More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1862 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  100 
 
 
294 aa  570  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1672  inner-membrane translocator  82.07 
 
 
299 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2129  inner-membrane translocator  76.19 
 
 
294 aa  436  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2188  inner-membrane translocator  73.81 
 
 
294 aa  433  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1822  inner-membrane translocator  73.47 
 
 
294 aa  419  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2039  inner-membrane translocator  74.15 
 
 
294 aa  409  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000380808 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1733  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  75.17 
 
 
294 aa  404  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.293981  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0996  inner-membrane translocator  61.38 
 
 
293 aa  353  1e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0367  inner-membrane translocator  53.98 
 
 
291 aa  308  5e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622442  unclonable  0.0000000514338 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0892  inner-membrane translocator  51.89 
 
 
290 aa  298  5e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4070  inner-membrane translocator  52.4 
 
 
295 aa  279  4e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  48.97 
 
 
290 aa  275  5e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1516  inner-membrane translocator  51.89 
 
 
291 aa  275  8e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0834  inner-membrane translocator  48.79 
 
 
300 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000998369  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1483  inner-membrane translocator  47.54 
 
 
295 aa  263  2e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0679  inner-membrane translocator  52.41 
 
 
290 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4550  inner-membrane translocator  51.72 
 
 
290 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1680  inner-membrane translocator  49.48 
 
 
291 aa  259  5.0000000000000005e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0385  inner-membrane translocator  48.95 
 
 
293 aa  256  3e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1046  inner-membrane translocator  49.13 
 
 
289 aa  251  9.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.316666 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1408  inner-membrane translocator  51.57 
 
 
317 aa  245  4.9999999999999997e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3104  inner-membrane translocator  45.24 
 
 
293 aa  244  9e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0669  inner-membrane translocator  48.98 
 
 
294 aa  236  4e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6490  inner-membrane translocator  39.45 
 
 
291 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0479005  normal  0.485877 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3821  inner-membrane translocator  46.78 
 
 
293 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6586  inner-membrane translocator  37.72 
 
 
291 aa  206  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1651  inner-membrane translocator  40.55 
 
 
291 aa  199  5e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6015  inner-membrane translocator  38.06 
 
 
291 aa  194  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00174131 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0110  inner-membrane translocator  40.83 
 
 
295 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185553  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3500  inner-membrane translocator  41.11 
 
 
291 aa  188  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.334303  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1865  inner-membrane translocator  37.67 
 
 
294 aa  187  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1696  inner-membrane translocator  38.81 
 
 
291 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1849  inner-membrane translocator  37.46 
 
 
291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal  0.118432 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2283  inner-membrane translocator  36.3 
 
 
295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  35.64 
 
 
319 aa  181  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.1 
 
 
291 aa  180  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3768  inner-membrane translocator  38.54 
 
 
291 aa  179  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.179629 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0356  inner-membrane translocator  36.77 
 
 
292 aa  177  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  35.6 
 
 
338 aa  178  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0914  inner-membrane translocator  37.37 
 
 
291 aa  176  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  37.8 
 
 
292 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3172  inner-membrane translocator  34.2 
 
 
309 aa  176  4e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.538875  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3707  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.37 
 
 
291 aa  176  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.229916  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3687  inner-membrane translocator  37.11 
 
 
291 aa  175  8e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2105  inner-membrane translocator  33.77 
 
 
309 aa  175  9e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  34.43 
 
 
309 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  35.07 
 
 
291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  35.03 
 
 
293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  37.5 
 
 
308 aa  172  7.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3796  inner-membrane translocator  34.1 
 
 
309 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  37.24 
 
 
290 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1288  inner-membrane translocator  33.77 
 
 
309 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  36.36 
 
 
308 aa  170  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2712  inner-membrane translocator  34.43 
 
 
309 aa  169  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  36.36 
 
 
308 aa  170  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3364  inner-membrane translocator  34.43 
 
 
309 aa  169  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.320486 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  33.77 
 
 
309 aa  169  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1837  inner-membrane translocator  36.86 
 
 
296 aa  169  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000968352  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0728  inner-membrane translocator  36.6 
 
 
303 aa  169  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3367  inner-membrane translocator  38.54 
 
 
291 aa  169  7e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  34.85 
 
 
311 aa  168  9e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  36.49 
 
 
287 aa  168  9e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2501  inner-membrane translocator  36.05 
 
 
302 aa  168  9e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.123023 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  37.46 
 
 
308 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3499  inner-membrane translocator  38.14 
 
 
291 aa  168  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0998  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.8 
 
 
289 aa  167  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.301783  normal  0.758902 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3394  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.86 
 
 
291 aa  167  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.36 
 
 
293 aa  167  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  36.63 
 
 
301 aa  167  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1163  inner-membrane translocator  37.37 
 
 
290 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0535977  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1797  inner-membrane translocator  37.02 
 
 
290 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.160989 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2739  inner-membrane translocator  34.72 
 
 
290 aa  166  4e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0298  inner-membrane translocator  37.02 
 
 
290 aa  166  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.474045  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.96 
 
 
308 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  36.96 
 
 
308 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0611  inner-membrane translocator  35.03 
 
 
300 aa  165  8e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.96 
 
 
308 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2396  inner-membrane translocator  34.88 
 
 
302 aa  165  8e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.228148  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  36.3 
 
 
308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5354  inner-membrane translocator  33.44 
 
 
309 aa  165  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.764467 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3837  inner-membrane translocator  36.84 
 
 
287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622329  normal  0.114435 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1161  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.25 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0771  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.25 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.171374  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4061  inner-membrane translocator  38.01 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0686  inner-membrane translocator  34.8 
 
 
294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.215766  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2472  inner-membrane translocator  36.36 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1751  inner-membrane translocator  34.88 
 
 
304 aa  163  3e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.48853  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  33.99 
 
 
300 aa  163  3e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1596  inner-membrane translocator  40.69 
 
 
292 aa  163  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2753  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.45 
 
 
290 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110353  normal  0.248126 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2366  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.21 
 
 
299 aa  163  4.0000000000000004e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00045769  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  35.53 
 
 
308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.97 
 
 
319 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0402  inner-membrane translocator  37.28 
 
 
296 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1036  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.56 
 
 
298 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.203386  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  36.15 
 
 
293 aa  162  5.0000000000000005e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0528  inner-membrane translocator  34.36 
 
 
292 aa  162  6e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00118598  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  35.97 
 
 
308 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  35.97 
 
 
308 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  35.97 
 
 
308 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>