More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BT9727_2129 on replicon NC_005957
Organism: Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS2192  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  100 
 
 
296 aa  595  1e-169  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2129  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  100 
 
 
296 aa  595  1e-169  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0387103  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2115  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  100 
 
 
296 aa  595  1e-169  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2353  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  100 
 
 
296 aa  595  1e-169  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2454  putative 2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  98.99 
 
 
296 aa  590  1e-168  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.256523  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2372  putative 2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  99.32 
 
 
296 aa  592  1e-168  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2381  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  97.97 
 
 
296 aa  585  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101359  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2160  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  97.3 
 
 
296 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0547551  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2319  putative 2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  96.62 
 
 
296 aa  578  1e-164  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3005  putative 2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  95.95 
 
 
296 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.328852 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1728  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  86.15 
 
 
296 aa  526  1e-148  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1453  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  48.25 
 
 
296 aa  282  5.000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2161  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  36.3 
 
 
299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387864 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5958  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35.42 
 
 
293 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.564119  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2614  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.79 
 
 
300 aa  180  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1409  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.03 
 
 
284 aa  179  5.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0135816  normal  0.686311 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02990  tartronate semialdehyde reductase  34.83 
 
 
296 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0580  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.83 
 
 
296 aa  178  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3420  tartronate semialdehyde reductase  34.83 
 
 
294 aa  178  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3314  tartronate semialdehyde reductase  34.83 
 
 
294 aa  178  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4437  tartronate semialdehyde reductase  34.83 
 
 
294 aa  178  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.211957 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0575  tartronate semialdehyde reductase  34.83 
 
 
296 aa  178  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3233  tartronate semialdehyde reductase  34.83 
 
 
294 aa  178  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02941  hypothetical protein  34.83 
 
 
296 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3603  tartronate semialdehyde reductase  34.83 
 
 
294 aa  178  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3607  tartronate semialdehyde reductase  34.14 
 
 
296 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  0.959534 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3546  tartronate semialdehyde reductase  34.14 
 
 
296 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.370176  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3441  tartronate semialdehyde reductase  34.14 
 
 
296 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3438  tartronate semialdehyde reductase  34.14 
 
 
296 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3510  tartronate semialdehyde reductase  34.14 
 
 
296 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001550  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.9 
 
 
301 aa  176  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4931  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35.42 
 
 
293 aa  175  8e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.684033  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0924  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  36.59 
 
 
288 aa  175  8e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05487  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34 
 
 
301 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5060  oxidoreductase, acting on the CH-OH group of donors, NAD or NADP as acceptor  32.39 
 
 
301 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2852  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.14 
 
 
297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0134215  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0223  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.11 
 
 
296 aa  172  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000370  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35.14 
 
 
298 aa  172  5e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.81552  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0209  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  33.57 
 
 
294 aa  171  1e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0142  hypothetical protein  34.24 
 
 
298 aa  170  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0904  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.78 
 
 
321 aa  170  2e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.482151 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1714  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.79 
 
 
309 aa  170  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.280932  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0127  hypothetical protein  33.9 
 
 
298 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0466  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.39 
 
 
301 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2129  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35.4 
 
 
295 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0853416  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1800  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  35.19 
 
 
288 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1923  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.56 
 
 
296 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238794  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3379  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.4 
 
 
291 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0410434 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1809  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.58 
 
 
295 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1427  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.1 
 
 
297 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.204694  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0696  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35.15 
 
 
295 aa  166  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3126  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  32.62 
 
 
300 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0554322 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2005  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.58 
 
 
295 aa  165  8e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.848417  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3864  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.66 
 
 
297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0721878  normal  0.335239 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1570  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.66 
 
 
297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101448  normal  0.880113 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1513  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.45 
 
 
321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2391  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  32.3 
 
 
291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.633873  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18140  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.77 
 
 
298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1304  6-phosphogluconate dehydrogenase  32.32 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.305103  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1575  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.45 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.880265  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2600  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35.02 
 
 
299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00798756  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1343  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.78 
 
 
299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.383496  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1682  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  31.53 
 
 
300 aa  163  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4299  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.31 
 
 
297 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2771  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  32.29 
 
 
291 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4460  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.86 
 
 
294 aa  162  6e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0297  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.16 
 
 
309 aa  162  7e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1764  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  31.49 
 
 
291 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.113165  normal  0.438738 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0081  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.33 
 
 
292 aa  162  7e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.280871 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1721  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  31.49 
 
 
291 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00783731  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4729  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.64 
 
 
301 aa  162  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3690  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  32.06 
 
 
292 aa  162  7e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2554  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  32.29 
 
 
291 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0333948  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2568  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  31.49 
 
 
291 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.138617  hitchhiker  0.00176659 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5498  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  31.14 
 
 
291 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0926622  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3437  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  32.06 
 
 
292 aa  162  8.000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5931  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  30.63 
 
 
296 aa  162  9e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4173  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.21 
 
 
292 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000525805  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0811  tartronate semialdehyde reductase  32.86 
 
 
294 aa  161  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4259  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.83 
 
 
297 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.597  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1724  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  31.49 
 
 
291 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2547  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.69 
 
 
294 aa  161  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0672659  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1938  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.22 
 
 
306 aa  161  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1920  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  31.34 
 
 
296 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374769  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5846  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  33.33 
 
 
290 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.704339  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0577  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  30.99 
 
 
296 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1857  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  30.99 
 
 
296 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3567  tartronate semialdehyde reductase  33.1 
 
 
296 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.795052 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3624  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.39 
 
 
297 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2085  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  29.55 
 
 
308 aa  160  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2013  oxidoreductase YgbJ  30.99 
 
 
296 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.910127  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1587  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  31.49 
 
 
291 aa  160  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.169784  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0951  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.8 
 
 
306 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.012671  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0890  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  30.99 
 
 
296 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2461  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  31.94 
 
 
291 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.243113  hitchhiker  0.00729445 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2389  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  35.27 
 
 
289 aa  160  3e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4109  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.84 
 
 
292 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2741  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  35.19 
 
 
292 aa  160  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0379773  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5629  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  33.7 
 
 
290 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.865293  normal  0.0329981 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5648  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  33.33 
 
 
290 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.390544 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>