More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND03850 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006686  CND03850  isocitrate dehydrogenase, putative  100 
 
 		 370 aa  745    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05206  LysBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6DTN1]  62.81 
 
 		 360 aa  436  1e-121  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50442  homo- isocitrate dehydrogenase  58.71 
 
 		 377 aa  406  1.0000000000000001e-112  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0465536 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3304  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.6 
 
 		 331 aa  277  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652858  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3471  3-isopropylmalate dehydrogenase  46.59 
 
 		 360 aa  273  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1337  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.1 
 
 		 334 aa  272  8.000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0443699  normal  0.850661 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1057  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.72 
 
 		 362 aa  271  1e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2738  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.44 
 
 		 335 aa  270  2e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1458  3-isopropylmalate dehydrogenase  44.6 
 
 		 333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.568664  normal  0.0894322 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0128  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  42.51 
 
 		 339 aa  265  1e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0813409 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1775  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  42.23 
 
 		 339 aa  263  3e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0688  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  42.23 
 
 		 339 aa  261  2e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.705253  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3600  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.37 
 
 		 332 aa  258  1e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.177438 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0040  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  41.83 
 
 		 337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.101406  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0248  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.34 
 
 		 338 aa  250  3e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0353  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  44.04 
 
 		 330 aa  250  3e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0234047  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1068  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  43.77 
 
 		 330 aa  250  3e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1484  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  40.77 
 
 		 343 aa  250  3e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1558  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  43.77 
 
 		 330 aa  248  9e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.262348 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0855  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenases  40.83 
 
 		 323 aa  247  2e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0993  isocitrate dehydrogenase (NADP)  41.06 
 
 		 336 aa  246  4e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014677  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0525  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  41.87 
 
 		 335 aa  245  8e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000187732  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1693  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  44.04 
 
 		 331 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0404  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  40.11 
 
 		 334 aa  239  5.999999999999999e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.638011 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1416  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  42.22 
 
 		 330 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0602  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.83 
 
 		 325 aa  232  8.000000000000001e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.785398 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2154  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  38.89 
 
 		 333 aa  231  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1038  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  40.55 
 
 		 336 aa  231  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0651  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.28 
 
 		 326 aa  229  4e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.443768  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08060  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.06 
 
 		 331 aa  227  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201667  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1102  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  39.29 
 
 		 334 aa  226  4e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1706  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  40.06 
 
 		 331 aa  225  1e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1069  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  38.48 
 
 		 337 aa  225  1e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1172  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  41.08 
 
 		 335 aa  224  2e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.651985 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1297  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  38.94 
 
 		 336 aa  224  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4042  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  38.89 
 
 		 348 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1073  isocitrate dehydrogenase (NADP)  37.64 
 
 		 337 aa  218  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.606358  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2146  3-isopropylmalate dehydrogenase  39 
 
 		 321 aa  215  9e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2760  isocitrate dehydrogenase  37.82 
 
 		 335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146661  normal  0.225413 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3616  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.4 
 
 		 360 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.79276  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2334  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  40 
 
 		 361 aa  214  2.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2720  isocitrate dehydrogenase  37.99 
 
 		 336 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273137  normal  0.0347586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2791  isocitrate dehydrogenase  37.99 
 
 		 336 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000299358  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3318  isocitrate dehydrogenase  38.27 
 
 		 335 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1538  isocitrate dehydrogenase  38.27 
 
 		 335 aa  212  7e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1286  isocitrate dehydrogenase  37.99 
 
 		 336 aa  212  7e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000741785  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2890  isocitrate dehydrogenase  37.99 
 
 		 336 aa  212  7e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000476084  hitchhiker  0.00000772445 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2077  isocitrate dehydrogenase  37.43 
 
 		 335 aa  212  9e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2166  isocitrate dehydrogenase  37.43 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0088  3-isopropylmalate dehydrogenase  35.68 
 
 		 336 aa  212  1e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00287551  hitchhiker  0.00000627763 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2779  isocitrate dehydrogenase  37.99 
 
 		 336 aa  211  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3466  isocitrate dehydrogenase  37.99 
 
 		 335 aa  210  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.954346  hitchhiker  0.000126516 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1393  isocitrate dehydrogenase  37.99 
 
 		 335 aa  210  4e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.150123  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0166  3-isopropylmalate dehydrogenase  35.64 
 
 		 370 aa  210  4e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.294157  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1354  isocitrate dehydrogenase  37.99 
 
 		 335 aa  210  4e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.308033  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2992  isocitrate dehydrogenase  37.99 
 
 		 335 aa  210  4e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272592  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2561  isocitrate dehydrogenase  37.99 
 
 		 336 aa  210  4e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1368  isocitrate dehydrogenase  37.99 
 
 		 335 aa  210  4e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0157662  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0637  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.34 
 
 		 322 aa  209  8e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.253022  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2980  isocitrate dehydrogenase  36.69 
 
 		 336 aa  208  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1797  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.03 
 
 		 329 aa  208  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03050  isocitrate dehydrogenase  35.83 
 
 		 335 aa  208  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0609305  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3071  isocitrate dehydrogenase, NAD-dependent, putative  37.91 
 
 		 340 aa  207  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02485  isocitrate dehydrogenase  37.71 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0665  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  38.01 
 
 		 344 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0235  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.21 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2659  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  40.28 
 
 		 326 aa  206  4e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.122672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2762  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.66 
 
 		 326 aa  206  6e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0788  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  35.05 
 
 		 361 aa  206  7e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2423  isocitrate dehydrogenase  37.99 
 
 		 336 aa  206  7e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000245229  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3540  isocitrate dehydrogenase  35.01 
 
 		 335 aa  204  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02380  isocitrate dehydrogenase (NADP)  40.05 
 
 		 364 aa  204  2e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.713853  normal  0.672997 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1781  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  36.49 
 
 		 336 aa  204  3e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0214  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  36.39 
 
 		 342 aa  202  7e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.6389  normal  0.0659244 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0287  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  36.74 
 
 		 348 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0828  isocitrate dehydrogenase  36.84 
 
 		 334 aa  199  5e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.47191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0288  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.05 
 
 		 356 aa  199  6e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3197  isocitrate dehydrogenase  35.28 
 
 		 335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2488  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.77 
 
 		 377 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1486  tartrate dehydrogenase  36.58 
 
 		 360 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197806  hitchhiker  0.00128881 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04610  isocitrate dehydrogenase, putative  36.89 
 
 		 379 aa  196  6e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.673993  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6098  tartrate dehydrogenase  37.4 
 
 		 360 aa  196  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.609209  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01003  hypothetical protein similar to isocitrate dehydrogenase (Broad)  35.79 
 
 		 385 aa  195  8.000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2611  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.05 
 
 		 360 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0404939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0664  isocitrate dehydrogenase  37.19 
 
 		 335 aa  194  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.430122 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_392  isocitrate dehydrogenase  36.41 
 
 		 359 aa  193  4e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.952399  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1270  3-isopropylmalate dehydrogenase  34.2 
 
 		 353 aa  193  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10890  3-isopropylmalate dehydrogenase  35.47 
 
 		 358 aa  193  5e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0450  isocitrate dehydrogenase, putative  35.17 
 
 		 359 aa  192  8e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2572  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.58 
 
 		 360 aa  192  8e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2617  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.58 
 
 		 360 aa  192  8e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2064  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.54 
 
 		 325 aa  192  9e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.189691 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0623  isocitrate dehydrogenase (NADP)  34.17 
 
 		 342 aa  191  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4250  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  37.78 
 
 		 343 aa  191  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0427  isocitrate dehydrogenase (NADP)  35.7 
 
 		 359 aa  192  1e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1605  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.96 
 
 		 325 aa  191  2e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0870  isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase  38.1 
 
 		 332 aa  190  4e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6571  tartrate dehydrogenase  35.42 
 
 		 359 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0898  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.56 
 
 		 327 aa  189  8e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0329  3-isopropylmalate dehydrogenase oxidoreductase protein  34.93 
 
 		 365 aa  189  9e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  normal  0.066253 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>