More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1917 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1917  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  100 
 
 
298 aa  609  1e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.036098  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2366  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  70.61 
 
 
301 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1923  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  39.86 
 
 
296 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238794  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2161  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35.45 
 
 
299 aa  191  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387864 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3343  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  35.96 
 
 
303 aa  186  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3990  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  35.62 
 
 
303 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1714  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.24 
 
 
309 aa  179  4.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.280932  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2389  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  34.71 
 
 
289 aa  177  2e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0699  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  37.01 
 
 
286 aa  176  5e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000621245 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2741  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  40.08 
 
 
292 aa  175  9e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0379773  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1933  oxidoreductase protein  38.62 
 
 
290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.508408  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1453  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.56 
 
 
296 aa  172  5e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0081  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.93 
 
 
292 aa  171  9e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.280871 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1265  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  35.23 
 
 
284 aa  169  5e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.92382  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4109  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.84 
 
 
292 aa  169  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4173  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.43 
 
 
292 aa  169  7e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000525805  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1728  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.33 
 
 
296 aa  168  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4151  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  39.34 
 
 
292 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1087  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  39.34 
 
 
292 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0210  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  35.94 
 
 
284 aa  168  1e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.866351  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3784  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  38.52 
 
 
293 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.874704  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3799  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase; 6-phosphogluconate dehydrogenase  38.52 
 
 
293 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4063  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.52 
 
 
293 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2852  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.97 
 
 
297 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0134215  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0261  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  34.59 
 
 
305 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0646517 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0555  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.89 
 
 
299 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1318  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  38.52 
 
 
291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.676438  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2614  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.43 
 
 
300 aa  164  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0266  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase or related beta-hydroxyacid dehydrogenase  34.51 
 
 
289 aa  164  1.0000000000000001e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00389354  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3871  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  38.52 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2701  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.95 
 
 
292 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.295102  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2821  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  36.97 
 
 
289 aa  163  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2944  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.09 
 
 
309 aa  163  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.541427 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1934  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  35.64 
 
 
294 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0236  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  35.23 
 
 
284 aa  162  6e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.355607  normal  0.156106 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0722  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.84 
 
 
296 aa  161  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0594  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.13 
 
 
299 aa  161  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.84188  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0209  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  36.36 
 
 
294 aa  161  1e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3270  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  39.18 
 
 
298 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3196  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.95 
 
 
296 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00788547 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1173  tartronate semialdehyde reductase  34.92 
 
 
296 aa  159  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0981  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  37.45 
 
 
354 aa  159  6e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1800  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  39.51 
 
 
288 aa  159  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02990  tartronate semialdehyde reductase  36.03 
 
 
296 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0580  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.03 
 
 
296 aa  158  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3314  tartronate semialdehyde reductase  36.03 
 
 
294 aa  157  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3603  tartronate semialdehyde reductase  36.03 
 
 
294 aa  157  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02941  hypothetical protein  36.03 
 
 
296 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3420  tartronate semialdehyde reductase  36.03 
 
 
294 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3233  tartronate semialdehyde reductase  36.03 
 
 
294 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0575  tartronate semialdehyde reductase  36.03 
 
 
296 aa  158  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4437  tartronate semialdehyde reductase  36.03 
 
 
294 aa  157  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.211957 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3339  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  36.93 
 
 
284 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00384515 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0693  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  35.02 
 
 
305 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.682361  normal  0.0958689 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1251  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  40 
 
 
298 aa  157  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3690  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.4 
 
 
292 aa  156  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3441  tartronate semialdehyde reductase  35.35 
 
 
296 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3510  tartronate semialdehyde reductase  35.35 
 
 
296 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3607  tartronate semialdehyde reductase  35.35 
 
 
296 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  0.959534 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3546  tartronate semialdehyde reductase  35.35 
 
 
296 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.370176  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3438  tartronate semialdehyde reductase  35.35 
 
 
296 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3760  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.31 
 
 
293 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.814396  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0073  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.43 
 
 
300 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2487  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.71 
 
 
288 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1712  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.4 
 
 
298 aa  155  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.032164  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3624  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  31.74 
 
 
297 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1265  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.92 
 
 
292 aa  155  8e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4459  NADP oxidoreductase  35.4 
 
 
291 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00439637  normal  0.0523521 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2069  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase related enzyme  35.32 
 
 
287 aa  154  1e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0245  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.15 
 
 
304 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1632  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.56 
 
 
303 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0381  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  31.82 
 
 
287 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3864  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  32.09 
 
 
297 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0721878  normal  0.335239 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3437  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.04 
 
 
292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1570  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  31.42 
 
 
297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101448  normal  0.880113 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2381  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  31.96 
 
 
296 aa  153  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101359  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0115  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.53 
 
 
289 aa  153  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4299  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  31.08 
 
 
297 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4460  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  32.52 
 
 
294 aa  152  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2372  putative 2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  31.96 
 
 
296 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2192  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  31.96 
 
 
296 aa  152  7e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.901101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2129  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  31.96 
 
 
296 aa  152  7e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0387103  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2115  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  31.96 
 
 
296 aa  152  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0565  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  36.3 
 
 
297 aa  152  7e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.426217  normal  0.340404 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2353  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  31.96 
 
 
296 aa  152  7e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0627  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.45 
 
 
292 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3369  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  36.82 
 
 
303 aa  152  8.999999999999999e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00318158  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1333  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  34.38 
 
 
299 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000839454 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3831  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  32.54 
 
 
296 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2160  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  31.94 
 
 
296 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0547551  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2454  putative 2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  31.96 
 
 
296 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.256523  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45020  putative oxidoreductase  32.54 
 
 
296 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.820061  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43420  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  31.97 
 
 
296 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.164862  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1500  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.22 
 
 
299 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.921564  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2130  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.93 
 
 
302 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424924  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2233  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.45 
 
 
294 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1305  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.98 
 
 
299 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2319  putative 2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  31.14 
 
 
296 aa  151  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2391  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  33.33 
 
 
291 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.633873  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1143  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  36.73 
 
 
295 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.200546 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>