2 
 
 
289 aa  275  7e-73  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3393  tartronate semialdehyde reductase  51.03 
 
 
294 aa  273  3e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3956  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  49.65 
 
 
302 aa  271  8.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0811  tartronate semialdehyde reductase  52.41 
 
 
294 aa  271  8.000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3567  tartronate semialdehyde reductase  50.87 
 
 
296 aa  269  2.9999999999999997e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.795052 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6206  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  53.24 
 
 
293 aa  267  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107985  normal  0.646779 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3553  tartronate semialdehyde reductase  51.92 
 
 
294 aa  263  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0957  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  47.89 
 
 
305 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>