More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3126 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3126  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  100 
 
 
300 aa  595  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0554322 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2516  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  57.49 
 
 
292 aa  308  8e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3343  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  49.83 
 
 
303 aa  262  4.999999999999999e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3990  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  50 
 
 
303 aa  260  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0261  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  49.48 
 
 
305 aa  248  6e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0646517 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2614  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  47.04 
 
 
300 aa  238  8e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2852  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  45.55 
 
 
297 aa  238  9e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0134215  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1923  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  45.26 
 
 
296 aa  237  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238794  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3379  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  44.95 
 
 
291 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0410434 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5561  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  46.79 
 
 
283 aa  232  6e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.560852  normal  0.0590725 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0081  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  41.96 
 
 
292 aa  229  4e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.280871 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2389  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  40.7 
 
 
289 aa  228  1e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2369  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  44.91 
 
 
292 aa  228  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1714  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  44.15 
 
 
309 aa  227  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.280932  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3864  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  43.86 
 
 
297 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0721878  normal  0.335239 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43420  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  45.26 
 
 
296 aa  225  8e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.164862  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0958  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  43.16 
 
 
299 aa  225  8e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0924  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  40.43 
 
 
288 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1570  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  43.51 
 
 
297 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101448  normal  0.880113 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1159  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  47.37 
 
 
292 aa  223  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.997729  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2693  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  46.18 
 
 
294 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3153  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  44.41 
 
 
304 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.636013 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4299  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  43.51 
 
 
297 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0594  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.27 
 
 
299 aa  223  4e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.84188  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3624  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  43.51 
 
 
297 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3480  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  44.07 
 
 
304 aa  222  6e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2429  oxidoreductase protein  46.08 
 
 
298 aa  222  7e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3450  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  44.41 
 
 
307 aa  222  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2233  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  45.8 
 
 
294 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0172  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.56 
 
 
309 aa  220  3e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.798657  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4310  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  41.61 
 
 
294 aa  219  6e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0860064 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3283  transmembrane 2-hydroxy-3-oxopropionate reductase oxidoreductase protein  44.59 
 
 
303 aa  218  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2301  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  44.29 
 
 
301 aa  217  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2426  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  44.29 
 
 
301 aa  217  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7094  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  45.61 
 
 
293 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444897  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1394  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  44.14 
 
 
296 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125188  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1409  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  48.03 
 
 
284 aa  217  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0135816  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1777  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  46.39 
 
 
295 aa  217  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581987  normal  0.552551 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3293  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  43.39 
 
 
306 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6528  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  43.45 
 
 
297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186276  normal  0.100696 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2261  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  43.94 
 
 
301 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.35206  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2771  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  43.51 
 
 
296 aa  216  4e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0891841  normal  0.489794 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2171  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  43.6 
 
 
301 aa  216  4e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.611002  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1632  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  43.3 
 
 
303 aa  216  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4859  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  44.83 
 
 
297 aa  216  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.748222  normal  0.158599 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1800  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  39.72 
 
 
288 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2310  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  43.16 
 
 
294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.167544  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1789  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.95 
 
 
297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3089  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  43.01 
 
 
297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3690  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  43.75 
 
 
292 aa  213  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1817  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.62 
 
 
297 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0209  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  38.81 
 
 
294 aa  212  5.999999999999999e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4563  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.66 
 
 
309 aa  211  7.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.386042 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1297  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  44.91 
 
 
294 aa  211  9e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4864  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase GcxR  41.9 
 
 
295 aa  211  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.902474  normal  0.691773 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1500  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  41.58 
 
 
299 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.921564  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5180  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.52 
 
 
297 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.312851  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6199  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.86 
 
 
297 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0390445  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1880  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.86 
 
 
297 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109553  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4063  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.71 
 
 
293 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3784  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  36.71 
 
 
293 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.874704  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3799  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase; 6-phosphogluconate dehydrogenase  36.71 
 
 
293 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1903  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.96 
 
 
297 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00006568 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4460  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  41.81 
 
 
294 aa  210  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0460  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.81 
 
 
294 aa  210  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0485372  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3510  tartronate semialdehyde reductase  40.35 
 
 
296 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3438  tartronate semialdehyde reductase  40.35 
 
 
296 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3831  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.11 
 
 
296 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3607  tartronate semialdehyde reductase  40.35 
 
 
296 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  0.959534 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3441  tartronate semialdehyde reductase  40.35 
 
 
296 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45020  putative oxidoreductase  42.11 
 
 
296 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.820061  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3546  tartronate semialdehyde reductase  40.35 
 
 
296 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.370176  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1596  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  43.86 
 
 
297 aa  209  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00205037  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0555  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  47.42 
 
 
299 aa  209  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1173  tartronate semialdehyde reductase  40.42 
 
 
296 aa  209  5e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1318  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  41.13 
 
 
291 aa  209  5e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.676438  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4151  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.11 
 
 
292 aa  208  7e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4109  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.62 
 
 
292 aa  208  9e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1133  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  41.75 
 
 
301 aa  208  9e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.24797 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2119  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  45 
 
 
304 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0276919 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1087  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.11 
 
 
292 aa  208  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1780  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.36 
 
 
302 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02990  tartronate semialdehyde reductase  40.7 
 
 
296 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0580  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  40.7 
 
 
296 aa  207  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0575  tartronate semialdehyde reductase  40.7 
 
 
296 aa  207  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4437  tartronate semialdehyde reductase  40.7 
 
 
294 aa  207  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.211957 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3233  tartronate semialdehyde reductase  40.7 
 
 
294 aa  207  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3603  tartronate semialdehyde reductase  40.7 
 
 
294 aa  207  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3314  tartronate semialdehyde reductase  40.7 
 
 
294 aa  207  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3420  tartronate semialdehyde reductase  40.7 
 
 
294 aa  207  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4173  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.27 
 
 
292 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000525805  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02941  hypothetical protein  40.7 
 
 
296 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00459  tartronate semialdehyde reductase, NADH-dependent  41.05 
 
 
292 aa  206  5e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2462  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.36 
 
 
302 aa  206  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.394551  normal  0.60461 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00464  hypothetical protein  41.05 
 
 
292 aa  206  5e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0610  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  41.75 
 
 
292 aa  206  5e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3103  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  41.4 
 
 
292 aa  205  6e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3113  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  41.4 
 
 
292 aa  205  6e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.327741 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0546  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  41.4 
 
 
292 aa  205  6e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3437  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.01 
 
 
292 aa  205  6e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>