84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2699 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2699  dehydrogenase  100 
 
 		 312 aa  629  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.647846  normal  0.600019 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5180  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  82.72 
 
 		 309 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3634  phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding,-like protein  79.26 
 
 		 313 aa  483  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.75811 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0875  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  80.87 
 
 		 309 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.651472  normal  0.39983 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0336  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  77.2 
 
 		 308 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2165  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  56.38 
 
 		 299 aa  300  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.328451  normal  0.0994663 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5740  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  53.49 
 
 		 301 aa  266  4e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2089  phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  46.01 
 
 		 295 aa  230  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.891235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1359  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  43.34 
 
 		 296 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.234079  normal  0.110922 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1455  phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  46.54 
 
 		 298 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7576  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  45.82 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1079  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  38.46 
 
 		 300 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1049  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  37.88 
 
 		 294 aa  172  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0780774  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2716  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent  33.95 
 
 		 304 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2815  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  36.54 
 
 		 277 aa  135  7.000000000000001e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.256633  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8622  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  34.57 
 
 		 300 aa  133  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.489612  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1610  NAD-binding phsophogluconase dehydrogenase-like protein  34.96 
 
 		 288 aa  129  6e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4139  phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  33.09 
 
 		 302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.847041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2676  Phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding, putative  32.96 
 
 		 262 aa  122  7e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.607685  normal  0.076232 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5621  phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  33.21 
 
 		 304 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.786606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8322  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  32.08 
 
 		 304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0469353  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4024  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  33.74 
 
 		 263 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0632878 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0198  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  31.35 
 
 		 261 aa  106  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3786  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  30.88 
 
 		 293 aa  102  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.622459  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3257  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  31.56 
 
 		 293 aa  99.8  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00764055  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2243  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  29.77 
 
 		 262 aa  92.8  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0096  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  33.67 
 
 		 259 aa  89.7  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0601  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  28.57 
 
 		 288 aa  86.7  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0286951  normal  0.472195 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.05 
 
 		 450 aa  80.5  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4075  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  24.63 
 
 		 299 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4431  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  28.71 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.182897  normal  0.586464 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1800  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  27.27 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0829  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  26.41 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.601203  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2181  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  26.41 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0921  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  26.41 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2354  putative dehydrogenase  27.67 
 
 		 291 aa  57  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0342021 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0430  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  28.18 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2048  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.09 
 
 		 289 aa  55.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3407  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  25.54 
 
 		 299 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.373946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4960  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  25.54 
 
 		 299 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.247948 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5326  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  25.54 
 
 		 299 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.012022  normal  0.0232804 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5899  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  26.76 
 
 		 300 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.702285 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5535  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  26.76 
 
 		 300 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4382  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  25.91 
 
 		 300 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.128 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5900  NADP oxidoreductase, coenzyme F420-dependent:6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding:3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  29.46 
 
 		 294 aa  53.5  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2077  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  25.1 
 
 		 285 aa  53.5  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0717  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  25.11 
 
 		 299 aa  53.5  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.396436  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4901  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  25.91 
 
 		 300 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0315002  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6188  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  25.21 
 
 		 282 aa  53.5  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.465928  normal  0.388125 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3659  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  25.11 
 
 		 299 aa  52.4  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.881887 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7152  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  24.89 
 
 		 291 aa  50.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3294  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  29.95 
 
 		 286 aa  49.7  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.738468  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3190  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  26.96 
 
 		 300 aa  49.7  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.492054  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0985  putative dehydrogenase  58.33 
 
 		 70 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0851571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1173  tartronate semialdehyde reductase  24.43 
 
 		 296 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1933  oxidoreductase protein  26.64 
 
 		 290 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.508408  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6528  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  28.33 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186276  normal  0.100696 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6367  Phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding, putative-like protein  25.59 
 
 		 288 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.707828  normal  0.820897 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2197  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  25.47 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206144  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2413  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  28.06 
 
 		 289 aa  48.1  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4985  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  28.1 
 
 		 289 aa  47.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.888648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0979  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  23.61 
 
 		 315 aa  47  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103843  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3320  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  24.32 
 
 		 292 aa  47  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4326  normal  0.191716 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2389  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  22.32 
 
 		 289 aa  46.2  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3742  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  24.03 
 
 		 303 aa  46.2  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0261  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  25.25 
 
 		 305 aa  46.2  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0646517 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5116  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  29.46 
 
 		 297 aa  46.2  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.528779 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5958  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  21.88 
 
 		 293 aa  46.2  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.564119  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5146  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.26 
 
 		 307 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.74741  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2366  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  26.6 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4151  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  24.66 
 
 		 292 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130124  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3990  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  25 
 
 		 303 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1097  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  26.57 
 
 		 295 aa  44.3  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4550  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.72 
 
 		 296 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.918692 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1318  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  27.43 
 
 		 291 aa  43.5  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.676438  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0924  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  24.88 
 
 		 288 aa  43.5  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1087  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  24.66 
 
 		 292 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1453  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  24.17 
 
 		 296 aa  43.1  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4931  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  24.31 
 
 		 293 aa  43.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.684033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5124  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.33 
 
 		 296 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5073  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.72 
 
 		 296 aa  43.1  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1714  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  28.1 
 
 		 309 aa  42.7  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.280932  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0478  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  33.33 
 
 		 296 aa  42.7  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.084139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1380  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  21.89 
 
 		 301 aa  42.4  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0240977 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>