More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1453 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1453  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  100 
 
 
296 aa  602  1.0000000000000001e-171  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2160  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  48.25 
 
 
296 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0547551  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2454  putative 2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  48.25 
 
 
296 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.256523  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2192  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  48.25 
 
 
296 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2129  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  48.25 
 
 
296 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0387103  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2115  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  48.25 
 
 
296 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2319  putative 2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  47.55 
 
 
296 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2353  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  48.25 
 
 
296 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2372  putative 2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  48.25 
 
 
296 aa  281  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2381  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  47.55 
 
 
296 aa  279  3e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101359  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3005  putative 2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  47.2 
 
 
296 aa  279  3e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.328852 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1728  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  44.76 
 
 
296 aa  263  3e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2161  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  37.14 
 
 
299 aa  179  4.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387864 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2614  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.15 
 
 
300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4931  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  38.91 
 
 
293 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.684033  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1917  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  33.56 
 
 
298 aa  172  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.036098  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6528  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.81 
 
 
297 aa  169  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186276  normal  0.100696 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2852  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.08 
 
 
297 aa  168  9e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0134215  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1632  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.8 
 
 
303 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4460  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.54 
 
 
294 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5561  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  39.64 
 
 
283 aa  166  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.560852  normal  0.0590725 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02990  tartronate semialdehyde reductase  34.98 
 
 
296 aa  165  8e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0580  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.98 
 
 
296 aa  165  8e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02941  hypothetical protein  34.98 
 
 
296 aa  165  8e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0575  tartronate semialdehyde reductase  34.98 
 
 
296 aa  165  8e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3379  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.99 
 
 
291 aa  165  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0410434 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4437  tartronate semialdehyde reductase  34.98 
 
 
294 aa  165  9e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.211957 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3420  tartronate semialdehyde reductase  34.98 
 
 
294 aa  165  9e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3603  tartronate semialdehyde reductase  34.98 
 
 
294 aa  165  9e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3314  tartronate semialdehyde reductase  34.98 
 
 
294 aa  165  9e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3233  tartronate semialdehyde reductase  34.98 
 
 
294 aa  165  9e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1714  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.07 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.280932  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3546  tartronate semialdehyde reductase  33.92 
 
 
296 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.370176  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0297  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  36.11 
 
 
309 aa  163  3e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0566  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.17 
 
 
292 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3510  tartronate semialdehyde reductase  33.92 
 
 
296 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1173  tartronate semialdehyde reductase  33.57 
 
 
296 aa  163  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0573  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.17 
 
 
292 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3438  tartronate semialdehyde reductase  33.92 
 
 
296 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0568  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.17 
 
 
292 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3441  tartronate semialdehyde reductase  33.92 
 
 
296 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3607  tartronate semialdehyde reductase  33.92 
 
 
296 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  0.959534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1409  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.62 
 
 
284 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0135816  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0627  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.17 
 
 
292 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2171  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.67 
 
 
301 aa  162  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.611002  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0845  tartronate semialdehyde reductase  37.19 
 
 
294 aa  160  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2426  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38 
 
 
301 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2301  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38 
 
 
301 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2156  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.24 
 
 
299 aa  160  3e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.501348 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0693  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  34.48 
 
 
305 aa  160  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.682361  normal  0.0958689 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2369  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.62 
 
 
292 aa  160  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1789  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.64 
 
 
297 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3089  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.74 
 
 
297 aa  159  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2261  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.67 
 
 
301 aa  159  7e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.35206  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2547  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.28 
 
 
294 aa  159  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0672659  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0811  tartronate semialdehyde reductase  36.14 
 
 
294 aa  159  8e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00459  tartronate semialdehyde reductase, NADH-dependent  34.13 
 
 
292 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3782  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  36.84 
 
 
297 aa  157  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1622  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.11 
 
 
302 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438237  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00464  hypothetical protein  34.13 
 
 
292 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4826  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  35.86 
 
 
294 aa  158  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.263062 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7094  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.64 
 
 
293 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444897  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1817  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.3 
 
 
297 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3103  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.13 
 
 
292 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4859  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.76 
 
 
297 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.748222  normal  0.158599 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0583  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.13 
 
 
292 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2366  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.27 
 
 
301 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0610  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.47 
 
 
292 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0546  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.13 
 
 
292 aa  157  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0209  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  33.69 
 
 
294 aa  157  2e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3113  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.13 
 
 
292 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.327741 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0223  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35.02 
 
 
296 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0552  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.13 
 
 
292 aa  156  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0594  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.47 
 
 
299 aa  156  4e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.84188  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0172  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.47 
 
 
309 aa  156  4e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.798657  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1780  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.77 
 
 
302 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2462  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.64 
 
 
302 aa  155  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.394551  normal  0.60461 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5958  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.02 
 
 
293 aa  155  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.564119  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2389  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  32.27 
 
 
289 aa  155  1e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2177  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35 
 
 
296 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.279609  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5180  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.62 
 
 
297 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.312851  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1903  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.96 
 
 
297 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00006568 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1600  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.18 
 
 
293 aa  154  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.36162  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5498  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  36.76 
 
 
291 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0926622  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6199  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.62 
 
 
297 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0390445  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1880  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.62 
 
 
297 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109553  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2048  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  33.81 
 
 
289 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3450  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.67 
 
 
307 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0142  hypothetical protein  31.03 
 
 
298 aa  152  4e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1394  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.62 
 
 
296 aa  152  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125188  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3102  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.27 
 
 
293 aa  153  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2525  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35.4 
 
 
295 aa  153  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.927103  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5012  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  31.1 
 
 
314 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.209504  normal  0.339163 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1933  oxidoreductase protein  34.39 
 
 
290 aa  152  7e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.508408  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3126  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.75 
 
 
300 aa  152  7e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0554322 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2145  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.6 
 
 
293 aa  152  8e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27951  putative 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.77 
 
 
301 aa  152  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3343  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  32.99 
 
 
303 aa  152  8.999999999999999e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3567  tartronate semialdehyde reductase  33.68 
 
 
296 aa  151  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.795052 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2556  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.56 
 
 
299 aa  151  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>