More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5012 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_5012  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  100 
 
 
290 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.210845  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1360  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  91.7 
 
 
290 aa  499  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.117709  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1089  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  80.62 
 
 
290 aa  471  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0903415  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1078  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  80.28 
 
 
290 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0733755 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1062  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  80.28 
 
 
290 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3068  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  72.32 
 
 
289 aa  429  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3900  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  74.74 
 
 
289 aa  425  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10765  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase mmsB  72.32 
 
 
294 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.17463e-32  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1314  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  61.17 
 
 
296 aa  347  1e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.848516  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1276  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  60.82 
 
 
296 aa  346  3e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476211  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1870  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  61.38 
 
 
296 aa  345  7e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2556  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  60 
 
 
299 aa  343  2e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2156  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  59.66 
 
 
299 aa  340  2e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.501348 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1308  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  56.55 
 
 
294 aa  329  3e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.258741  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2122  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  60.48 
 
 
295 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.337883  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6723  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  57.04 
 
 
293 aa  322  6e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216228  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5817  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  56.36 
 
 
293 aa  318  6e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0885665 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2177  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  58.76 
 
 
296 aa  316  3e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.279609  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3091  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  58.97 
 
 
295 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.207365 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22120  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  55.71 
 
 
296 aa  312  3.9999999999999997e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.218091 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0632  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  54.92 
 
 
319 aa  311  1e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2525  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  53.95 
 
 
295 aa  310  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927103  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3299  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  58.76 
 
 
295 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.241837  normal  0.0981124 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2189  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  59.04 
 
 
314 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.276186 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0422  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  54.76 
 
 
313 aa  301  6.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2479  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  59.31 
 
 
296 aa  296  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.766336  normal  0.288256 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4243  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  55.86 
 
 
298 aa  296  3e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.519219  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3581  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  60.82 
 
 
296 aa  296  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3935  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  56.36 
 
 
295 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0615  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  54.11 
 
 
295 aa  292  4e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.789024  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3782  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  58.33 
 
 
297 aa  288  9e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0625  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  58.22 
 
 
299 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1101  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  51.41 
 
 
290 aa  271  9e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0861  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  55.05 
 
 
289 aa  270  2e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1542  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  52.07 
 
 
297 aa  267  2e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0206535  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1337  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  53.17 
 
 
290 aa  265  5e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0431672  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2900  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  50.51 
 
 
296 aa  265  7e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.287224  hitchhiker  0.0000517661 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3056  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  52.78 
 
 
291 aa  260  2e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.76812 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02850  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  56.42 
 
 
305 aa  259  3e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3050  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  51.2 
 
 
298 aa  256  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0336395  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1787  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  52.82 
 
 
290 aa  250  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426643  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0154  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  53.17 
 
 
290 aa  249  3e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1907  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  51.76 
 
 
290 aa  249  6e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.60651  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0647  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  53.45 
 
 
296 aa  246  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.020642  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01512  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  48.97 
 
 
291 aa  243  3e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0223  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  48.97 
 
 
296 aa  239  2.9999999999999997e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0142  hypothetical protein  45.21 
 
 
298 aa  238  8e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18140  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  46.44 
 
 
298 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4482  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  53.87 
 
 
291 aa  236  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.217481  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1575  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  46.78 
 
 
298 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.880265  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1752  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  50.52 
 
 
291 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.526559 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0127  hypothetical protein  44.52 
 
 
298 aa  232  5e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0297  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  42.66 
 
 
309 aa  228  8e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1148  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  44.22 
 
 
297 aa  228  1e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6083  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  46.74 
 
 
281 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.662698  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2778  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  46.13 
 
 
309 aa  224  9e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.104386  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1018  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  43.69 
 
 
297 aa  223  2e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1682  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  43 
 
 
300 aa  223  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1833  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  53.63 
 
 
296 aa  224  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1322  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  46.55 
 
 
300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.172587  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4931  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  42.61 
 
 
293 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.684033  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1402  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  45.05 
 
 
300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1494  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  44.37 
 
 
300 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1500  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  44.37 
 
 
300 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2851  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  44.37 
 
 
300 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000128399 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1530  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  44.37 
 
 
300 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2181  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  46.55 
 
 
298 aa  215  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0921  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  46.55 
 
 
298 aa  215  7e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0829  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  46.55 
 
 
298 aa  215  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.601203  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1380  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  45.05 
 
 
301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0240977 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1513  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  41.87 
 
 
321 aa  211  9e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5129  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  43.64 
 
 
297 aa  210  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.468786 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2159  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  41.75 
 
 
308 aa  210  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0904  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  41.18 
 
 
321 aa  209  6e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.482151 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1800  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  45.17 
 
 
298 aa  208  9e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0783  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  44.33 
 
 
296 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05487  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  40.6 
 
 
301 aa  208  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5958  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  41.03 
 
 
293 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.564119  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0768  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  44.33 
 
 
295 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4530  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  43.1 
 
 
295 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0233897  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01370  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  41.72 
 
 
301 aa  206  3e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4666  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  43.1 
 
 
295 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.534341  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000370  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  43.79 
 
 
298 aa  205  6e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.81552  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2659  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  43.69 
 
 
300 aa  205  6e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0234954  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0245  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  44.6 
 
 
298 aa  205  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2592  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  43.69 
 
 
300 aa  205  7e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101214 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001550  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  39.73 
 
 
301 aa  204  9e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1672  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  44.26 
 
 
299 aa  204  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.715505  hitchhiker  0.000314937 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1343  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  42.71 
 
 
299 aa  204  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.383496  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0690  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  43.99 
 
 
295 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4664  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  42.76 
 
 
295 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128162  normal  0.386359 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5647  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  44.83 
 
 
304 aa  203  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373454  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3253  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  43.2 
 
 
300 aa  202  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.337633  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2766  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  43.34 
 
 
300 aa  202  5e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2600  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  44.03 
 
 
299 aa  201  8e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00798756  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3539  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  44.3 
 
 
299 aa  201  8e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.744262  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2129  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  44.37 
 
 
295 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0853416  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0696  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  42.76 
 
 
295 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5326  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  44.6 
 
 
299 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.012022  normal  0.0232804 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4960  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  44.6 
 
 
299 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.247948 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>