More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3437 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3437  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  100 
 
 
292 aa  571  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3690  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  94.52 
 
 
292 aa  541  1e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08160  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  73.01 
 
 
298 aa  427  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0245  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  70.85 
 
 
304 aa  398  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0555  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  61.94 
 
 
299 aa  339  2.9999999999999998e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0722  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  62.54 
 
 
296 aa  335  3.9999999999999995e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1265  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  61.51 
 
 
292 aa  320  3e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4729  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  54.14 
 
 
301 aa  272  4.0000000000000004e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5436  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  55.14 
 
 
305 aa  271  7e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5347  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  55.14 
 
 
305 aa  271  7e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224641  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5726  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  54.79 
 
 
305 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2146  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  49.66 
 
 
294 aa  266  2.9999999999999995e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2852  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  47.93 
 
 
297 aa  265  8.999999999999999e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0134215  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2547  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  54.79 
 
 
294 aa  261  8.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0672659  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1714  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  46.23 
 
 
309 aa  255  7e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.280932  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1923  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  45.33 
 
 
296 aa  253  3e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238794  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3560  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  47.77 
 
 
292 aa  252  4.0000000000000004e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.737632 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2614  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  46.02 
 
 
300 aa  249  4e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4460  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  45.14 
 
 
294 aa  242  6e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3379  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  43.75 
 
 
291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0410434 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3456  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  46.59 
 
 
291 aa  231  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.236209  normal  0.0188789 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3233  tartronate semialdehyde reductase  44.44 
 
 
294 aa  228  9e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3603  tartronate semialdehyde reductase  44.44 
 
 
294 aa  228  9e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4437  tartronate semialdehyde reductase  44.44 
 
 
294 aa  228  9e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.211957 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3314  tartronate semialdehyde reductase  44.44 
 
 
294 aa  228  9e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3420  tartronate semialdehyde reductase  44.44 
 
 
294 aa  228  9e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02990  tartronate semialdehyde reductase  44.44 
 
 
296 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0580  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  44.44 
 
 
296 aa  228  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02941  hypothetical protein  44.44 
 
 
296 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1933  oxidoreductase protein  43.55 
 
 
290 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.508408  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0575  tartronate semialdehyde reductase  44.44 
 
 
296 aa  228  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1159  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  43.45 
 
 
292 aa  228  1e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.997729  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1173  tartronate semialdehyde reductase  41.67 
 
 
296 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3546  tartronate semialdehyde reductase  43.88 
 
 
296 aa  225  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.370176  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3441  tartronate semialdehyde reductase  43.88 
 
 
296 aa  225  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3510  tartronate semialdehyde reductase  43.88 
 
 
296 aa  225  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3607  tartronate semialdehyde reductase  43.88 
 
 
296 aa  225  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  0.959534 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3438  tartronate semialdehyde reductase  43.88 
 
 
296 aa  225  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0081  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  40.42 
 
 
292 aa  225  9e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.280871 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1409  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  45.74 
 
 
284 aa  224  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0135816  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1777  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  44.86 
 
 
295 aa  222  7e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581987  normal  0.552551 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1297  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  43.25 
 
 
294 aa  221  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6528  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  43.69 
 
 
297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186276  normal  0.100696 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2171  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.91 
 
 
301 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.611002  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3089  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.51 
 
 
297 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2369  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  43.1 
 
 
292 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1600  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.81 
 
 
293 aa  219  6e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.36162  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2771  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  44.72 
 
 
296 aa  218  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0891841  normal  0.489794 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43420  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  43.82 
 
 
296 aa  217  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.164862  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1394  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  43.25 
 
 
296 aa  217  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125188  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2927  tartronate semialdehyde reductase  43.1 
 
 
299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.378474 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0172  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  39.86 
 
 
309 aa  216  4e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.798657  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3340  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent:6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  44.64 
 
 
287 aa  215  5.9999999999999996e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040559 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2301  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.91 
 
 
301 aa  215  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2426  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.91 
 
 
301 aa  215  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0958  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.31 
 
 
299 aa  214  9.999999999999999e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7094  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  43.06 
 
 
293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444897  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2261  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.56 
 
 
301 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.35206  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0811  tartronate semialdehyde reductase  40.91 
 
 
294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3102  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  43.11 
 
 
293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3567  tartronate semialdehyde reductase  43.53 
 
 
296 aa  213  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.795052 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5561  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  41.28 
 
 
283 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.560852  normal  0.0590725 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3990  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  42.21 
 
 
303 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1500  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.12 
 
 
299 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.921564  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0845  tartronate semialdehyde reductase  40.77 
 
 
294 aa  212  5.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1789  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.76 
 
 
297 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3295  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.71 
 
 
293 aa  211  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1780  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  43.16 
 
 
302 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3343  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  41.18 
 
 
303 aa  210  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0594  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  40.85 
 
 
299 aa  210  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.84188  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3393  tartronate semialdehyde reductase  42.65 
 
 
294 aa  209  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4629  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.4 
 
 
292 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0195507  hitchhiker  0.00760416 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4497  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.4 
 
 
292 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0494062  normal  0.295932 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2119  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  43.21 
 
 
304 aa  209  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0276919 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1817  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.4 
 
 
297 aa  209  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3831  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  41.7 
 
 
296 aa  209  5e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4563  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.57 
 
 
309 aa  209  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.386042 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45020  putative oxidoreductase  41.7 
 
 
296 aa  209  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.820061  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5180  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  41.87 
 
 
297 aa  209  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.312851  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1903  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.21 
 
 
297 aa  208  8e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00006568 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0566  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  41.13 
 
 
292 aa  208  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0568  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  41.13 
 
 
292 aa  208  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0573  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  41.13 
 
 
292 aa  208  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0627  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  41.13 
 
 
292 aa  208  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1622  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.76 
 
 
302 aa  208  9e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438237  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6199  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.21 
 
 
297 aa  208  9e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0390445  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1880  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.21 
 
 
297 aa  208  9e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109553  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4859  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.05 
 
 
297 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.748222  normal  0.158599 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3624  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  40.99 
 
 
297 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3339  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  41.96 
 
 
284 aa  206  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00384515 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1133  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  41.13 
 
 
301 aa  206  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.24797 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2462  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.11 
 
 
302 aa  206  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.394551  normal  0.60461 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1632  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  40.83 
 
 
303 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0460  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  40.07 
 
 
294 aa  206  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0485372  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4864  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase GcxR  41.13 
 
 
295 aa  206  5e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.902474  normal  0.691773 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4310  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.01 
 
 
294 aa  205  6e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0860064 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3126  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.01 
 
 
300 aa  205  6e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0554322 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00459  tartronate semialdehyde reductase, NADH-dependent  40.78 
 
 
292 aa  205  7e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00464  hypothetical protein  40.78 
 
 
292 aa  205  7e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2310  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.05 
 
 
294 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.167544  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>