77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2676 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2676  Phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding, putative  100 
 
 		 262 aa  505  9.999999999999999e-143  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.607685  normal  0.076232 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0198  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  55.38 
 
 		 261 aa  235  6e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4024  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  47.45 
 
 		 263 aa  215  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0632878 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2243  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  47.64 
 
 		 262 aa  178  7e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2089  phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  36.47 
 
 		 295 aa  151  8e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.891235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0096  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  39.69 
 
 		 259 aa  137  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1455  phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  31.92 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1359  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  32.31 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.234079  normal  0.110922 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0875  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  33.7 
 
 		 309 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.651472  normal  0.39983 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2699  dehydrogenase  32.96 
 
 		 312 aa  122  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.647846  normal  0.600019 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3634  phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding,-like protein  32.21 
 
 		 313 aa  119  4.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.75811 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5180  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  31.85 
 
 		 309 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  40 
 
 		 450 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1049  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  31.39 
 
 		 294 aa  112  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0780774  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0336  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  31 
 
 		 308 aa  112  9e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2716  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  33.33 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1079  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  32.35 
 
 		 300 aa  105  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5621  phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  32.68 
 
 		 304 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.786606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8322  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  33.07 
 
 		 304 aa  102  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0469353  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1610  NAD-binding phsophogluconase dehydrogenase-like protein  35.06 
 
 		 288 aa  102  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2165  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  33.01 
 
 		 299 aa  101  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.328451  normal  0.0994663 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5740  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  35.48 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8622  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  32.48 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.489612  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4139  phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  32.28 
 
 		 302 aa  99  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.847041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7576  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  34.9 
 
 		 298 aa  96.3  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2815  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  32.31 
 
 		 277 aa  95.1  9e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.256633  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0601  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  33.2 
 
 		 288 aa  94  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0286951  normal  0.472195 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3257  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  32.78 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00764055  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4075  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  28.8 
 
 		 299 aa  79  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3786  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  30.68 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.622459  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4431  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  32.85 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.182897  normal  0.586464 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1453  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  29.73 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1394  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  26.39 
 
 		 296 aa  52.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1078  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  37.63 
 
 		 290 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0733755 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1062  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  37.63 
 
 		 290 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0295  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  30 
 
 		 280 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1089  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  37.63 
 
 		 290 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0903415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8654  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  30.48 
 
 		 295 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3900  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  31.62 
 
 		 289 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3068  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  29.27 
 
 		 289 aa  50.4  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1952  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  25.18 
 
 		 289 aa  50.4  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1314  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  27.14 
 
 		 296 aa  48.9  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.848516  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1538  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  30.91 
 
 		 292 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.876944  normal  0.439831 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2354  putative dehydrogenase  30.86 
 
 		 291 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0342021 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2443  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase related protein  26.64 
 
 		 289 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1276  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35.48 
 
 		 296 aa  47.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.476211  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1870  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  27.03 
 
 		 296 aa  47  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9609  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  26.17 
 
 		 288 aa  47.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2461  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  27.54 
 
 		 291 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.243113  hitchhiker  0.00729445 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2197  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  25.96 
 
 		 290 aa  46.2  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206144  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1789  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  25.65 
 
 		 297 aa  46.2  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6188  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  29.3 
 
 		 282 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.465928  normal  0.388125 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4321  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  29.61 
 
 		 306 aa  46.2  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.161633 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2413  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  26.39 
 
 		 289 aa  45.8  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6367  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  30.99 
 
 		 288 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.707828  normal  0.820897 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2122  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  28.71 
 
 		 295 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.337883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2554  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  27.05 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0333948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2391  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  27.05 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.633873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1817  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  25.28 
 
 		 297 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22120  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  27.45 
 
 		 296 aa  43.9  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.218091 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2221  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  27.85 
 
 		 297 aa  43.9  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1101  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  24.62 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3782  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  28.57 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1880  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  25.28 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109553  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1308  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.33 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.258741  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6199  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  25.28 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0390445  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3056  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35.87 
 
 		 291 aa  43.5  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.76812 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5187  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  26.39 
 
 		 297 aa  43.5  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0325788 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2556  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  29.13 
 
 		 299 aa  43.5  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5180  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  25.28 
 
 		 297 aa  43.5  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.312851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5720  oxidoredutase  26.37 
 
 		 290 aa  42.7  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132132  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1903  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  24.91 
 
 		 297 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00006568 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3299  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  28.35 
 
 		 295 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.241837  normal  0.0981124 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3091  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  29.91 
 
 		 295 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.207365 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2478  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  28.77 
 
 		 303 aa  42.7  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.085362 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00780  hypothetical protein  28.89 
 
 		 605 aa  42.4  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2568  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  27.18 
 
 		 291 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.138617  hitchhiker  0.00176659 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>