More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5328 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5328  inner-membrane translocator  100 
 
 
345 aa  641    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0654205  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1995  inner-membrane translocator  61.45 
 
 
346 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3571  inner-membrane translocator  61.45 
 
 
346 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.16314 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1892  inner-membrane translocator  60.58 
 
 
346 aa  358  9e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.322186  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3908  inner-membrane translocator  58.76 
 
 
351 aa  349  3e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0025  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  59.15 
 
 
351 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.746489  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3363  inner-membrane translocator  59.26 
 
 
350 aa  341  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102738  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3042  inner-membrane translocator  56.78 
 
 
351 aa  339  4e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2942  inner-membrane translocator  58.55 
 
 
345 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.550413  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0091  inner-membrane translocator  56.13 
 
 
351 aa  334  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0908  inner-membrane translocator:ABC transporter related  58.67 
 
 
951 aa  333  2e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0412388  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0081  inner-membrane translocator  56.13 
 
 
351 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0268  inner-membrane translocator  54.49 
 
 
345 aa  332  6e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3512  inner-membrane translocator  59.09 
 
 
350 aa  332  6e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0408964 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0801  inner-membrane translocator  56.65 
 
 
346 aa  331  1e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01744  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  57.39 
 
 
350 aa  330  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.698868  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3985  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  57.95 
 
 
351 aa  329  4e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3272  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  55.27 
 
 
351 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0090  inner-membrane translocator  55.84 
 
 
351 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0990  inner-membrane translocator  57.97 
 
 
345 aa  329  5.0000000000000004e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4059  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  56.78 
 
 
351 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7085  ABC transporter, permease protein  56.43 
 
 
341 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1518  inner-membrane translocator  58.17 
 
 
345 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3000  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  56.78 
 
 
351 aa  326  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.403467  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2941  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  56.78 
 
 
351 aa  326  3e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1602  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  56.78 
 
 
351 aa  326  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3370  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  56.78 
 
 
351 aa  326  3e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0193  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  56.78 
 
 
351 aa  326  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107939  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3323  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  57.43 
 
 
397 aa  324  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0107  inner-membrane translocator  55.84 
 
 
351 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790851  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2965  inner-membrane translocator  55.84 
 
 
394 aa  318  7e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.235343  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0090  inner-membrane translocator  55.84 
 
 
394 aa  318  7e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.823802  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3236  inner-membrane translocator  50.43 
 
 
349 aa  316  4e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0230482  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4658  inner-membrane translocator  55.97 
 
 
350 aa  316  4e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.14788 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4526  inner-membrane translocator  55.97 
 
 
350 aa  316  4e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.141329  normal  0.558956 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4098  inner-membrane translocator:ABC transporter related  57.68 
 
 
950 aa  315  6e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0573  inner-membrane translocator  60.69 
 
 
342 aa  314  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.4403  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1821  inner-membrane translocator  48.71 
 
 
345 aa  306  3e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.683409  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4633  inner-membrane translocator  54.49 
 
 
345 aa  298  8e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1229  inner-membrane translocator  55.2 
 
 
342 aa  298  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0776  inner-membrane translocator  54.2 
 
 
345 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.300879  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3952  inner-membrane translocator  54.29 
 
 
360 aa  294  2e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0996  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  47.32 
 
 
357 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.883581  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3249  branched chain amino acid ABC transporter permease  46.22 
 
 
347 aa  270  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.174248  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0693  inner-membrane translocator  47.14 
 
 
349 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3891  ABC transporter ATPase component  46.67 
 
 
954 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2424  inner-membrane translocator  54.89 
 
 
349 aa  260  3e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.69608  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2317  inner-membrane translocator  47.18 
 
 
343 aa  229  4e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1327  inner-membrane translocator  46.15 
 
 
343 aa  229  6e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.492198  normal  0.0368007 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2875  inner-membrane translocator  46.2 
 
 
351 aa  220  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.781578  normal  0.470002 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1505  inner-membrane translocator  46.02 
 
 
351 aa  209  6e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122982  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  33.94 
 
 
290 aa  135  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0892  inner-membrane translocator  39.55 
 
 
290 aa  132  6.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2188  inner-membrane translocator  30.98 
 
 
294 aa  129  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0367  inner-membrane translocator  39.38 
 
 
291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622442  unclonable  0.0000000514338 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3104  inner-membrane translocator  32.7 
 
 
293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0996  inner-membrane translocator  28.9 
 
 
293 aa  125  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2039  inner-membrane translocator  31.09 
 
 
294 aa  124  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000380808 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  31.33 
 
 
294 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1516  inner-membrane translocator  39.9 
 
 
291 aa  119  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1483  inner-membrane translocator  46.85 
 
 
295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2129  inner-membrane translocator  36.79 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1408  inner-membrane translocator  34.37 
 
 
317 aa  114  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0669  inner-membrane translocator  37.62 
 
 
294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3500  inner-membrane translocator  33.43 
 
 
291 aa  112  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.334303  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4070  inner-membrane translocator  30.03 
 
 
295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1822  inner-membrane translocator  29.39 
 
 
294 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1733  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.03 
 
 
294 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.293981  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3821  inner-membrane translocator  36.81 
 
 
293 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  30.03 
 
 
311 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0385  inner-membrane translocator  32.54 
 
 
293 aa  107  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0679  inner-membrane translocator  32.22 
 
 
290 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  28.45 
 
 
319 aa  105  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4550  inner-membrane translocator  38.58 
 
 
290 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  33.8 
 
 
290 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  29.27 
 
 
291 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1672  inner-membrane translocator  36.79 
 
 
299 aa  103  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1046  inner-membrane translocator  35.89 
 
 
289 aa  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.316666 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2866  inner-membrane translocator  30.31 
 
 
311 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.631221  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0835  inner-membrane translocator  34.4 
 
 
301 aa  98.2  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0834  inner-membrane translocator  28.53 
 
 
300 aa  98.2  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000998369  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0785  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.42 
 
 
316 aa  97.1  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  33.78 
 
 
300 aa  97.1  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.42 
 
 
316 aa  97.1  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  31.4 
 
 
316 aa  97.1  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  30.42 
 
 
316 aa  97.1  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.42 
 
 
316 aa  96.7  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6015  inner-membrane translocator  29.5 
 
 
291 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00174131 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2739  inner-membrane translocator  31.19 
 
 
290 aa  96.3  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0983  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.42 
 
 
316 aa  95.9  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156629  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2440  putative amino-acid transmembrane ABC transporter protein  33.18 
 
 
311 aa  95.1  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4757  inner-membrane translocator  30.58 
 
 
317 aa  95.5  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5829  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  30 
 
 
316 aa  95.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.903514  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0797  inner-membrane translocator  29.58 
 
 
316 aa  94.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.320354 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  27.71 
 
 
309 aa  94.7  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  28 
 
 
308 aa  94  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  32.99 
 
 
287 aa  94.4  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1680  inner-membrane translocator  31.21 
 
 
291 aa  93.6  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2522  inner-membrane translocator  29.58 
 
 
316 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1886  inner-membrane translocator  29.58 
 
 
316 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>