More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5650 on replicon NC_008703
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1650  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  100 
 
 
292 aa  585  1e-166  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.345161  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1676  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  100 
 
 
292 aa  585  1e-166  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1701  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  100 
 
 
292 aa  585  1e-166  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0870756  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5650  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  100 
 
 
292 aa  585  1e-166  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.328069  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0536  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  99.32 
 
 
297 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.732452  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0547  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  99.32 
 
 
292 aa  581  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307384  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0629  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  99.32 
 
 
292 aa  581  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.650188  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5447  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  97.21 
 
 
287 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5844  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  97.21 
 
 
287 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4350  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  42.96 
 
 
297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02990  tartronate semialdehyde reductase  37.07 
 
 
296 aa  119  6e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0580  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.07 
 
 
296 aa  119  6e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3603  tartronate semialdehyde reductase  37.07 
 
 
294 aa  119  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02941  hypothetical protein  37.07 
 
 
296 aa  119  6e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0575  tartronate semialdehyde reductase  37.07 
 
 
296 aa  119  6e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4437  tartronate semialdehyde reductase  37.07 
 
 
294 aa  119  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.211957 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3233  tartronate semialdehyde reductase  37.07 
 
 
294 aa  119  6e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3314  tartronate semialdehyde reductase  37.07 
 
 
294 aa  119  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3420  tartronate semialdehyde reductase  37.07 
 
 
294 aa  119  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3546  tartronate semialdehyde reductase  37.07 
 
 
296 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.370176  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3510  tartronate semialdehyde reductase  37.07 
 
 
296 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3607  tartronate semialdehyde reductase  37.07 
 
 
296 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  0.959534 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3438  tartronate semialdehyde reductase  37.07 
 
 
296 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3441  tartronate semialdehyde reductase  37.07 
 
 
296 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1173  tartronate semialdehyde reductase  37.07 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2366  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.71 
 
 
301 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2161  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.76 
 
 
299 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387864 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1800  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  36.19 
 
 
298 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4901  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35.94 
 
 
300 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0315002  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2181  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35.71 
 
 
298 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3659  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35.71 
 
 
299 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.881887 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2614  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.12 
 
 
300 aa  104  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0921  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35.71 
 
 
298 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0829  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35.71 
 
 
298 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.601203  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0717  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35.48 
 
 
299 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396436  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4382  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35.94 
 
 
300 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.128 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5326  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35.48 
 
 
299 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.012022  normal  0.0232804 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3407  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35.48 
 
 
299 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.373946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4960  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35.48 
 
 
299 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.247948 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3567  tartronate semialdehyde reductase  37.56 
 
 
296 aa  102  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.795052 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4985  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  34.25 
 
 
289 aa  102  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.888648  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4089  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.81 
 
 
297 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  0.24894 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3976  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.81 
 
 
297 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1575  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  31.38 
 
 
298 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.880265  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0924  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  31.67 
 
 
288 aa  99.4  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18140  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  30.96 
 
 
298 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1917  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  29.62 
 
 
298 aa  98.6  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.036098  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1371  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  31.8 
 
 
307 aa  97.4  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.506801  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0142  hypothetical protein  30.66 
 
 
298 aa  97.4  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0127  hypothetical protein  30.66 
 
 
298 aa  97.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000370  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  28.12 
 
 
298 aa  97.1  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.81552  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5846  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  35 
 
 
290 aa  96.3  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.704339  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4931  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.54 
 
 
293 aa  96.3  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.684033  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2821  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  32.82 
 
 
289 aa  96.3  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3369  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  31.34 
 
 
303 aa  95.9  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00318158  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3575  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.18 
 
 
297 aa  95.9  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4300  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase family  31.05 
 
 
298 aa  95.5  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4411  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase family protein  31.05 
 
 
298 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2369  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  31.08 
 
 
292 aa  95.1  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4530  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  31.43 
 
 
295 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0233897  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4255  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase family  31.05 
 
 
298 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4346  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase family  31.05 
 
 
298 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.62907  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4423  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  37.5 
 
 
296 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5958  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  31.43 
 
 
293 aa  94.7  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.564119  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2197  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  28.63 
 
 
290 aa  94.7  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206144  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0768  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  30.95 
 
 
295 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.600561 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4104  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  30.45 
 
 
298 aa  94  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4666  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  30.95 
 
 
295 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.534341  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5129  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  29.05 
 
 
297 aa  94  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.468786 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4405  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  30.45 
 
 
298 aa  94  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0696  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  31.9 
 
 
295 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0245  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  31.98 
 
 
298 aa  93.2  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03767  predicted oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  30.45 
 
 
298 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3393  tartronate semialdehyde reductase  32.97 
 
 
294 aa  92.8  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0632  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35.56 
 
 
319 aa  92.8  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03716  hypothetical protein  30.45 
 
 
298 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5647  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.86 
 
 
304 aa  92.4  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373454  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0845  tartronate semialdehyde reductase  32.62 
 
 
294 aa  92.4  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5648  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  33.62 
 
 
290 aa  92.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.390544 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1372  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase family protein  30.92 
 
 
286 aa  92.4  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.90333  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5931  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.86 
 
 
296 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5329  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase family protein  30 
 
 
298 aa  91.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0811  tartronate semialdehyde reductase  32.26 
 
 
294 aa  92  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1087  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.38 
 
 
301 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.27752  decreased coverage  0.00698053 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4664  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  30.48 
 
 
295 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128162  normal  0.386359 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3712  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  34.09 
 
 
290 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4656  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  34.09 
 
 
290 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.990326  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4267  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  30 
 
 
298 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3011  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  27.42 
 
 
287 aa  91.3  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000101253  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5899  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  32.37 
 
 
300 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.702285 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5535  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  32.37 
 
 
300 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1923  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  27.27 
 
 
296 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238794  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2159  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  29.33 
 
 
308 aa  91.3  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0649  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  34.52 
 
 
298 aa  90.9  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1968  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  30.95 
 
 
298 aa  90.1  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4259  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  31.9 
 
 
297 aa  90.1  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.597  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2172  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.08 
 
 
302 aa  90.1  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496514  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1938  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  28.9 
 
 
306 aa  90.1  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0381  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  25.46 
 
 
287 aa  90.1  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3379  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  32.35 
 
 
291 aa  89.7  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0410434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>