210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3149 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3149  ATPase-like  100 
 
 		 531 aa  1089    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  33.02 
 
 		 919 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0444  transcriptional regulator, LuxR family  32.39 
 
 		 938 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.192623  normal  0.240024 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  29.21 
 
 		 931 aa  111  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  30.38 
 
 		 824 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  25.81 
 
 		 816 aa  108  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  31.93 
 
 		 1085 aa  107  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  31.58 
 
 		 755 aa  107  8e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  28.83 
 
 		 840 aa  106  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  26.68 
 
 		 901 aa  106  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  27.11 
 
 		 1018 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  33.75 
 
 		 887 aa  105  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 1137 aa  105  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  30 
 
 		 975 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  26.77 
 
 		 999 aa  104  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  26.08 
 
 		 831 aa  103  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  30.28 
 
 		 957 aa  100  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3477  hypothetical protein  26.28 
 
 		 996 aa  99.8  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  30.93 
 
 		 969 aa  99.8  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  30.09 
 
 		 1076 aa  99  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  28.72 
 
 		 877 aa  98.6  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  30.91 
 
 		 1158 aa  98.6  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5401  transcriptional regulator, winged helix family  30.95 
 
 		 906 aa  98.6  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8841  ATPase-like protein  31.87 
 
 		 951 aa  97.8  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179034 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  30 
 
 		 922 aa  96.7  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3102  winged helix family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 1034 aa  95.1  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306498  normal  0.034161 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  29.49 
 
 		 966 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  27.2 
 
 		 1066 aa  95.9  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  26.23 
 
 		 950 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  29.88 
 
 		 952 aa  94.7  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6249  transcriptional regulator  31.64 
 
 		 1079 aa  94.7  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  28.2 
 
 		 812 aa  94.7  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  31.04 
 
 		 1043 aa  94  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  28.57 
 
 		 1058 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  28.22 
 
 		 1049 aa  92.8  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 1085 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  27.83 
 
 		 1092 aa  92.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  28.01 
 
 		 960 aa  92.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2185  transcriptional regulator, winged helix family  27.75 
 
 		 956 aa  92.4  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  29.21 
 
 		 1017 aa  91.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 393 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2380  transcriptional regulator  30.13 
 
 		 618 aa  91.3  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 882 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  29.54 
 
 		 1227 aa  90.9  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1023  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.61 
 
 		 1104 aa  90.5  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0903314  normal  0.811378 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2022  transcriptional regulator  31.54 
 
 		 1161 aa  90.5  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.899246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  29.52 
 
 		 1103 aa  89.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1121  transcriptional regulator, winged helix family  30.38 
 
 		 1060 aa  89.7  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.225478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  28.15 
 
 		 916 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  29.59 
 
 		 921 aa  89  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  28.77 
 
 		 1064 aa  89  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  26.71 
 
 		 701 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2391  transcriptional regulator  29.1 
 
 		 954 aa  89  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.814373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  27.88 
 
 		 792 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  29.41 
 
 		 1056 aa  89.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  31.29 
 
 		 765 aa  89.4  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 814 aa  88.2  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 799 aa  88.6  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  27.79 
 
 		 1097 aa  88.2  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  28.41 
 
 		 601 aa  88.6  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  30.97 
 
 		 1131 aa  88.6  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  30.45 
 
 		 961 aa  87.8  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  28.02 
 
 		 591 aa  87.4  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  29.81 
 
 		 1014 aa  87.8  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  30.2 
 
 		 928 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4693  transcriptional regulator, winged helix family  28.29 
 
 		 943 aa  87.4  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.493374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  29.92 
 
 		 1050 aa  86.7  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  29.25 
 
 		 760 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  28.16 
 
 		 953 aa  86.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  26.11 
 
 		 776 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 781 aa  85.9  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5183  XRE family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 804 aa  85.5  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.621684  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4526  transcriptional regulator  31.97 
 
 		 468 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  29.07 
 
 		 886 aa  84.7  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  28.53 
 
 		 1058 aa  84.7  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1350  transcriptional regulator, winged helix family  29.69 
 
 		 1100 aa  84.3  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.564198  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  29.26 
 
 		 943 aa  84.3  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  28.53 
 
 		 678 aa  84  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0434  tetratricopeptide TPR_4  30.6 
 
 		 907 aa  84  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253283  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  26.87 
 
 		 1093 aa  84  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  26.81 
 
 		 827 aa  83.6  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  31.15 
 
 		 1110 aa  83.6  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  28.3 
 
 		 591 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2820  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 418 aa  82.4  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.285285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  29.29 
 
 		 972 aa  82  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1608  XRE family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 802 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 910 aa  82.4  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  28.66 
 
 		 768 aa  82.4  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  26.91 
 
 		 1036 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  27.51 
 
 		 1042 aa  81.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1145  TPR repeat-containing protein  25.28 
 
 		 736 aa  81.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  28.57 
 
 		 1119 aa  81.6  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2248  transcriptional regulator  30.41 
 
 		 959 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3228  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 		 726 aa  81.6  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  28.18 
 
 		 1055 aa  81.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6569  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 1027 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  23.21 
 
 		 888 aa  79.7  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  28.79 
 
 		 1060 aa  79.3  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  28.13 
 
 		 601 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 1064 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>