More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1968 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1968  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  100 
 
 
298 aa  608  1e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1925  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  45.95 
 
 
301 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0659603 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2161  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  36.95 
 
 
299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387864 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0209  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  36.43 
 
 
294 aa  189  5e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2389  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  35.64 
 
 
289 aa  186  3e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1173  tartronate semialdehyde reductase  37.16 
 
 
296 aa  186  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0236  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  37.59 
 
 
284 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.355607  normal  0.156106 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2614  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.66 
 
 
300 aa  183  4.0000000000000006e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02990  tartronate semialdehyde reductase  34.01 
 
 
296 aa  182  7e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0580  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.01 
 
 
296 aa  182  7e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0575  tartronate semialdehyde reductase  34.01 
 
 
296 aa  182  7e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4437  tartronate semialdehyde reductase  34.01 
 
 
294 aa  182  7e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.211957 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3603  tartronate semialdehyde reductase  34.01 
 
 
294 aa  182  7e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3420  tartronate semialdehyde reductase  34.01 
 
 
294 aa  182  7e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3233  tartronate semialdehyde reductase  34.01 
 
 
294 aa  182  7e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3314  tartronate semialdehyde reductase  34.01 
 
 
294 aa  182  7e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02941  hypothetical protein  34.01 
 
 
296 aa  182  7e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3438  tartronate semialdehyde reductase  34.35 
 
 
296 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3441  tartronate semialdehyde reductase  34.35 
 
 
296 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3607  tartronate semialdehyde reductase  34.35 
 
 
296 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  0.959534 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3510  tartronate semialdehyde reductase  34.35 
 
 
296 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3546  tartronate semialdehyde reductase  34.35 
 
 
296 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.370176  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1923  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.62 
 
 
296 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238794  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0845  tartronate semialdehyde reductase  35.71 
 
 
294 aa  169  6e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1265  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  34.67 
 
 
284 aa  168  8e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.92382  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0699  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  39.17 
 
 
286 aa  167  2e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000621245 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0811  tartronate semialdehyde reductase  34.69 
 
 
294 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0210  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  34.31 
 
 
284 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.866351  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3567  tartronate semialdehyde reductase  34.69 
 
 
296 aa  166  4e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.795052 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2171  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  32.89 
 
 
301 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.611002  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3393  tartronate semialdehyde reductase  35.37 
 
 
294 aa  162  6e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4931  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.88 
 
 
293 aa  162  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.684033  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0972  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  36 
 
 
303 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.312001  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3379  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  32.98 
 
 
291 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0410434 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0594  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.12 
 
 
299 aa  161  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.84188  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1632  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.45 
 
 
303 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4460  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  31.54 
 
 
294 aa  159  5e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5793  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35.27 
 
 
307 aa  159  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.056485  normal  0.139483 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2130  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35.91 
 
 
302 aa  159  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424924  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3126  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.39 
 
 
300 aa  158  9e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0554322 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2301  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  31.99 
 
 
301 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2426  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  31.99 
 
 
301 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2927  tartronate semialdehyde reductase  32.66 
 
 
299 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.378474 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3216  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.69 
 
 
309 aa  157  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.969854  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1500  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.1 
 
 
299 aa  156  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.921564  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2261  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  31.65 
 
 
301 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.35206  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2852  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  32.4 
 
 
297 aa  155  6e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0134215  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0081  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.1 
 
 
292 aa  155  8e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.280871 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3102  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.8 
 
 
293 aa  155  8e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00459  tartronate semialdehyde reductase, NADH-dependent  34.04 
 
 
292 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00464  hypothetical protein  34.04 
 
 
292 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3103  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.04 
 
 
292 aa  154  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1933  oxidoreductase protein  32.06 
 
 
290 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.508408  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5561  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.45 
 
 
283 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.560852  normal  0.0590725 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0546  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.04 
 
 
292 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3113  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.04 
 
 
292 aa  154  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.327741 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6528  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.51 
 
 
297 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186276  normal  0.100696 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1600  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.15 
 
 
293 aa  154  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.36162  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1817  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  32.86 
 
 
297 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3553  tartronate semialdehyde reductase  35.37 
 
 
294 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0610  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.04 
 
 
292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1123  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  32.39 
 
 
299 aa  154  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.356226 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1714  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  31.97 
 
 
309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.280932  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0583  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.04 
 
 
292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0552  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.04 
 
 
292 aa  153  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4901  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  40.45 
 
 
300 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0315002  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3089  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.22 
 
 
297 aa  153  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4859  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.62 
 
 
297 aa  153  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.748222  normal  0.158599 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1622  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  32.11 
 
 
302 aa  153  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438237  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4382  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  40.45 
 
 
300 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.128 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0573  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.68 
 
 
292 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4518  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.53 
 
 
308 aa  152  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.431597  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0566  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.68 
 
 
292 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5180  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  32.86 
 
 
297 aa  152  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.312851  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0568  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.68 
 
 
292 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2119  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.91 
 
 
304 aa  152  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0276919 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1903  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  32.86 
 
 
297 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00006568 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0717  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  40.45 
 
 
299 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396436  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1394  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  32.51 
 
 
296 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125188  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6199  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  32.86 
 
 
297 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0390445  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1880  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  32.86 
 
 
297 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109553  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1789  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  32.51 
 
 
297 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0627  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.68 
 
 
292 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1903  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  30.53 
 
 
282 aa  151  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.25845  hitchhiker  0.00938968 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3407  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  40 
 
 
299 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.373946  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5326  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  40 
 
 
299 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.012022  normal  0.0232804 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4960  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  40 
 
 
299 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.247948 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1780  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  31.54 
 
 
302 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0958  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.11 
 
 
299 aa  151  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1800  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  34.6 
 
 
288 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4497  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.57 
 
 
292 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0494062  normal  0.295932 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4629  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.57 
 
 
292 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0195507  hitchhiker  0.00760416 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1503  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.08 
 
 
291 aa  150  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.385967  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2554  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  37.92 
 
 
291 aa  149  6e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0333948  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2462  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  31.82 
 
 
302 aa  149  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.394551  normal  0.60461 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3256  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.17 
 
 
309 aa  149  8e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.334656  normal  0.0657335 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43420  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  31.4 
 
 
296 aa  148  9e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.164862  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3153  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  32.88 
 
 
304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.636013 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3864  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  32.19 
 
 
297 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0721878  normal  0.335239 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2461  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  37.92 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.243113  hitchhiker  0.00729445 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>