94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0875 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0875  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  100 
 
 		 309 aa  624  1e-178  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.651472  normal  0.39983 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5180  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  85.76 
 
 		 309 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2699  dehydrogenase  80.87 
 
 		 312 aa  482  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.647846  normal  0.600019 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0336  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  75.57 
 
 		 308 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3634  phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding,-like protein  75.91 
 
 		 313 aa  461  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.75811 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2165  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  56.77 
 
 		 299 aa  301  9e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.328451  normal  0.0994663 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5740  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  54.7 
 
 		 301 aa  275  6e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2089  phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  46.77 
 
 		 295 aa  225  7e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.891235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1359  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  44.07 
 
 		 296 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.234079  normal  0.110922 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1455  phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  47.13 
 
 		 298 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7576  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  46.49 
 
 		 298 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1079  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  37.69 
 
 		 300 aa  171  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1049  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  35.74 
 
 		 294 aa  165  6.9999999999999995e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0780774  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8622  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  34.67 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.489612  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4139  phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  34.93 
 
 		 302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.847041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2815  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  37.45 
 
 		 277 aa  136  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.256633  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2716  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  33.58 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8322  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  33.82 
 
 		 304 aa  129  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0469353  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5621  phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  33.96 
 
 		 304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.786606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2676  Phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding, putative  33.7 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.607685  normal  0.076232 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1610  NAD-binding phsophogluconase dehydrogenase-like protein  34.7 
 
 		 288 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4024  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  30.27 
 
 		 263 aa  112  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0632878 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3786  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  31.72 
 
 		 293 aa  106  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.622459  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3257  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  32.84 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00764055  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.22 
 
 		 450 aa  91.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0198  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  28.74 
 
 		 261 aa  90.1  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0096  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  32.18 
 
 		 259 aa  85.9  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0601  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  29.28 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0286951  normal  0.472195 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2243  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  29.63 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2354  putative dehydrogenase  29.63 
 
 		 291 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0342021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4431  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  30.15 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.182897  normal  0.586464 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4075  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  25.74 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0985  putative dehydrogenase  67.44 
 
 		 70 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0851571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0261  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  30.73 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0646517 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5535  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  27.23 
 
 		 300 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5899  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  27.23 
 
 		 300 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.702285 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3294  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  30.33 
 
 		 286 aa  53.9  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.738468  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6528  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  27.12 
 
 		 297 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186276  normal  0.100696 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2547  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  24.66 
 
 		 286 aa  53.1  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0364167 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6188  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  26.88 
 
 		 282 aa  53.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.465928  normal  0.388125 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0430  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  26.7 
 
 		 303 aa  50.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2048  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  25.85 
 
 		 289 aa  51.2  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1173  tartronate semialdehyde reductase  25.29 
 
 		 296 aa  50.8  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5146  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.17 
 
 		 307 aa  49.7  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.74741  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6367  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  25.67 
 
 		 288 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.707828  normal  0.820897 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2614  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  22.49 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2565  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  26.32 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0395853  normal  0.0235882 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2077  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  24.38 
 
 		 285 aa  48.1  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3551  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  25.59 
 
 		 292 aa  47.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000115044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1923  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  31.2 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238794  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3659  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  24.57 
 
 		 299 aa  47  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.881887 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3990  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  25.73 
 
 		 303 aa  46.6  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4931  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  23.11 
 
 		 293 aa  47  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.684033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2626  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.79 
 
 		 299 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.180751 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1759  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  24.55 
 
 		 289 aa  46.2  0.0007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.271447 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0142  hypothetical protein  24.15 
 
 		 298 aa  46.2  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3407  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  23.71 
 
 		 299 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.373946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4960  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  23.71 
 
 		 299 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.247948 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5326  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  23.71 
 
 		 299 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.012022  normal  0.0232804 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4382  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  23.81 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.128 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1857  3-hydroxyacid dehydrogenase  28.24 
 
 		 288 aa  45.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.341144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0979  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  26.53 
 
 		 315 aa  45.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103843  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3456  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  33.98 
 
 		 291 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.236209  normal  0.0188789 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3343  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  25.6 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1650  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  28.75 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.345161  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0127  hypothetical protein  23.67 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0717  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  23.28 
 
 		 299 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396436  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3543  prephenate dehydrogenase  28.23 
 
 		 254 aa  45.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.372854 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3190  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  24.06 
 
 		 300 aa  45.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.492054  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1676  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  28.75 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4160  hypothetical protein  27.08 
 
 		 272 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.911147 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0629  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  28.75 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.650188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5650  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  28.75 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.328069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4901  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  23.81 
 
 		 300 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0315002  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1701  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  28.75 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0870756  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0547  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  28.75 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0536  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  28.75 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.732452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1631  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  28.23 
 
 		 300 aa  44.3  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.586989 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3293  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  25.81 
 
 		 306 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3943  prephenate dehydrogenase  30.28 
 
 		 281 aa  43.9  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28220  phosphoglycerate dehydrogenase-like oxidoreductase  28.67 
 
 		 304 aa  44.3  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.475813  normal  0.417337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7094  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  27.51 
 
 		 293 aa  44.3  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444897  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5116  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  31.54 
 
 		 297 aa  44.3  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.528779 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1097  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  23.49 
 
 		 295 aa  44.3  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5958  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  25.54 
 
 		 293 aa  43.9  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.564119  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2413  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  27.23 
 
 		 289 aa  43.5  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1427  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.95 
 
 		 297 aa  43.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.204694  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3450  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  25.81 
 
 		 307 aa  43.1  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4518  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  26.56 
 
 		 308 aa  42.7  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.431597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1907  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  23.81 
 
 		 301 aa  42.7  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00339906  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21180  putative 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  27.96 
 
 		 296 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.542348 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1825  hypothetical protein  23.94 
 
 		 284 aa  42.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1800  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  22.41 
 
 		 298 aa  42.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4985  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  27.96 
 
 		 289 aa  42.4  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.888648  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>