More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5447 on replicon NC_008147
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008147  Mmcs_5447  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  100 
 
 
287 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5844  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  100 
 
 
287 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1650  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  97.21 
 
 
292 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.345161  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1701  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  97.21 
 
 
292 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0870756  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1676  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  97.21 
 
 
292 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5650  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  97.21 
 
 
292 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.328069  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0629  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  96.52 
 
 
292 aa  558  1e-158  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.650188  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0547  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  96.52 
 
 
292 aa  558  1e-158  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307384  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0536  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  96.52 
 
 
297 aa  558  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.732452  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4350  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  44.04 
 
 
297 aa  202  6e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02990  tartronate semialdehyde reductase  35.27 
 
 
296 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0580  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.27 
 
 
296 aa  117  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3314  tartronate semialdehyde reductase  35.27 
 
 
294 aa  117  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3603  tartronate semialdehyde reductase  35.27 
 
 
294 aa  117  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4437  tartronate semialdehyde reductase  35.27 
 
 
294 aa  117  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.211957 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3420  tartronate semialdehyde reductase  35.27 
 
 
294 aa  117  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02941  hypothetical protein  35.27 
 
 
296 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0575  tartronate semialdehyde reductase  35.27 
 
 
296 aa  117  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3233  tartronate semialdehyde reductase  35.27 
 
 
294 aa  117  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3607  tartronate semialdehyde reductase  35.27 
 
 
296 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  0.959534 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3546  tartronate semialdehyde reductase  35.27 
 
 
296 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.370176  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3438  tartronate semialdehyde reductase  35.27 
 
 
296 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3441  tartronate semialdehyde reductase  35.27 
 
 
296 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3510  tartronate semialdehyde reductase  35.27 
 
 
296 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1173  tartronate semialdehyde reductase  35.98 
 
 
296 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2366  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.43 
 
 
301 aa  106  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2161  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.82 
 
 
299 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387864 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1800  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  36.71 
 
 
298 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2614  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.15 
 
 
300 aa  101  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2181  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  36.23 
 
 
298 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0829  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  36.23 
 
 
298 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.601203  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0921  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  36.23 
 
 
298 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3659  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35.75 
 
 
299 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.881887 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4901  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35.98 
 
 
300 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0315002  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3567  tartronate semialdehyde reductase  35.27 
 
 
296 aa  99.8  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.795052 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0717  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35.51 
 
 
299 aa  99.8  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396436  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3407  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35.51 
 
 
299 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.373946  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5326  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35.51 
 
 
299 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.012022  normal  0.0232804 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4960  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35.51 
 
 
299 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.247948 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4382  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35.98 
 
 
300 aa  99.4  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.128 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3976  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.3 
 
 
297 aa  97.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4089  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.3 
 
 
297 aa  97.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  0.24894 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2821  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  32.68 
 
 
289 aa  96.7  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1575  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  31.2 
 
 
298 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.880265  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0696  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.85 
 
 
295 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0924  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  31.02 
 
 
288 aa  94.7  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18140  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  30.77 
 
 
298 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4985  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  33.18 
 
 
289 aa  94  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.888648  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0142  hypothetical protein  29.95 
 
 
298 aa  93.2  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5129  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  29.47 
 
 
297 aa  93.2  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.468786 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1371  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  30.99 
 
 
307 aa  92.8  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.506801  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4255  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase family  31.46 
 
 
298 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4300  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase family  31.46 
 
 
298 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1917  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  28.79 
 
 
298 aa  93.2  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.036098  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4346  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase family  31.46 
 
 
298 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.62907  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4411  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase family protein  31.46 
 
 
298 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0127  hypothetical protein  29.95 
 
 
298 aa  92.8  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4931  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  31.88 
 
 
293 aa  92.4  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.684033  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4259  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  31.88 
 
 
297 aa  91.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.597  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2369  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.17 
 
 
292 aa  91.3  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5535  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  33 
 
 
300 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000370  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  27.89 
 
 
298 aa  92  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.81552  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5899  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  33 
 
 
300 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.702285 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4104  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  30.84 
 
 
298 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3393  tartronate semialdehyde reductase  33.09 
 
 
294 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3575  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.18 
 
 
297 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0632  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.98 
 
 
319 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4405  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  30.84 
 
 
298 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0845  tartronate semialdehyde reductase  32.85 
 
 
294 aa  90.9  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03767  predicted oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  30.84 
 
 
298 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0811  tartronate semialdehyde reductase  32.49 
 
 
294 aa  90.5  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5958  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  30.92 
 
 
293 aa  90.5  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.564119  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03716  hypothetical protein  30.84 
 
 
298 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3369  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  30.05 
 
 
303 aa  90.5  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00318158  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1372  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase family protein  30.2 
 
 
286 aa  90.1  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.90333  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2197  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  27.61 
 
 
290 aa  89.7  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206144  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4530  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  30.92 
 
 
295 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0233897  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0768  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  30.43 
 
 
295 aa  89  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3011  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  27.89 
 
 
287 aa  89  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000101253  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5329  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase family protein  30.37 
 
 
298 aa  89  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4423  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  36.63 
 
 
296 aa  89  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2701  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.42 
 
 
292 aa  89  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.295102  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4666  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  30.43 
 
 
295 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.534341  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0649  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase oxidoreductase protein  35.05 
 
 
298 aa  88.6  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0245  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  31.96 
 
 
298 aa  88.2  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4267  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  30.37 
 
 
298 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0430  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.63 
 
 
303 aa  88.2  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5647  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.85 
 
 
304 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373454  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5846  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  33.95 
 
 
290 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.704339  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4664  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  29.95 
 
 
295 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128162  normal  0.386359 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1087  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  32.37 
 
 
301 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.27752  decreased coverage  0.00698053 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3379  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  31.19 
 
 
291 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0410434 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2159  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  28.78 
 
 
308 aa  86.7  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1968  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  30.92 
 
 
298 aa  86.7  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0783  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  30.43 
 
 
296 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0690  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  29.95 
 
 
295 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5561  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  31.68 
 
 
283 aa  86.7  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.560852  normal  0.0590725 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1938  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  29.07 
 
 
306 aa  86.3  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2389  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  27.84 
 
 
289 aa  86.3  6e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1318  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  27.24 
 
 
291 aa  85.9  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.676438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>