More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2617 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_2611  3-isopropylmalate dehydrogenase  99.44 
 
 		 360 aa  718    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0404939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2572  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 360 aa  723    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2617  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 		 360 aa  723    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89884 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3616  3-isopropylmalate dehydrogenase  59.71 
 
 		 360 aa  404  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.79276  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2488  3-isopropylmalate dehydrogenase  56.7 
 
 		 377 aa  385  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2885  3-isopropylmalate dehydrogenase  55.93 
 
 		 362 aa  358  9.999999999999999e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.566713  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1270  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.66 
 
 		 353 aa  286  4e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0329  3-isopropylmalate dehydrogenase oxidoreductase protein  43.38 
 
 		 365 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  normal  0.066253 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1172  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  40.74 
 
 		 335 aa  253  3e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.651985 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1349  3-isopropylmalate dehydrogenase  43.24 
 
 		 356 aa  238  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0357942 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1069  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  35.63 
 
 		 337 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1706  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  38.57 
 
 		 331 aa  232  7.000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1605  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.19 
 
 		 325 aa  229  5e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2720  isocitrate dehydrogenase  39.49 
 
 		 336 aa  228  9e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273137  normal  0.0347586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2791  isocitrate dehydrogenase  39.49 
 
 		 336 aa  228  9e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000299358  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0525  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  38.97 
 
 		 335 aa  228  1e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000187732  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2890  isocitrate dehydrogenase  39.49 
 
 		 336 aa  228  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000476084  hitchhiker  0.00000772445 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2760  isocitrate dehydrogenase  39.03 
 
 		 335 aa  227  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146661  normal  0.225413 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1286  isocitrate dehydrogenase  39.49 
 
 		 336 aa  227  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000741785  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1337  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.79 
 
 		 334 aa  227  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0443699  normal  0.850661 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1538  isocitrate dehydrogenase  39.6 
 
 		 335 aa  225  8e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2992  isocitrate dehydrogenase  39.6 
 
 		 335 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272592  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1393  isocitrate dehydrogenase  39.6 
 
 		 335 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.150123  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1354  isocitrate dehydrogenase  39.6 
 
 		 335 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.308033  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1368  isocitrate dehydrogenase  39.6 
 
 		 335 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0157662  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2561  isocitrate dehydrogenase  39.03 
 
 		 336 aa  223  4e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2166  isocitrate dehydrogenase  37.71 
 
 		 335 aa  222  6e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0833  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.05 
 
 		 325 aa  222  9e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2064  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.35 
 
 		 325 aa  221  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.189691 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2077  isocitrate dehydrogenase  37.43 
 
 		 335 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1068  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  38.46 
 
 		 330 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1057  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.51 
 
 		 362 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0651  3-isopropylmalate dehydrogenase  42.74 
 
 		 326 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.443768  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3318  isocitrate dehydrogenase  38.46 
 
 		 335 aa  220  3e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1558  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  38.75 
 
 		 330 aa  220  3e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.262348 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2738  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.14 
 
 		 335 aa  220  3e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0353  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  39.24 
 
 		 330 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0234047  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2779  isocitrate dehydrogenase  38.35 
 
 		 336 aa  219  5e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2423  isocitrate dehydrogenase  39.49 
 
 		 336 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000245229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3466  isocitrate dehydrogenase  38.46 
 
 		 335 aa  218  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.954346  hitchhiker  0.000126516 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2980  isocitrate dehydrogenase  37.78 
 
 		 336 aa  218  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2804  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.25 
 
 		 359 aa  217  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.84525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1815  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.19 
 
 		 325 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000286516 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0214  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  39 
 
 		 342 aa  216  5e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.6389  normal  0.0659244 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1781  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  36.36 
 
 		 336 aa  215  9.999999999999999e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4827  tartrate dehydrogenase  41.5 
 
 		 349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1416  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  38.76 
 
 		 330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05206  LysBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6DTN1]  36.84 
 
 		 360 aa  213  2.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0287  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  38.87 
 
 		 348 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3197  isocitrate dehydrogenase  38.7 
 
 		 335 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1458  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.35 
 
 		 333 aa  213  4.9999999999999996e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.568664  normal  0.0894322 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1038  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  40.17 
 
 		 336 aa  213  5.999999999999999e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03050  isocitrate dehydrogenase  38.42 
 
 		 335 aa  212  5.999999999999999e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0609305  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2154  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  36.54 
 
 		 333 aa  212  7e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3540  isocitrate dehydrogenase  37.89 
 
 		 335 aa  212  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02485  isocitrate dehydrogenase  37.61 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3071  isocitrate dehydrogenase, NAD-dependent, putative  40.47 
 
 		 340 aa  210  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3304  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.44 
 
 		 331 aa  210  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652858  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1221  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.72 
 
 		 357 aa  210  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.725495  normal  0.0144759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4042  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  36.06 
 
 		 348 aa  209  4e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1846  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.61 
 
 		 350 aa  210  4e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1486  tartrate dehydrogenase  38.25 
 
 		 360 aa  209  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197806  hitchhiker  0.00128881 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2360  tartrate dehydrogenase  36.57 
 
 		 362 aa  209  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08060  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.22 
 
 		 331 aa  209  6e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201667  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0248  3-isopropylmalate dehydrogenase  39 
 
 		 338 aa  208  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0993  isocitrate dehydrogenase (NADP)  38.11 
 
 		 336 aa  208  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014677  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4079  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  41.27 
 
 		 343 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0040  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  36.69 
 
 		 337 aa  207  2e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.101406  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0088  3-isopropylmalate dehydrogenase  35.51 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00287551  hitchhiker  0.00000627763 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30170  tartrate dehydrogenase  40.44 
 
 		 363 aa  207  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1775  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  36.49 
 
 		 339 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0769  tartrate dehydrogenase  37.67 
 
 		 362 aa  208  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50442  homo- isocitrate dehydrogenase  35.98 
 
 		 377 aa  207  2e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.185544  normal  0.0465536 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1170  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.67 
 
 		 345 aa  207  2e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2363  3-isopropylmalate dehydrogenase  33.33 
 
 		 371 aa  206  4e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.49502 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0288  3-isopropylmalate dehydrogenase  40.06 
 
 		 356 aa  206  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1183  tartrate dehydrogenase  39.61 
 
 		 349 aa  206  4e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.272593  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3600  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.72 
 
 		 332 aa  206  4e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.177438 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0855  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenases  40 
 
 		 323 aa  206  4e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1020  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.57 
 
 		 356 aa  206  4e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6098  tartrate dehydrogenase  37.7 
 
 		 360 aa  206  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.609209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1047  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.44 
 
 		 357 aa  206  6e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4250  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  40.9 
 
 		 343 aa  206  6e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0124  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.33 
 
 		 363 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.736589  normal  0.998111 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1612  tartrate dehydrogenase oxidoreductase protein  37 
 
 		 361 aa  205  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0186674  normal  0.0323069 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1230  tartrate dehydrogenase  39.06 
 
 		 352 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0128  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.33 
 
 		 363 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3471  3-isopropylmalate dehydrogenase  41.76 
 
 		 360 aa  205  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1693  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  37.11 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1601  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.5 
 
 		 352 aa  204  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0498293 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4532  tartrate dehydrogenase  37.43 
 
 		 361 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3233  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.15 
 
 		 357 aa  204  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0488471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1102  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  39.07 
 
 		 334 aa  204  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2586  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.15 
 
 		 359 aa  204  3e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1085  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.66 
 
 		 348 aa  204  3e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1320  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.72 
 
 		 343 aa  204  3e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3173  tartrate dehydrogenase  36.9 
 
 		 361 aa  203  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1297  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  37.89 
 
 		 336 aa  202  5e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6571  tartrate dehydrogenase  38.38 
 
 		 359 aa  202  6e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5238  3-isopropylmalate dehydrogenase  39.15 
 
 		 356 aa  202  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37874 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>