75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0336 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0336  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  100 
 
 		 308 aa  625  1e-178  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3634  phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding,-like protein  79.8 
 
 		 313 aa  494  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.75811 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5180  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  77.41 
 
 		 309 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2699  dehydrogenase  77.2 
 
 		 312 aa  465  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.647846  normal  0.600019 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0875  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  75.57 
 
 		 309 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.651472  normal  0.39983 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2165  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  56.08 
 
 		 299 aa  300  2e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.328451  normal  0.0994663 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5740  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  48.99 
 
 		 301 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2089  phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  47.35 
 
 		 295 aa  235  6e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.891235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1359  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  40.41 
 
 		 296 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.234079  normal  0.110922 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1455  phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  44.02 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7576  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  43.82 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1049  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  38.89 
 
 		 294 aa  181  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0780774  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1079  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  35 
 
 		 300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8622  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  35.61 
 
 		 300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.489612  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2815  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  36.33 
 
 		 277 aa  136  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.256633  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4139  phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  34.19 
 
 		 302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.847041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2716  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  34.44 
 
 		 304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5621  phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  33.33 
 
 		 304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.786606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8322  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  32.59 
 
 		 304 aa  122  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0469353  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1610  NAD-binding phsophogluconase dehydrogenase-like protein  34.21 
 
 		 288 aa  122  8e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4024  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  31.45 
 
 		 263 aa  112  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0632878 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2676  Phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding, putative  31 
 
 		 262 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.607685  normal  0.076232 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3257  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  31.94 
 
 		 293 aa  105  9e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00764055  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3786  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  29.09 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.622459  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0198  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  29.67 
 
 		 261 aa  102  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0601  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  29.5 
 
 		 288 aa  90.1  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0286951  normal  0.472195 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0096  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  31.98 
 
 		 259 aa  89.7  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2243  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  29.08 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  26.85 
 
 		 450 aa  71.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4431  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  28.71 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.182897  normal  0.586464 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2354  putative dehydrogenase  28.24 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0342021 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4075  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  24.83 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5535  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  27.31 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5899  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  27.31 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.702285 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5900  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent:6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding:3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  30.41 
 
 		 294 aa  57  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0430  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  28.89 
 
 		 303 aa  57  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2048  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.08 
 
 		 289 aa  55.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0985  putative dehydrogenase  48.08 
 
 		 70 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0851571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0979  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  25.17 
 
 		 315 aa  54.3  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103843  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3190  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  25.35 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.492054  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2413  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  24.66 
 
 		 289 aa  51.6  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5116  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  29.63 
 
 		 297 aa  50.4  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.528779 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5125  putative 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  27.23 
 
 		 293 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161405 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3294  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  28.23 
 
 		 286 aa  50.4  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.738468  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3551  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  24.64 
 
 		 292 aa  50.1  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000115044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6188  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  25.47 
 
 		 282 aa  49.3  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.465928  normal  0.388125 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7152  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  23.81 
 
 		 291 aa  49.3  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5146  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.58 
 
 		 307 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.74741  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2077  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  23.85 
 
 		 285 aa  47.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1759  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  25.12 
 
 		 289 aa  47  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.271447 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5561  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  26.72 
 
 		 283 aa  47  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.560852  normal  0.0590725 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6367  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  25.81 
 
 		 288 aa  45.8  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.707828  normal  0.820897 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1800  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  23.08 
 
 		 298 aa  45.8  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2565  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  23.08 
 
 		 295 aa  45.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0395853  normal  0.0235882 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2600  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  22.32 
 
 		 299 aa  45.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00798756  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3153  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  30.18 
 
 		 304 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.636013 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1380  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  21.97 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0240977 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5958  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  21.01 
 
 		 293 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.564119  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1318  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  25.96 
 
 		 291 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.676438  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0261  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  24.02 
 
 		 305 aa  43.9  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0646517 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1097  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  22.92 
 
 		 295 aa  43.9  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2003  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  25 
 
 		 325 aa  43.9  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.794749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4931  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  22.17 
 
 		 293 aa  43.9  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.684033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1714  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  28.23 
 
 		 309 aa  43.9  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.280932  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2852  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  28.23 
 
 		 297 aa  43.5  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0134215  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1101  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  22.87 
 
 		 290 aa  43.1  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3659  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  22.65 
 
 		 299 aa  43.1  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.881887 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2614  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  22.69 
 
 		 300 aa  43.1  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1825  hypothetical protein  25.49 
 
 		 284 aa  42.7  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0615  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  23.66 
 
 		 295 aa  42.7  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.789024  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5745  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  28.97 
 
 		 290 aa  42.7  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0651815  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5648  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  29.05 
 
 		 290 aa  42.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.390544 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3712  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  29.05 
 
 		 290 aa  42.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4460  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  26.77 
 
 		 294 aa  42.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4656  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  29.05 
 
 		 290 aa  42.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.990326  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>