More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0892 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0892  inner-membrane translocator  100 
 
 
290 aa  551  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  65.86 
 
 
290 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0679  inner-membrane translocator  71.38 
 
 
290 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4550  inner-membrane translocator  71.03 
 
 
290 aa  364  1e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0367  inner-membrane translocator  62.07 
 
 
291 aa  345  5e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622442  unclonable  0.0000000514338 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1516  inner-membrane translocator  60.9 
 
 
291 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  51.89 
 
 
294 aa  298  5e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2188  inner-membrane translocator  51.03 
 
 
294 aa  287  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2129  inner-membrane translocator  50.86 
 
 
294 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0996  inner-membrane translocator  50 
 
 
293 aa  273  3e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2039  inner-membrane translocator  50.17 
 
 
294 aa  271  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000380808 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1672  inner-membrane translocator  50.34 
 
 
299 aa  264  1e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1822  inner-membrane translocator  47.24 
 
 
294 aa  259  4e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1733  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  48.28 
 
 
294 aa  247  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.293981  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0834  inner-membrane translocator  46.71 
 
 
300 aa  243  3e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000998369  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4070  inner-membrane translocator  50.35 
 
 
295 aa  242  5e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1680  inner-membrane translocator  48.62 
 
 
291 aa  240  2.9999999999999997e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1046  inner-membrane translocator  47.59 
 
 
289 aa  236  4e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.316666 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0385  inner-membrane translocator  51.77 
 
 
293 aa  226  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3104  inner-membrane translocator  43.94 
 
 
293 aa  222  7e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1483  inner-membrane translocator  46.07 
 
 
295 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0669  inner-membrane translocator  46.37 
 
 
294 aa  207  1e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3821  inner-membrane translocator  46.71 
 
 
293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1408  inner-membrane translocator  45.8 
 
 
317 aa  196  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1865  inner-membrane translocator  40.75 
 
 
294 aa  192  6e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6490  inner-membrane translocator  38.97 
 
 
291 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0479005  normal  0.485877 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3768  inner-membrane translocator  39.18 
 
 
291 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.179629 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1651  inner-membrane translocator  36.77 
 
 
291 aa  178  7e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6586  inner-membrane translocator  39.73 
 
 
291 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  39.02 
 
 
287 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1696  inner-membrane translocator  38.46 
 
 
291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3367  inner-membrane translocator  39.52 
 
 
291 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0478  inner-membrane translocator  39.45 
 
 
290 aa  172  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164888  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  37.63 
 
 
287 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6015  inner-membrane translocator  38.57 
 
 
291 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00174131 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1479  inner-membrane translocator  38.05 
 
 
302 aa  170  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  37.54 
 
 
301 aa  171  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  37.59 
 
 
291 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  36.27 
 
 
319 aa  168  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2751  inner-membrane translocator  36.54 
 
 
301 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2500  inner-membrane translocator  38.11 
 
 
287 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3980  ABC transporter permease  36.93 
 
 
287 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0118656 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2396  inner-membrane translocator  36.12 
 
 
302 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.228148  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1849  inner-membrane translocator  34.71 
 
 
291 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal  0.118432 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0914  inner-membrane translocator  37.46 
 
 
291 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3707  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.11 
 
 
291 aa  165  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.229916  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0461  inner-membrane translocator  35.45 
 
 
298 aa  165  9e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0110  inner-membrane translocator  39.45 
 
 
295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185553  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  37.29 
 
 
308 aa  163  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  32.79 
 
 
338 aa  162  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  35 
 
 
300 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.95 
 
 
319 aa  162  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1619  inner-membrane translocator  37.11 
 
 
290 aa  162  7e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.755467  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  37.95 
 
 
308 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  37.95 
 
 
319 aa  161  9e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  37.95 
 
 
319 aa  161  9e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  37.95 
 
 
308 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2608  inner-membrane translocator  34.9 
 
 
302 aa  161  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2739  inner-membrane translocator  35.74 
 
 
290 aa  161  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  37.95 
 
 
308 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3687  inner-membrane translocator  36.52 
 
 
291 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  33.87 
 
 
311 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2501  inner-membrane translocator  35.35 
 
 
302 aa  160  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  36.18 
 
 
290 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  33.44 
 
 
309 aa  160  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2253  inner-membrane translocator  35.81 
 
 
301 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.95 
 
 
308 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.95 
 
 
308 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  37.95 
 
 
308 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  37.62 
 
 
308 aa  159  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2082  inner-membrane translocator  36.21 
 
 
289 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.936766  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3172  inner-membrane translocator  32.79 
 
 
309 aa  159  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.538875  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0259  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.43 
 
 
301 aa  159  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0359  inner-membrane translocator  37.75 
 
 
300 aa  159  6e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0998  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.09 
 
 
289 aa  159  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.301783  normal  0.758902 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0473  inner-membrane translocator  35.53 
 
 
301 aa  158  8e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  36.61 
 
 
292 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1837  inner-membrane translocator  36.15 
 
 
296 aa  157  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000968352  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2318  inner-membrane translocator  37.7 
 
 
308 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2479  inner-membrane translocator  39.02 
 
 
308 aa  155  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  32.14 
 
 
309 aa  155  7e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  32.42 
 
 
293 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1797  inner-membrane translocator  36.73 
 
 
290 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.160989 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.48 
 
 
291 aa  154  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2283  inner-membrane translocator  32.66 
 
 
295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.02 
 
 
293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3520  inner-membrane translocator  36.08 
 
 
291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1288  inner-membrane translocator  33.44 
 
 
309 aa  153  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3364  inner-membrane translocator  32.8 
 
 
309 aa  152  5e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.320486 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2712  inner-membrane translocator  32.8 
 
 
309 aa  152  5e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1871  inner-membrane translocator  36.84 
 
 
308 aa  152  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.384431  normal  0.0224958 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0835  inner-membrane translocator  34.77 
 
 
301 aa  152  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0611  inner-membrane translocator  37.63 
 
 
304 aa  152  5.9999999999999996e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2105  inner-membrane translocator  33.12 
 
 
309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4061  inner-membrane translocator  37.11 
 
 
291 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0336  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.15 
 
 
294 aa  152  7e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2440  putative amino-acid transmembrane ABC transporter protein  33.87 
 
 
311 aa  151  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3415  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33 
 
 
297 aa  151  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.15 
 
 
294 aa  151  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3796  inner-membrane translocator  33.23 
 
 
309 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>