More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6723 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6723  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  100 
 
 
293 aa  595  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.216228  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5817  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  94.86 
 
 
293 aa  547  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0885665 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1308  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  72.07 
 
 
294 aa  425  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.258741  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2122  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  72.6 
 
 
295 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.337883  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1870  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  72.35 
 
 
296 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2556  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  68.97 
 
 
299 aa  410  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1276  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  71.23 
 
 
296 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476211  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1314  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  71.23 
 
 
296 aa  403  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.848516  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3091  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  69.97 
 
 
295 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.207365 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3299  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  70.89 
 
 
295 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.241837  normal  0.0981124 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2156  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  65.86 
 
 
299 aa  397  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.501348 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4243  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  70 
 
 
298 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.519219  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3935  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  71.23 
 
 
295 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0615  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  67.81 
 
 
295 aa  387  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.789024  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2177  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  70.45 
 
 
296 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.279609  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3782  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  70.38 
 
 
297 aa  378  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2479  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  69.66 
 
 
296 aa  378  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.766336  normal  0.288256 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2189  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  68.58 
 
 
314 aa  367  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.276186 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2525  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  59.73 
 
 
295 aa  355  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927103  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3581  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  67.24 
 
 
296 aa  355  3.9999999999999996e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0632  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  56.42 
 
 
319 aa  343  2e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22120  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  58.22 
 
 
296 aa  342  5.999999999999999e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.218091 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2900  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  61.09 
 
 
296 aa  341  1e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.287224  hitchhiker  0.0000517661 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1542  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  58.62 
 
 
297 aa  335  5e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0206535  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0422  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  54.88 
 
 
313 aa  332  6e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1062  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  56.21 
 
 
290 aa  328  6e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1078  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  56.21 
 
 
290 aa  328  6e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0733755 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1089  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  55.86 
 
 
290 aa  325  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0903415  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5012  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  57.04 
 
 
290 aa  322  5e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.210845  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1101  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  56.36 
 
 
290 aa  321  9.000000000000001e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3068  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  55.52 
 
 
289 aa  318  7.999999999999999e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3056  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  57.09 
 
 
291 aa  316  2e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.76812 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3900  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  58.04 
 
 
289 aa  311  1e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3050  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  57.34 
 
 
298 aa  310  2e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0336395  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1360  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  55.86 
 
 
290 aa  309  4e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.117709  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10765  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase mmsB  54.61 
 
 
294 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.17463e-32  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1337  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  57.39 
 
 
290 aa  301  7.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0431672  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0142  hypothetical protein  54.14 
 
 
298 aa  300  2e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0625  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  64.48 
 
 
299 aa  299  5e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.960908  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1787  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  57.73 
 
 
290 aa  298  6e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426643  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0861  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  54.9 
 
 
289 aa  297  1e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0154  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  58.08 
 
 
290 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0127  hypothetical protein  53.79 
 
 
298 aa  295  5e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0647  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  55.52 
 
 
296 aa  289  5.0000000000000004e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.020642  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1752  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  56.7 
 
 
291 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.526559 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01512  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  52.78 
 
 
291 aa  280  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1907  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  54.11 
 
 
290 aa  280  2e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.60651  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4482  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  58.76 
 
 
291 aa  280  3e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.217481  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1833  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  59.25 
 
 
296 aa  277  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6083  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  54.42 
 
 
281 aa  276  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.662698  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1575  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  49.83 
 
 
298 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.880265  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0223  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  48.97 
 
 
296 aa  261  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1682  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  48.14 
 
 
300 aa  260  2e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18140  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  49.83 
 
 
298 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001550  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  45.48 
 
 
301 aa  258  8e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0768  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  49.49 
 
 
295 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0690  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  49.32 
 
 
295 aa  256  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05487  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  45.15 
 
 
301 aa  256  3e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1809  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  50.85 
 
 
295 aa  256  3e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4666  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  49.83 
 
 
295 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.534341  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4530  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  49.83 
 
 
295 aa  255  5e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0233897  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0696  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  50 
 
 
295 aa  255  6e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0783  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  50 
 
 
296 aa  255  8e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4664  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  49.49 
 
 
295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128162  normal  0.386359 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0297  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  46.64 
 
 
309 aa  253  2.0000000000000002e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3575  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  47.26 
 
 
297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2005  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  50.17 
 
 
295 aa  251  8.000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.848417  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1800  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  48.45 
 
 
298 aa  250  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02850  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  52.03 
 
 
305 aa  250  2e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1148  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  46.28 
 
 
297 aa  249  3e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1672  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  48.32 
 
 
299 aa  248  7e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.715505  hitchhiker  0.000314937 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2778  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  47.84 
 
 
309 aa  248  8e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.104386  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5647  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  50.34 
 
 
304 aa  248  9e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373454  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1402  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  49.49 
 
 
300 aa  248  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4931  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  43.64 
 
 
293 aa  247  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.684033  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1500  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  48.82 
 
 
300 aa  246  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1530  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  48.82 
 
 
300 aa  246  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1494  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  48.82 
 
 
300 aa  246  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2851  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  48.82 
 
 
300 aa  246  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000128399 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1018  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  45.95 
 
 
297 aa  246  3e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5958  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  45.89 
 
 
293 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.564119  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2181  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  48.11 
 
 
298 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0921  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  48.11 
 
 
298 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0829  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  48.11 
 
 
298 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.601203  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0245  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  48.8 
 
 
298 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1087  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  50 
 
 
301 aa  245  8e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.27752  decreased coverage  0.00698053 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5129  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  48.12 
 
 
297 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.468786 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1380  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  49.15 
 
 
301 aa  243  3e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0240977 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2471  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  47.49 
 
 
300 aa  243  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  decreased coverage  0.00450242 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1557  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  48.82 
 
 
298 aa  242  5e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.734948  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0904  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  47.1 
 
 
321 aa  242  6e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.482151 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4089  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  49.32 
 
 
297 aa  241  7.999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  0.24894 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3976  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  49.32 
 
 
297 aa  241  7.999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3424  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  48.3 
 
 
296 aa  241  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0751599  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000370  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  45.08 
 
 
298 aa  241  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.81552  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0951  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  47.28 
 
 
306 aa  241  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.012671  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4259  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  47.62 
 
 
297 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.597  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2592  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  49.15 
 
 
300 aa  240  2e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101214 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2659  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  49.15 
 
 
300 aa  240  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0234954  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1343  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  47.65 
 
 
299 aa  240  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.383496  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>