More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2189 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2189  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  100 
 
 
314 aa  626  1e-178  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.276186 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1870  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  69.59 
 
 
296 aa  396  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2556  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  69.13 
 
 
299 aa  392  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1308  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  66.55 
 
 
294 aa  390  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.258741  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1314  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  68.12 
 
 
296 aa  385  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.848516  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1276  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  68.81 
 
 
296 aa  385  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476211  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2122  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  70.51 
 
 
295 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.337883  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6723  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  68.58 
 
 
293 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216228  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0632  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  64 
 
 
319 aa  378  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5817  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  67.46 
 
 
293 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0885665 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2156  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  65.89 
 
 
299 aa  380  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.501348 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3091  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  69.26 
 
 
295 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.207365 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0422  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  63.18 
 
 
313 aa  371  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2177  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  68.23 
 
 
296 aa  368  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.279609  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3299  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  69.83 
 
 
295 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.241837  normal  0.0981124 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2900  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  64.16 
 
 
296 aa  355  5.999999999999999e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.287224  hitchhiker  0.0000517661 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2525  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  62.96 
 
 
295 aa  353  2e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927103  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3935  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  67.46 
 
 
295 aa  351  8.999999999999999e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2479  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  68.46 
 
 
296 aa  350  3e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.766336  normal  0.288256 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22120  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  59.93 
 
 
296 aa  349  3e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.218091 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3782  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  67.68 
 
 
297 aa  347  2e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0615  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  63.48 
 
 
295 aa  347  2e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.789024  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4243  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  65.87 
 
 
298 aa  345  7e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.519219  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3581  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  69.26 
 
 
296 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3068  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  58.02 
 
 
289 aa  322  4e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1542  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  59.06 
 
 
297 aa  316  4e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0206535  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5012  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  59.04 
 
 
290 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.210845  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1078  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  57 
 
 
290 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0733755 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1062  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  57 
 
 
290 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1089  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  56.66 
 
 
290 aa  308  8e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0903415  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0142  hypothetical protein  53.77 
 
 
298 aa  306  4.0000000000000004e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0127  hypothetical protein  53.77 
 
 
298 aa  303  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10765  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase mmsB  57.58 
 
 
294 aa  302  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.17463e-32  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3900  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  58.13 
 
 
289 aa  301  9e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1101  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  55.74 
 
 
290 aa  297  2e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02850  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  62.84 
 
 
305 aa  296  4e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0625  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  65.75 
 
 
299 aa  295  9e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1360  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  56.31 
 
 
290 aa  292  5e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.117709  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0861  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  57.49 
 
 
289 aa  291  7e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3056  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  54.83 
 
 
291 aa  288  1e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.76812 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1337  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  56.66 
 
 
290 aa  279  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0431672  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01512  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  53.79 
 
 
291 aa  277  1e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1787  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  58.02 
 
 
290 aa  276  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426643  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0154  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  58.02 
 
 
290 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0647  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  57.53 
 
 
296 aa  276  4e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.020642  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1752  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  58.89 
 
 
291 aa  273  3e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.526559 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1833  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  59.34 
 
 
296 aa  271  7e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3050  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  54.92 
 
 
298 aa  271  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0336395  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4259  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  52.22 
 
 
297 aa  269  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.597  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5129  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  49.32 
 
 
297 aa  263  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.468786 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0297  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  51.02 
 
 
309 aa  262  4.999999999999999e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4666  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  51.37 
 
 
295 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.534341  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4530  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  51.37 
 
 
295 aa  261  8e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0233897  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0768  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  51.37 
 
 
295 aa  261  8e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1148  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  48.99 
 
 
297 aa  260  2e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1380  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  52.9 
 
 
301 aa  260  2e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0240977 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4664  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  51.37 
 
 
295 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128162  normal  0.386359 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1018  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  48.99 
 
 
297 aa  260  2e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0223  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  49.15 
 
 
296 aa  258  1e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6083  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  53.85 
 
 
281 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.662698  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5647  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  52.07 
 
 
304 aa  257  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373454  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0783  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  50 
 
 
296 aa  256  4e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1907  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  53.4 
 
 
290 aa  256  4e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.60651  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1682  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  48.46 
 
 
300 aa  255  6e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2181  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  51.72 
 
 
298 aa  255  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1800  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  51.03 
 
 
298 aa  255  8e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0829  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  51.72 
 
 
298 aa  255  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.601203  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0921  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  51.72 
 
 
298 aa  255  8e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1809  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  51.37 
 
 
295 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10700  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  51.7 
 
 
297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.694075  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2778  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  49.5 
 
 
309 aa  251  2e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.104386  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3659  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  50.34 
 
 
299 aa  250  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.881887 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0717  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  50.68 
 
 
299 aa  250  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396436  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3407  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  50.68 
 
 
299 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.373946  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5326  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  50.68 
 
 
299 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.012022  normal  0.0232804 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4960  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  50.68 
 
 
299 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.247948 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2005  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  51.03 
 
 
295 aa  250  3e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.848417  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5958  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  46.39 
 
 
293 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.564119  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0696  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  50.34 
 
 
295 aa  249  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1087  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  50 
 
 
301 aa  249  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.27752  decreased coverage  0.00698053 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4382  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  50.34 
 
 
300 aa  249  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.128 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4901  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  50.34 
 
 
300 aa  249  5e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0315002  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18140  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  49.83 
 
 
298 aa  248  7e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0690  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  47.96 
 
 
295 aa  248  8e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1402  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  49.49 
 
 
300 aa  248  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1575  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  49.16 
 
 
298 aa  246  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.880265  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0245  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  49.31 
 
 
298 aa  246  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4482  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  57.34 
 
 
291 aa  246  4e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.217481  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000370  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  48.81 
 
 
298 aa  246  4e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.81552  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4931  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  46.21 
 
 
293 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.684033  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1494  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  48.81 
 
 
300 aa  245  6e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1530  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  48.81 
 
 
300 aa  245  6e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1500  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  48.81 
 
 
300 aa  245  6e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2851  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  48.81 
 
 
300 aa  245  6e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000128399 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1672  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  49.66 
 
 
299 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.715505  hitchhiker  0.000314937 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3948  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  51.71 
 
 
296 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344524  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3253  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  51.36 
 
 
300 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.337633  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4320  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  51.55 
 
 
302 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4046  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  51.57 
 
 
296 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0514793  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3575  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  47.24 
 
 
297 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>