More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2964 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2964  3-isopropylmalate dehydrogenase  100 
 
 
403 aa  837    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  0.574229 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0166  3-isopropylmalate dehydrogenase  54.57 
 
 
370 aa  414  1e-114  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.294157  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3205  dehydrogenase, isocitrate/isopropylmalate family  39.58 
 
 
396 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0643665  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3071  3-isopropylmalate dehydrogenase  38.34 
 
 
396 aa  266  4e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2610  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  37.74 
 
 
615 aa  265  1e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2737  DlpA protein (isocitrate and isopropylmalate dehydrogenase family protein)  37.27 
 
 
615 aa  264  2e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0450  isocitrate dehydrogenase, putative  37.06 
 
 
359 aa  252  8.000000000000001e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_392  isocitrate dehydrogenase  36.55 
 
 
359 aa  248  2e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.952399  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1368  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.53 
 
 
420 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0427  isocitrate dehydrogenase (NADP)  37.15 
 
 
359 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0525  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  36.15 
 
 
335 aa  239  5.999999999999999e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000187732  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0788  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  36.01 
 
 
361 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1102  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  36.41 
 
 
334 aa  239  8e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0993  isocitrate dehydrogenase (NADP)  36.87 
 
 
336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014677  normal  0.0984652 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3071  isocitrate dehydrogenase, NAD-dependent, putative  34.35 
 
 
340 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0128  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  36.18 
 
 
339 aa  233  5e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0813409 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2720  isocitrate dehydrogenase  35.25 
 
 
336 aa  233  6e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273137  normal  0.0347586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2791  isocitrate dehydrogenase  35.25 
 
 
336 aa  233  6e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000299358  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2890  isocitrate dehydrogenase  35.25 
 
 
336 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000476084  hitchhiker  0.00000772445 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1775  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  35.84 
 
 
339 aa  231  2e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2760  isocitrate dehydrogenase  35.79 
 
 
335 aa  229  7e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146661  normal  0.225413 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1286  isocitrate dehydrogenase  34.97 
 
 
336 aa  228  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000741785  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0688  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  37.98 
 
 
339 aa  228  2e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.705253  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1368  isocitrate dehydrogenase  34.97 
 
 
335 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0157662  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1538  isocitrate dehydrogenase  35.25 
 
 
335 aa  226  4e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1354  isocitrate dehydrogenase  34.97 
 
 
335 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.308033  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1393  isocitrate dehydrogenase  34.97 
 
 
335 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.150123  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2992  isocitrate dehydrogenase  34.97 
 
 
335 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272592  hitchhiker  0.00000251452 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0040  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  37.43 
 
 
337 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.101406  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2980  isocitrate dehydrogenase  35.52 
 
 
336 aa  226  6e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3318  isocitrate dehydrogenase  34.15 
 
 
335 aa  226  7e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3466  isocitrate dehydrogenase  33.88 
 
 
335 aa  224  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.954346  hitchhiker  0.000126516 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1337  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.29 
 
 
334 aa  223  4e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0443699  normal  0.850661 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2779  isocitrate dehydrogenase  34.43 
 
 
336 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2561  isocitrate dehydrogenase  34.15 
 
 
336 aa  222  9e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2334  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  35.71 
 
 
361 aa  219  7.999999999999999e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3540  isocitrate dehydrogenase  32.74 
 
 
335 aa  216  4e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2738  3-isopropylmalate dehydrogenase  37.4 
 
 
335 aa  216  4e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1038  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  36.41 
 
 
336 aa  216  5e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3304  3-isopropylmalate dehydrogenase  34.2 
 
 
331 aa  212  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652858  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2154  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  34.63 
 
 
333 aa  211  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2423  isocitrate dehydrogenase  34.97 
 
 
336 aa  211  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000245229  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0651  3-isopropylmalate dehydrogenase  34.72 
 
 
326 aa  210  4e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.443768  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1297  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  33.59 
 
 
336 aa  208  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03050  isocitrate dehydrogenase  31.97 
 
 
335 aa  206  4e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0609305  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1057  3-isopropylmalate dehydrogenase  34.57 
 
 
362 aa  206  6e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3197  isocitrate dehydrogenase  33.61 
 
 
335 aa  206  8e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0079  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  35.39 
 
 
389 aa  205  9e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1458  3-isopropylmalate dehydrogenase  33.67 
 
 
333 aa  205  1e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.568664  normal  0.0894322 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2077  isocitrate dehydrogenase  34.25 
 
 
335 aa  204  2e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3471  3-isopropylmalate dehydrogenase  33.9 
 
 
360 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2166  isocitrate dehydrogenase  34.25 
 
 
335 aa  204  2e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1706  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  35.08 
 
 
331 aa  204  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08060  3-isopropylmalate dehydrogenase  36.74 
 
 
331 aa  203  4e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000201667  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0353  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  34.36 
 
 
330 aa  203  5e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0234047  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4042  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  33.16 
 
 
348 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1558  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  34.36 
 
 
330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.262348 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1484  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenase  35 
 
 
343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02485  isocitrate dehydrogenase  34.53 
 
 
335 aa  200  3.9999999999999996e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413989  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1068  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  34.08 
 
 
330 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1073  isocitrate dehydrogenase (NADP)  34.61 
 
 
337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.606358  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05206  LysBPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6DTN1]  35.95 
 
 
360 aa  197  3e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0404  isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  32.05 
 
 
334 aa  197  3e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.638011 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2363  3-isopropylmalate dehydrogenase  33.75 
 
 
371 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.49502 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0855  isopropylmalate/isohomocitrate dehydrogenases  33.67 
 
 
323 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0025  3-isopropylmalate dehydrogenase  32.07 
 
 
374 aa  195  1e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0500752  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1693  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  34.83 
 
 
331 aa  194  2e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1612  3-isopropylmalate dehydrogenase  33.42 
 
 
370 aa  194  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0287  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  31.81 
 
 
348 aa  194  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1797  3-isopropylmalate dehydrogenase  31.89 
 
 
329 aa  191  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1416  multifunctional 3-isopropylmalate dehydrogenase/D-malate dehydrogenase  34.29 
 
 
330 aa  189  9e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02380  isocitrate dehydrogenase (NADP)  33.17 
 
 
364 aa  188  2e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.713853  normal  0.672997 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2659  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  34.11 
 
 
326 aa  187  3e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.122672  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1339  3-isopropylmalate dehydrogenase  32.45 
 
 
375 aa  186  8e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01003  hypothetical protein similar to isocitrate dehydrogenase (Broad)  31.23 
 
 
385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97635  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND03850  isocitrate dehydrogenase, putative  34.85 
 
 
370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0609  3-isopropylmalate dehydrogenase  32.87 
 
 
374 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.35358  normal  0.44345 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1434  isocitrate dehydrogenase  33.16 
 
 
338 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.13761  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2077  3-isopropylmalate dehydrogenase  33.42 
 
 
371 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1632  3-isopropylmalate dehydrogenase  30.9 
 
 
375 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.341727  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0664  isocitrate dehydrogenase  33.61 
 
 
335 aa  184  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.430122 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2146  3-isopropylmalate dehydrogenase  33.68 
 
 
321 aa  184  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0623  isocitrate dehydrogenase (NADP)  32.32 
 
 
342 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3224  3-isopropylmalate dehydrogenase  33.99 
 
 
337 aa  183  4.0000000000000006e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0214  Isocitrate dehydrogenase (NAD(+))  33.52 
 
 
342 aa  183  5.0000000000000004e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.6389  normal  0.0659244 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1279  3-isopropylmalate dehydrogenase  33.33 
 
 
364 aa  183  6e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0828  isocitrate dehydrogenase  33.52 
 
 
334 aa  182  9.000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.47191  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1947  3-isopropylmalate dehydrogenase  33.68 
 
 
373 aa  182  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.633607  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0187  3-isopropylmalate dehydrogenase  34.14 
 
 
375 aa  182  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.444073  hitchhiker  0.0060325 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2989  3-isopropylmalate dehydrogenase  34.82 
 
 
357 aa  182  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.128527  normal  0.6315 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3031  3-isopropylmalate dehydrogenase  34.82 
 
 
357 aa  182  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3600  3-isopropylmalate dehydrogenase  31.9 
 
 
332 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.177438 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10890  3-isopropylmalate dehydrogenase  33.96 
 
 
358 aa  181  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1020  3-isopropylmalate dehydrogenase  34.85 
 
 
356 aa  179  5.999999999999999e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0665  isocitrate dehydrogenase (NAD+)  33.68 
 
 
344 aa  179  8e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2219  3-isopropylmalate dehydrogenase  34.4 
 
 
355 aa  178  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.215948  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3335  isocitrate dehydrogenase  30.63 
 
 
482 aa  179  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.743871 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6014  3-isopropylmalate dehydrogenase  32.76 
 
 
345 aa  178  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.312267  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0248  3-isopropylmalate dehydrogenase  31.89 
 
 
338 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2896  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  31.51 
 
 
416 aa  177  4e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0310087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>