More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_20270 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_20270  RraA family protein  100 
 
 		 155 aa  305  1.0000000000000001e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.295098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0271  regulator of ribonuclease activity A  71.43 
 
 		 157 aa  221  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4363  regulator of ribonuclease activity A  66.45 
 
 		 162 aa  207  5e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2727  ribonuclease activity regulator protein RraA  63.23 
 
 		 163 aa  199  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.608878  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1137  regulator of ribonuclease activity A  64.24 
 
 		 159 aa  197  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2492  regulator of ribonuclease activity A  63.64 
 
 		 170 aa  197  3.9999999999999996e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5435  ribonuclease activity regulator protein RraA  63.58 
 
 		 159 aa  197  6e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.89586  normal  0.892268 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1124  ribonuclease activity regulator protein RraA  62.75 
 
 		 160 aa  194  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.22942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5056  ribonuclease activity regulator protein RraA  62.91 
 
 		 159 aa  193  6e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5144  ribonuclease activity regulator protein RraA  62.91 
 
 		 159 aa  193  6e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8444  regulator of ribonuclease activity A  62.75 
 
 		 159 aa  193  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1638  regulator of ribonuclease activity A  62.91 
 
 		 159 aa  190  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.626899 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5682  ribonuclease activity regulator protein RraA  61.18 
 
 		 160 aa  190  7e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219714 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0136  regulator of ribonuclease activity A  57.52 
 
 		 166 aa  185  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.657064  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13889  ribonuclease activity regulator protein RraA  58.67 
 
 		 157 aa  185  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0114  regulator of ribonuclease activity A  59.74 
 
 		 163 aa  183  8e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.344528  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2551  ribonuclease activity regulator protein RraA  56.29 
 
 		 161 aa  177  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0143021  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3997  ribonuclease activity regulator protein RraA  59.06 
 
 		 176 aa  175  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3776  ribonuclease activity regulator protein RraA  59.6 
 
 		 161 aa  167  6e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1172  ribonuclease activity regulator protein RraA  57.05 
 
 		 161 aa  163  9e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.837665  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1248  ribonuclease activity regulator protein RraA  51.66 
 
 		 159 aa  160  7e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.728506  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1772  ribonuclease activity regulator protein RraA  49.34 
 
 		 163 aa  159  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000823097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2092  ribonuclease activity regulator protein RraA  49.34 
 
 		 162 aa  158  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.763155  hitchhiker  0.00360273 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2087  ribonuclease activity regulator protein RraA  49.01 
 
 		 162 aa  159  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.188373  normal  0.130481 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2622  ribonuclease activity regulator protein RraA  53.64 
 
 		 161 aa  158  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1888  ribonuclease activity regulator protein RraA  54.48 
 
 		 164 aa  157  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1543  ribonuclease activity regulator protein RraA  53.64 
 
 		 161 aa  157  5e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000209525  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2373  ribonuclease activity regulator protein RraA  54.48 
 
 		 164 aa  157  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00367036  normal  0.0338555 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2294  dimethylmenaquinone methyltransferase family protein  50 
 
 		 162 aa  157  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0136666  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23290  ribonuclease activity regulator protein RraA  49.67 
 
 		 162 aa  156  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04832  ribonuclease activity regulator protein RraA  54.3 
 
 		 166 aa  156  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2165  ribonuclease activity regulator protein RraA  53.1 
 
 		 164 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0632667  normal  0.880589 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2242  ribonuclease activity regulator protein RraA  53.1 
 
 		 164 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.132469  normal  0.489263 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1595  ribonuclease activity regulator protein RraA  49.34 
 
 		 163 aa  154  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.462955  normal  0.0410006 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1602  ribonuclease activity regulator protein RraA  49.34 
 
 		 163 aa  154  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.730491  hitchhiker  0.000000000811326 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2060  ribonuclease activity regulator protein RraA  50.97 
 
 		 163 aa  154  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.163212  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3656  ribonuclease activity regulator protein RraA  49.34 
 
 		 163 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.055385  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2084  ribonuclease activity regulator protein RraA  49.67 
 
 		 163 aa  153  7e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0147593  normal  0.0154234 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41640  ribonuclease activity regulator protein RraA  47.68 
 
 		 162 aa  153  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1992  ribonuclease activity regulator protein RraA  51.72 
 
 		 164 aa  153  7e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.816132  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2117  ribonuclease activity regulator protein RraA  54.48 
 
 		 164 aa  153  9e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.86066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2007  ribonuclease activity regulator protein RraA  51.72 
 
 		 164 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.151067  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2332  ribonuclease activity regulator protein RraA  51.72 
 
 		 164 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00982975  hitchhiker  0.00847233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3534  ribonuclease activity regulator protein RraA  47.02 
 
 		 162 aa  152  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.433731  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1882  ribonuclease activity regulator protein RraA  47.68 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2055  ribonuclease activity regulator protein RraA  51.72 
 
 		 164 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215493  hitchhiker  0.000558094 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2567  ribonuclease activity regulator protein RraA  49.66 
 
 		 164 aa  150  7e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2615  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.94 
 
 		 164 aa  149  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.78337  normal  0.362905 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3327  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.32 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_8571  predicted protein  58.02 
 
 		 136 aa  148  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0694704 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3096  ribonuclease activity regulator protein RraA  49.03 
 
 		 163 aa  149  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3012  ribonuclease activity regulator protein RraA  47.65 
 
 		 159 aa  147  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000537886  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0386  ribonuclease activity regulator protein RraA  52.29 
 
 		 167 aa  147  5e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1984  ribonuclease activity regulator protein RraA  47.65 
 
 		 164 aa  147  6e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0137329  normal  0.331323 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0292  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.31 
 
 		 165 aa  147  7e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2557  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.26 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1772  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.98 
 
 		 164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0420602  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1909  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.98 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3341  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.31 
 
 		 159 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0125864  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3321  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.98 
 
 		 159 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3047  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.98 
 
 		 159 aa  144  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0538  ribonuclease activity regulator protein RraA  45.52 
 
 		 163 aa  144  5e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1944  ribonuclease activity regulator protein RraA  47.65 
 
 		 162 aa  144  6e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000472167  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3122  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.31 
 
 		 159 aa  143  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380178  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3341  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.31 
 
 		 159 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3368  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.31 
 
 		 159 aa  143  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2025  ribonuclease activity regulator protein RraA  47.62 
 
 		 177 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.111815  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2245  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.31 
 
 		 171 aa  143  8.000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4197  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.36 
 
 		 161 aa  142  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0433  ribonuclease activity regulator protein RraA  47.02 
 
 		 161 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0304727  hitchhiker  0.000428302 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0447  ribonuclease activity regulator protein RraA  47.02 
 
 		 161 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.944116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0421  ribonuclease activity regulator protein RraA  47.02 
 
 		 161 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0463  ribonuclease activity regulator protein RraA  47.68 
 
 		 161 aa  142  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3893  ribonuclease activity regulator protein RraA  47.02 
 
 		 161 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0137999  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3549  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.36 
 
 		 161 aa  142  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00109264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0407  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.36 
 
 		 161 aa  142  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000143495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0477  ribonuclease activity regulator protein RraA  47.68 
 
 		 161 aa  142  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3723  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.36 
 
 		 161 aa  142  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00679648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0508  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.36 
 
 		 161 aa  142  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3109  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.31 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00721  ribonuclease activity regulator protein RraA  47.02 
 
 		 175 aa  142  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2071  regulator of ribonuclease activity A  47.62 
 
 		 161 aa  141  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0110  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.99 
 
 		 161 aa  140  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4106  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.99 
 
 		 161 aa  140  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3370  ribonuclease activity regulator protein RraA  45.03 
 
 		 161 aa  140  7e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2210  ribonuclease activity regulator protein RraA  45.52 
 
 		 164 aa  140  7e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0110  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.99 
 
 		 161 aa  140  7e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001751  ribonuclease E inhibitor RraA  45.7 
 
 		 169 aa  140  8e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00131194  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1593  ribonuclease activity regulator protein RraA  51.28 
 
 		 165 aa  140  9e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11137  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2531  ribonuclease activity regulator protein RraA  51.28 
 
 		 165 aa  140  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2618  ribonuclease activity regulator protein RraA  51.28 
 
 		 165 aa  140  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0127005  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2477  ribonuclease activity regulator protein RraA  51.28 
 
 		 165 aa  140  9e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000110984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3218  ribonuclease activity regulator protein RraA  51.28 
 
 		 165 aa  140  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00155848  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2095  ribonuclease activity regulator protein RraA  51.28 
 
 		 165 aa  140  9e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000569604  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1368  ribonuclease activity regulator protein RraA  51.28 
 
 		 165 aa  140  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226901  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4094  ribonuclease activity regulator protein RraA  45.03 
 
 		 161 aa  138  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1561  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.73 
 
 		 168 aa  138  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.220477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3200  ribonuclease activity regulator protein RraA  45.03 
 
 		 161 aa  138  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0163  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.32 
 
 		 161 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4371  ribonuclease activity regulator protein RraA  50.34 
 
 		 161 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.520292 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>