More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0025 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3908  inner-membrane translocator  98.01 
 
 		 351 aa  674    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0025  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  100 
 
 		 351 aa  686    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.746489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3042  inner-membrane translocator  92.02 
 
 		 351 aa  630  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3272  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  80.34 
 
 		 351 aa  547  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0091  inner-membrane translocator  80.63 
 
 		 351 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0081  inner-membrane translocator  80.63 
 
 		 351 aa  545  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0090  inner-membrane translocator  80.34 
 
 		 351 aa  546  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4059  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  81.43 
 
 		 351 aa  531  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3000  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  81.71 
 
 		 351 aa  534  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.403467  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2941  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  81.71 
 
 		 351 aa  534  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0193  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  81.71 
 
 		 351 aa  534  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107939  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3323  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  81.43 
 
 		 397 aa  532  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3370  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  81.71 
 
 		 351 aa  534  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1602  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  81.71 
 
 		 351 aa  534  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3985  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  81.71 
 
 		 351 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0107  inner-membrane translocator  80.34 
 
 		 351 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2965  inner-membrane translocator  80.06 
 
 		 394 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.235343  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0090  inner-membrane translocator  80.06 
 
 		 394 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.823802  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3363  inner-membrane translocator  75.43 
 
 		 350 aa  496  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102738  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3512  inner-membrane translocator  76.29 
 
 		 350 aa  493  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0408964 
 
 
-
 
NC_003296  RS01744  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  74.29 
 
 		 350 aa  490  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.698868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4658  inner-membrane translocator  73.43 
 
 		 350 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.14788 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4526  inner-membrane translocator  73.43 
 
 		 350 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.141329  normal  0.558956 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3236  inner-membrane translocator  59.89 
 
 		 349 aa  412  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0230482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1518  inner-membrane translocator  63.71 
 
 		 345 aa  378  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0908  inner-membrane translocator:ABC transporter related  60.29 
 
 		 951 aa  375  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0412388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2942  inner-membrane translocator  62.29 
 
 		 345 aa  373  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.550413  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0990  inner-membrane translocator  59.6 
 
 		 345 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4098  inner-membrane translocator:ABC transporter related  61.1 
 
 		 950 aa  367  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0801  inner-membrane translocator  56.57 
 
 		 346 aa  364  1e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0268  inner-membrane translocator  55.59 
 
 		 345 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1821  inner-membrane translocator  51.43 
 
 		 345 aa  357  9.999999999999999e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.683409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1229  inner-membrane translocator  56.57 
 
 		 342 aa  343  2.9999999999999997e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3952  inner-membrane translocator  53.72 
 
 		 360 aa  331  9e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0573  inner-membrane translocator  58.92 
 
 		 342 aa  328  8e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.4403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5328  inner-membrane translocator  57.39 
 
 		 345 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0654205  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1995  inner-membrane translocator  52.99 
 
 		 346 aa  319  5e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3571  inner-membrane translocator  53.69 
 
 		 346 aa  318  6e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.16314 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7085  ABC transporter, permease protein  52.77 
 
 		 341 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4633  inner-membrane translocator  50.85 
 
 		 345 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0693  inner-membrane translocator  48.87 
 
 		 349 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3249  branched chain amino acid ABC transporter permease  49.29 
 
 		 347 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.174248  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0776  inner-membrane translocator  51.13 
 
 		 345 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.300879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1892  inner-membrane translocator  53.69 
 
 		 346 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.322186  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3891  ABC transporter ATPase component  50.42 
 
 		 954 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2424  inner-membrane translocator  57.95 
 
 		 349 aa  296  5e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.69608  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0996  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  44.32 
 
 		 357 aa  273  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.883581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2875  inner-membrane translocator  48.3 
 
 		 351 aa  273  4.0000000000000004e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.781578  normal  0.470002 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1505  inner-membrane translocator  48.09 
 
 		 351 aa  260  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122982  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2317  inner-membrane translocator  46.52 
 
 		 343 aa  240  2e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1327  inner-membrane translocator  44.35 
 
 		 343 aa  233  4.0000000000000004e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.492198  normal  0.0368007 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0892  inner-membrane translocator  32.22 
 
 		 290 aa  140  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0367  inner-membrane translocator  41.44 
 
 		 291 aa  138  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622442  unclonable  0.0000000514338 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  38.64 
 
 		 290 aa  132  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1516  inner-membrane translocator  40.47 
 
 		 291 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3104  inner-membrane translocator  36.45 
 
 		 293 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  35.34 
 
 		 294 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1483  inner-membrane translocator  36.49 
 
 		 295 aa  122  7e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2188  inner-membrane translocator  32.33 
 
 		 294 aa  117  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2039  inner-membrane translocator  30.19 
 
 		 294 aa  116  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000380808 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1822  inner-membrane translocator  28.48 
 
 		 294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0669  inner-membrane translocator  40.5 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0996  inner-membrane translocator  34.04 
 
 		 293 aa  114  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2129  inner-membrane translocator  34.47 
 
 		 294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1733  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.75 
 
 		 294 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.293981  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0679  inner-membrane translocator  34.91 
 
 		 290 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1672  inner-membrane translocator  31.78 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4550  inner-membrane translocator  40.1 
 
 		 290 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0834  inner-membrane translocator  32.73 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000998369  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4070  inner-membrane translocator  29.11 
 
 		 295 aa  102  9e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1046  inner-membrane translocator  34.45 
 
 		 289 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.316666 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3821  inner-membrane translocator  35.57 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1680  inner-membrane translocator  33.64 
 
 		 291 aa  100  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  31.58 
 
 		 300 aa  99.8  7e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1408  inner-membrane translocator  33.5 
 
 		 317 aa  95.5  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  27.67 
 
 		 287 aa  94.7  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3500  inner-membrane translocator  30.3 
 
 		 291 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.334303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  31.98 
 
 		 287 aa  92.8  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  35.68 
 
 		 290 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0290  inner-membrane translocator  30.69 
 
 		 306 aa  89.7  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0385  inner-membrane translocator  32.73 
 
 		 293 aa  89.7  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0487  inner-membrane translocator  31.87 
 
 		 307 aa  88.2  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3515  ABC transporter membrane spanning protein  28.7 
 
 		 300 aa  88.6  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  30.29 
 
 		 291 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3072  inner-membrane translocator  28.24 
 
 		 300 aa  86.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  28.03 
 
 		 293 aa  86.7  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  31.9 
 
 		 292 aa  86.7  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2739  inner-membrane translocator  27.27 
 
 		 290 aa  86.3  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2396  inner-membrane translocator  31.02 
 
 		 302 aa  85.9  9e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.228148  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3328  inner-membrane translocator  28.24 
 
 		 300 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166964  normal  0.584188 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  28.88 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0553  inner-membrane translocator  28.89 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0455233  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2501  inner-membrane translocator  27.76 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  26.02 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3980  ABC transporter permease  29.95 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0118656 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5101  inner-membrane translocator  30.67 
 
 		 603 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208256  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4866  inner-membrane translocator  28 
 
 		 304 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  hitchhiker  0.000815383 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4744  inner-membrane translocator  28 
 
 		 304 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579328  hitchhiker  0.000000155208 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2318  inner-membrane translocator  33.2 
 
 		 308 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4658  inner-membrane translocator  28 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026431 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>