More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1907 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_1907  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  100 
 
 
290 aa  577  1.0000000000000001e-163  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.60651  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1101  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  78.28 
 
 
290 aa  434  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1337  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  78.97 
 
 
290 aa  424  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0431672  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1787  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  76.82 
 
 
290 aa  390  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426643  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0154  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  76.82 
 
 
290 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1752  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  74.14 
 
 
291 aa  389  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.526559 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4482  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  79.31 
 
 
291 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.217481  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6083  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  68.1 
 
 
281 aa  359  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.662698  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22120  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  56.79 
 
 
296 aa  305  6e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.218091 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5817  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  54.3 
 
 
293 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0885665 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6723  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  54.11 
 
 
293 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216228  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1276  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  57.04 
 
 
296 aa  293  2e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476211  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1314  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  57.04 
 
 
296 aa  291  6e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.848516  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3091  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  53.42 
 
 
295 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.207365 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2156  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  51.19 
 
 
299 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.501348 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2556  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  53.47 
 
 
299 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2122  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  53.77 
 
 
295 aa  285  4e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.337883  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1870  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  54.08 
 
 
296 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2525  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  53.06 
 
 
295 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927103  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2177  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  55.29 
 
 
296 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.279609  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1078  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  51.9 
 
 
290 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0733755 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1062  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  51.9 
 
 
290 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1089  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  51.9 
 
 
290 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0903415  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3299  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  53.47 
 
 
295 aa  278  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.241837  normal  0.0981124 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0615  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  50.68 
 
 
295 aa  274  1.0000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.789024  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0861  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  54.83 
 
 
289 aa  273  2.0000000000000002e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1308  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  50.17 
 
 
294 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.258741  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1542  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  51.55 
 
 
297 aa  274  2.0000000000000002e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0206535  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5012  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  51.76 
 
 
290 aa  271  6e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.210845  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4243  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  54.45 
 
 
298 aa  270  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.519219  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3056  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  52.4 
 
 
291 aa  271  1e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.76812 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2479  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  52.9 
 
 
296 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.766336  normal  0.288256 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0647  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  53.92 
 
 
296 aa  267  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.020642  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0632  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  50.84 
 
 
319 aa  267  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2189  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  53.4 
 
 
314 aa  267  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.276186 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3068  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  49.31 
 
 
289 aa  266  2.9999999999999995e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3935  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  53.08 
 
 
295 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1360  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  50.17 
 
 
290 aa  261  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.117709  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3900  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  49.65 
 
 
289 aa  260  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3581  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  54.2 
 
 
296 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2900  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  48.3 
 
 
296 aa  258  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.287224  hitchhiker  0.0000517661 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3050  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  51.53 
 
 
298 aa  255  6e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0336395  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3782  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  54.48 
 
 
297 aa  255  8e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0422  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  47.32 
 
 
313 aa  254  9e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10765  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase mmsB  48.11 
 
 
294 aa  251  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.17463e-32  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01512  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  48.28 
 
 
291 aa  250  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0625  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  58.68 
 
 
299 aa  244  8e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0142  hypothetical protein  44.93 
 
 
298 aa  244  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0127  hypothetical protein  44.59 
 
 
298 aa  240  2e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1148  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  44.07 
 
 
297 aa  234  9e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1018  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  43.73 
 
 
297 aa  232  5e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1682  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  44.37 
 
 
300 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1575  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  44.75 
 
 
298 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.880265  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18140  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  44.9 
 
 
298 aa  225  7e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001550  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  41.61 
 
 
301 aa  224  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5958  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  43.34 
 
 
293 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.564119  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4931  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  42.32 
 
 
293 aa  223  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.684033  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3575  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  46.76 
 
 
297 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2778  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  45.33 
 
 
309 aa  221  9e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.104386  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05487  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  41.28 
 
 
301 aa  219  3.9999999999999997e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0783  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  44.93 
 
 
296 aa  219  5e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1672  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  44.93 
 
 
299 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.715505  hitchhiker  0.000314937 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0297  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  41.67 
 
 
309 aa  218  1e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2851  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  44.37 
 
 
300 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000128399 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1530  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  44.37 
 
 
300 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1494  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  44.37 
 
 
300 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1500  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  44.37 
 
 
300 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2592  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  46.08 
 
 
300 aa  217  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101214 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0690  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  44.93 
 
 
295 aa  216  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1402  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  44.37 
 
 
300 aa  216  5e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2659  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  45.39 
 
 
300 aa  216  5e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0234954  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1833  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  52.22 
 
 
296 aa  215  7e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0768  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  44.75 
 
 
295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1343  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  43.24 
 
 
299 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.383496  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2766  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  45.05 
 
 
300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0904  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  43.58 
 
 
321 aa  212  5.999999999999999e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.482151 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02850  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  53.17 
 
 
305 aa  211  1e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1380  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  45.58 
 
 
301 aa  211  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0240977 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4666  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  44.07 
 
 
295 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.534341  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4664  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  44.07 
 
 
295 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128162  normal  0.386359 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4530  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  44.07 
 
 
295 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0233897  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5129  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  44.37 
 
 
297 aa  210  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.468786 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1557  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  44.48 
 
 
298 aa  209  4e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.734948  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0245  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  45.33 
 
 
298 aa  209  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1800  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  45.39 
 
 
298 aa  208  9e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2471  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  42.86 
 
 
300 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  decreased coverage  0.00450242 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0696  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  43.69 
 
 
295 aa  206  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2159  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  46.64 
 
 
308 aa  206  5e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4901  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  45.39 
 
 
300 aa  205  6e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0315002  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3539  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  43 
 
 
299 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.744262  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0223  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  43.15 
 
 
296 aa  204  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000370  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  42.09 
 
 
298 aa  204  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.81552  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1809  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  42.03 
 
 
295 aa  204  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0921  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  44.71 
 
 
298 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0829  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  44.71 
 
 
298 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.601203  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2181  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  44.71 
 
 
298 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1513  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  42.23 
 
 
321 aa  202  4e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3197  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  42.28 
 
 
305 aa  202  5e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.800362  normal  0.0128896 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0951  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  41.67 
 
 
306 aa  202  5e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.012671  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4382  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  45.05 
 
 
300 aa  202  7e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.128 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>