More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2701 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2701  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  100 
 
 
292 aa  586  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.295102  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2821  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  81.75 
 
 
289 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2233  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  71.68 
 
 
294 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2429  oxidoreductase protein  71.28 
 
 
298 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2693  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  70.28 
 
 
294 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3339  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  54.23 
 
 
284 aa  270  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00384515 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3294  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  52.11 
 
 
286 aa  265  8.999999999999999e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.738468  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1933  oxidoreductase protein  47.52 
 
 
290 aa  252  5.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.508408  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0081  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  44.88 
 
 
292 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.280871 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5561  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  44.68 
 
 
283 aa  234  9e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.560852  normal  0.0590725 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0594  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  43.46 
 
 
299 aa  231  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.84188  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1133  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  45.52 
 
 
301 aa  228  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.24797 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2614  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  43.86 
 
 
300 aa  227  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1394  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  43.9 
 
 
296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125188  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4460  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.61 
 
 
294 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1123  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  45.42 
 
 
299 aa  219  3.9999999999999997e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.356226 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0958  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  41.7 
 
 
299 aa  219  6e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1789  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  43.9 
 
 
297 aa  218  7e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1632  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.71 
 
 
303 aa  218  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3379  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.61 
 
 
291 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0410434 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3102  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  43.16 
 
 
293 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6206  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  46.67 
 
 
293 aa  215  5e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107985  normal  0.646779 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1500  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  41.61 
 
 
299 aa  215  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.921564  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1297  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.61 
 
 
294 aa  214  9e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1817  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  43.21 
 
 
297 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1923  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  40.49 
 
 
296 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238794  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2369  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.81 
 
 
292 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2426  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  43.86 
 
 
301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2261  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  43.86 
 
 
301 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.35206  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2171  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  44.21 
 
 
301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.611002  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2301  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  43.86 
 
 
301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4563  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.23 
 
 
309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.386042 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5180  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  43.06 
 
 
297 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.312851  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1903  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  43.21 
 
 
297 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00006568 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3089  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.46 
 
 
297 aa  211  9e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6199  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  43.21 
 
 
297 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0390445  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1880  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  43.21 
 
 
297 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109553  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3153  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.09 
 
 
304 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.636013 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0975  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  44.64 
 
 
299 aa  211  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.247687  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3343  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  41.67 
 
 
303 aa  210  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0957  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.71 
 
 
305 aa  210  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6528  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  41.2 
 
 
297 aa  209  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186276  normal  0.100696 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7094  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  43.51 
 
 
293 aa  209  6e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444897  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3295  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  45.94 
 
 
293 aa  208  7e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0693  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  39.64 
 
 
305 aa  208  7e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.682361  normal  0.0958689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1570  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  40.49 
 
 
297 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101448  normal  0.880113 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3480  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  41.75 
 
 
304 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4299  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  40.49 
 
 
297 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3864  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  39.79 
 
 
297 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0721878  normal  0.335239 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00459  tartronate semialdehyde reductase, NADH-dependent  41.7 
 
 
292 aa  206  4e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3607  tartronate semialdehyde reductase  41.01 
 
 
296 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  0.959534 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3510  tartronate semialdehyde reductase  41.01 
 
 
296 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3546  tartronate semialdehyde reductase  41.01 
 
 
296 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.370176  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3438  tartronate semialdehyde reductase  41.01 
 
 
296 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0610  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.05 
 
 
292 aa  206  4e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3624  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  39.79 
 
 
297 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00464  hypothetical protein  41.7 
 
 
292 aa  206  4e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3441  tartronate semialdehyde reductase  41.01 
 
 
296 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3103  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  41.7 
 
 
292 aa  206  5e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0546  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  41.7 
 
 
292 aa  206  5e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2119  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  41.5 
 
 
304 aa  206  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0276919 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3990  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  41.67 
 
 
303 aa  206  5e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3113  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  41.7 
 
 
292 aa  206  5e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.327741 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0583  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  41.7 
 
 
292 aa  205  6e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0172  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  40.27 
 
 
309 aa  204  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.798657  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2462  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  41.2 
 
 
302 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.394551  normal  0.60461 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0552  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  41.34 
 
 
292 aa  204  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3450  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  41.24 
 
 
307 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1600  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  41.11 
 
 
293 aa  204  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.36162  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02990  tartronate semialdehyde reductase  41.37 
 
 
296 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0580  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  41.37 
 
 
296 aa  204  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4437  tartronate semialdehyde reductase  41.37 
 
 
294 aa  204  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.211957 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3420  tartronate semialdehyde reductase  41.37 
 
 
294 aa  204  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3314  tartronate semialdehyde reductase  41.37 
 
 
294 aa  204  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3233  tartronate semialdehyde reductase  41.37 
 
 
294 aa  204  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3603  tartronate semialdehyde reductase  41.37 
 
 
294 aa  204  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2852  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.6 
 
 
297 aa  204  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0134215  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0575  tartronate semialdehyde reductase  41.37 
 
 
296 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1777  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.25 
 
 
295 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581987  normal  0.552551 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02941  hypothetical protein  41.37 
 
 
296 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1780  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  41.61 
 
 
302 aa  203  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3283  transmembrane 2-hydroxy-3-oxopropionate reductase oxidoreductase protein  42.18 
 
 
303 aa  202  5e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2391  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  42.25 
 
 
291 aa  202  5e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.633873  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4859  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  41.64 
 
 
297 aa  202  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.748222  normal  0.158599 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0568  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  40.99 
 
 
292 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0573  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  40.99 
 
 
292 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0566  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  40.99 
 
 
292 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3293  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  40.55 
 
 
306 aa  202  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4629  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.31 
 
 
292 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0195507  hitchhiker  0.00760416 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4497  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.31 
 
 
292 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0494062  normal  0.295932 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2554  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  41.75 
 
 
291 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0333948  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0627  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  40.64 
 
 
292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1622  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  41.9 
 
 
302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438237  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1587  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  42.46 
 
 
291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.169784  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4310  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  39.93 
 
 
294 aa  200  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0860064 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2461  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  41.9 
 
 
291 aa  200  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.243113  hitchhiker  0.00729445 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3944  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent:6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  41.9 
 
 
291 aa  199  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1159  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  41.11 
 
 
292 aa  198  7e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.997729  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2771  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  41.75 
 
 
291 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3956  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  40.67 
 
 
302 aa  198  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>