More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1036 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1161  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  99.66 
 
 
298 aa  582  1.0000000000000001e-165  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1036  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  100 
 
 
298 aa  582  1.0000000000000001e-165  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.203386  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0771  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  97.99 
 
 
298 aa  575  1.0000000000000001e-163  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.171374  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  80.87 
 
 
298 aa  470  1.0000000000000001e-131  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0400  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  73.83 
 
 
298 aa  431  1e-120  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0611  inner-membrane translocator  65.22 
 
 
300 aa  391  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0476  inner-membrane translocator  69.73 
 
 
294 aa  352  5e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000639069  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0612  inner-membrane translocator  50.34 
 
 
297 aa  306  3e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2934  inner-membrane translocator  50 
 
 
297 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.84432  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1066  inner-membrane translocator  48.31 
 
 
297 aa  284  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00641991  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0861  inner-membrane translocator  50.35 
 
 
287 aa  280  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0266  inner-membrane translocator  46.13 
 
 
304 aa  270  2e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000146885  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0636  inner-membrane translocator  48.31 
 
 
297 aa  261  1e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000266086  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1675  inner-membrane translocator  51.37 
 
 
299 aa  259  4e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.644536  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1609  inner-membrane translocator  51.37 
 
 
299 aa  249  4e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171183  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1391  inner-membrane translocator  47.2 
 
 
294 aa  249  5e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  47.1 
 
 
292 aa  247  1e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  43.92 
 
 
300 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  45.02 
 
 
292 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  46.32 
 
 
293 aa  242  7e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0933  inner-membrane translocator  50.35 
 
 
293 aa  238  1e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000263386  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1721  inner-membrane translocator  45.86 
 
 
290 aa  236  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.021923  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.69 
 
 
291 aa  236  3e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2239  inner-membrane translocator  45.76 
 
 
293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1470  inner-membrane translocator  49.14 
 
 
303 aa  233  2.0000000000000002e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000609121  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1581  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  45.86 
 
 
289 aa  232  7.000000000000001e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000593948  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0785  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.44 
 
 
316 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3292  hypothetical protein  41.1 
 
 
301 aa  231  1e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518243 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  42.12 
 
 
316 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  42.12 
 
 
316 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  42.12 
 
 
316 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  45.07 
 
 
319 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  45.07 
 
 
308 aa  230  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  44.74 
 
 
308 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  44.74 
 
 
308 aa  229  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0983  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  41.8 
 
 
316 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156629  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  44.74 
 
 
308 aa  229  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  44.74 
 
 
319 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  44.74 
 
 
319 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  45.73 
 
 
291 aa  229  5e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  44.71 
 
 
293 aa  228  7e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6112  inner-membrane translocator  42.12 
 
 
316 aa  228  9e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2415  inner-membrane translocator  42.12 
 
 
316 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911595  normal  0.010798 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  44.74 
 
 
308 aa  227  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2544  inner-membrane translocator  42.12 
 
 
316 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995133  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  44.74 
 
 
308 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5829  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  41.8 
 
 
316 aa  227  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.903514  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  43.42 
 
 
293 aa  227  2e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  44.74 
 
 
308 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  44.74 
 
 
308 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0797  inner-membrane translocator  42.44 
 
 
316 aa  227  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.320354 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  42.77 
 
 
316 aa  226  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2522  inner-membrane translocator  41.48 
 
 
316 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1886  inner-membrane translocator  41.48 
 
 
316 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2497  inner-membrane translocator  41.48 
 
 
316 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260851  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2318  inner-membrane translocator  45.21 
 
 
308 aa  224  9e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  44.63 
 
 
308 aa  223  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0534  inner-membrane translocator  44.25 
 
 
290 aa  224  2e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000179103 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  44.63 
 
 
308 aa  223  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4757  inner-membrane translocator  42.77 
 
 
317 aa  223  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0399  branched chain amino acid ABC transporter permease  45.33 
 
 
294 aa  223  3e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.615306  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1387  inner-membrane translocator  44.37 
 
 
294 aa  222  6e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3172  inner-membrane translocator  42.53 
 
 
309 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.538875  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2479  inner-membrane translocator  44.74 
 
 
308 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  41.86 
 
 
309 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  43.62 
 
 
308 aa  219  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2501  inner-membrane translocator  44.11 
 
 
302 aa  219  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.123023 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2712  inner-membrane translocator  40.66 
 
 
309 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3364  inner-membrane translocator  40.66 
 
 
309 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.320486 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  42.67 
 
 
311 aa  219  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3394  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  44.52 
 
 
291 aa  218  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  41.56 
 
 
309 aa  218  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0822  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  42.12 
 
 
316 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221033  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6412  inner-membrane translocator  41.48 
 
 
316 aa  216  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  41.56 
 
 
338 aa  216  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1871  inner-membrane translocator  43.96 
 
 
308 aa  216  5e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.384431  normal  0.0224958 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2115  inner-membrane translocator  43.96 
 
 
304 aa  215  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.592251  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2608  inner-membrane translocator  43.71 
 
 
302 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3796  inner-membrane translocator  40.53 
 
 
309 aa  212  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3871  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  41.14 
 
 
308 aa  212  7e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.911793  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2492  inner-membrane translocator  42.38 
 
 
304 aa  212  7e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.366827  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  40.26 
 
 
319 aa  211  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0229  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  40.8 
 
 
308 aa  211  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.689889 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0835  inner-membrane translocator  42.66 
 
 
301 aa  211  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5354  inner-membrane translocator  41.23 
 
 
309 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.764467 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  41.06 
 
 
308 aa  209  4e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3104  inner-membrane translocator  42.9 
 
 
310 aa  209  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.60376 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0487  inner-membrane translocator  43.28 
 
 
307 aa  209  6e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0461  inner-membrane translocator  42.42 
 
 
298 aa  208  7e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4260  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  45.9 
 
 
310 aa  209  7e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3515  ABC transporter membrane spanning protein  43.2 
 
 
300 aa  208  8e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2396  inner-membrane translocator  42.19 
 
 
302 aa  208  8e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.228148  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  41.41 
 
 
301 aa  208  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4394  inner-membrane translocator  45.57 
 
 
310 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3667  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  40.47 
 
 
308 aa  208  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.344938  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3973  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  40.47 
 
 
308 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4415  inner-membrane translocator  45.57 
 
 
310 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0245  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  40.47 
 
 
308 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4415  inner-membrane translocator  45.87 
 
 
309 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.550314  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3144  inner-membrane translocator  42.12 
 
 
316 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00376696  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>