More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2161 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2161  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  100 
 
 
299 aa  604  9.999999999999999e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387864 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3438  tartronate semialdehyde reductase  43.05 
 
 
296 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3607  tartronate semialdehyde reductase  43.05 
 
 
296 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  0.959534 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3441  tartronate semialdehyde reductase  43.05 
 
 
296 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3510  tartronate semialdehyde reductase  43.05 
 
 
296 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3546  tartronate semialdehyde reductase  43.05 
 
 
296 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.370176  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02990  tartronate semialdehyde reductase  42.03 
 
 
296 aa  237  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0580  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.03 
 
 
296 aa  237  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02941  hypothetical protein  42.03 
 
 
296 aa  237  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0575  tartronate semialdehyde reductase  42.03 
 
 
296 aa  237  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3314  tartronate semialdehyde reductase  42.03 
 
 
294 aa  236  3e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4437  tartronate semialdehyde reductase  42.03 
 
 
294 aa  236  3e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.211957 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3603  tartronate semialdehyde reductase  42.03 
 
 
294 aa  236  3e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3420  tartronate semialdehyde reductase  42.03 
 
 
294 aa  236  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3233  tartronate semialdehyde reductase  42.03 
 
 
294 aa  236  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1173  tartronate semialdehyde reductase  41.08 
 
 
296 aa  228  7e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0845  tartronate semialdehyde reductase  42.03 
 
 
294 aa  228  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3567  tartronate semialdehyde reductase  43.73 
 
 
296 aa  228  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.795052 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1714  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.64 
 
 
309 aa  225  6e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.280932  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2852  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.97 
 
 
297 aa  224  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0134215  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0811  tartronate semialdehyde reductase  41.02 
 
 
294 aa  224  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1923  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.33 
 
 
296 aa  224  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238794  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0972  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  39.24 
 
 
303 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.312001  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3393  tartronate semialdehyde reductase  41.36 
 
 
294 aa  218  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3343  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  36.99 
 
 
303 aa  218  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0261  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  36.64 
 
 
305 aa  217  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0646517 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5958  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  39.93 
 
 
293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.564119  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3990  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  36.7 
 
 
303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4931  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  39.93 
 
 
293 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.684033  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3553  tartronate semialdehyde reductase  40.68 
 
 
294 aa  211  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5793  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  37.63 
 
 
307 aa  209  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.056485  normal  0.139483 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3575  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  42.32 
 
 
297 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0245  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  41.44 
 
 
298 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2389  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  37.15 
 
 
289 aa  206  3e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4543  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  43.3 
 
 
296 aa  205  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0690  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  40.75 
 
 
295 aa  205  7e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4259  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  40.88 
 
 
297 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.597  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2927  tartronate semialdehyde reductase  38.64 
 
 
299 aa  203  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.378474 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0783  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  41.16 
 
 
296 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0223  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  40.83 
 
 
296 aa  204  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1728  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  38.08 
 
 
296 aa  204  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3479  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  42.81 
 
 
296 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000887479 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0297  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  41.94 
 
 
309 aa  203  3e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0768  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  40.48 
 
 
295 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4046  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  42.47 
 
 
296 aa  202  8e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0514793  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4320  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  42.47 
 
 
302 aa  201  9e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4530  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  40.48 
 
 
295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0233897  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2454  putative 2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.01 
 
 
296 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.256523  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4666  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  40.48 
 
 
295 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.534341  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4664  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  40.48 
 
 
295 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128162  normal  0.386359 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2381  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  36.65 
 
 
296 aa  199  6e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101359  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2614  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.68 
 
 
300 aa  198  7.999999999999999e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2372  putative 2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.3 
 
 
296 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1682  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  40.75 
 
 
300 aa  198  9e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2192  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.3 
 
 
296 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2129  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  36.3 
 
 
296 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0387103  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2115  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  36.3 
 
 
296 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2353  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.3 
 
 
296 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1968  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  36.95 
 
 
298 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5561  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.94 
 
 
283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.560852  normal  0.0590725 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4089  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  42.32 
 
 
297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  0.24894 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3976  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  42.32 
 
 
297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2160  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  36.3 
 
 
296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0547551  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5129  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  39.73 
 
 
297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.468786 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0209  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  36.64 
 
 
294 aa  196  4.0000000000000005e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3948  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  42.12 
 
 
296 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344524  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4382  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  41.02 
 
 
300 aa  195  9e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.128 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0696  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  41.84 
 
 
295 aa  194  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2034  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  42.81 
 
 
296 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.026377  normal  0.170516 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4901  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  41.02 
 
 
300 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0315002  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3126  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.15 
 
 
300 aa  193  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0554322 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001550  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  38.93 
 
 
301 aa  193  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3659  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  41.36 
 
 
299 aa  193  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.881887 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2319  putative 2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.3 
 
 
296 aa  193  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0904  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  41.64 
 
 
321 aa  193  3e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.482151 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10700  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  41.98 
 
 
297 aa  193  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.694075  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1800  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  36.84 
 
 
288 aa  193  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5326  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  40.68 
 
 
299 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.012022  normal  0.0232804 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0717  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  40.68 
 
 
299 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396436  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3407  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  40.68 
 
 
299 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.373946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4960  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  40.68 
 
 
299 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.247948 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4300  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase family  37.37 
 
 
298 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0649  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  43.15 
 
 
298 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4411  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase family protein  37.37 
 
 
298 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1917  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  35.45 
 
 
298 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.036098  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1800  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  42.12 
 
 
298 aa  190  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000370  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  40.75 
 
 
298 aa  190  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.81552  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4346  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase family  37.37 
 
 
298 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.62907  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4255  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase family  37.37 
 
 
298 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3253  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  41.08 
 
 
300 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.337633  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05487  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  38.26 
 
 
301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2130  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.95 
 
 
302 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424924  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0921  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  42.12 
 
 
298 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4859  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.54 
 
 
297 aa  189  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.748222  normal  0.158599 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2181  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  42.12 
 
 
298 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0829  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  42.12 
 
 
298 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.601203  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3441  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  42.47 
 
 
296 aa  189  7e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.065245 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3005  putative 2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.59 
 
 
296 aa  188  8e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.328852 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4233  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase family  37.01 
 
 
298 aa  188  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3379  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.55 
 
 
291 aa  188  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0410434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>