More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4925 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  100 
 
 		 293 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  63.14 
 
 		 291 aa  343  2e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  54.21 
 
 		 300 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2239  inner-membrane translocator  56.01 
 
 		 293 aa  288  8e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  52.7 
 
 		 293 aa  276  3e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0534  inner-membrane translocator  53.26 
 
 		 290 aa  276  4e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000179103 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2501  inner-membrane translocator  52.38 
 
 		 302 aa  275  7e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.123023 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1387  inner-membrane translocator  51.37 
 
 		 294 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  50 
 
 		 292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  51.02 
 
 		 292 aa  273  3e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1391  inner-membrane translocator  50.17 
 
 		 294 aa  270  2e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0461  inner-membrane translocator  47.99 
 
 		 298 aa  269  2.9999999999999997e-71  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  48.63 
 
 		 291 aa  268  5.9999999999999995e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  50.5 
 
 		 308 aa  266  4e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  48.4 
 
 		 316 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5829  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  49.04 
 
 		 316 aa  263  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.903514  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0785  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  48.08 
 
 		 316 aa  263  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0983  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  48.4 
 
 		 316 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156629  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  48.72 
 
 		 316 aa  263  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  48.08 
 
 		 316 aa  262  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  48.08 
 
 		 316 aa  262  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0797  inner-membrane translocator  48.4 
 
 		 316 aa  262  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.320354 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6112  inner-membrane translocator  48.72 
 
 		 316 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1886  inner-membrane translocator  48.72 
 
 		 316 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2544  inner-membrane translocator  48.72 
 
 		 316 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995133  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2497  inner-membrane translocator  48.72 
 
 		 316 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260851  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2415  inner-membrane translocator  48.72 
 
 		 316 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911595  normal  0.010798 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2522  inner-membrane translocator  48.72 
 
 		 316 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0933  inner-membrane translocator  49.31 
 
 		 293 aa  259  4e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000263386  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0822  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  48.72 
 
 		 316 aa  258  8e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221033  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1581  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  48.97 
 
 		 289 aa  256  2e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000593948  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  50.51 
 
 		 293 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6412  inner-membrane translocator  47.44 
 
 		 316 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0266  inner-membrane translocator  47.67 
 
 		 304 aa  250  2e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000146885  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4757  inner-membrane translocator  46.79 
 
 		 317 aa  250  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  45.6 
 
 		 311 aa  246  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0399  branched chain amino acid ABC transporter permease  48.08 
 
 		 294 aa  246  3e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.615306  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1675  inner-membrane translocator  48.32 
 
 		 299 aa  246  4e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.644536  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1721  inner-membrane translocator  49.83 
 
 		 290 aa  245  6.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.021923  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3144  inner-membrane translocator  48.08 
 
 		 316 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00376696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2934  inner-membrane translocator  46.8 
 
 		 297 aa  242  6e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.84432  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  47.67 
 
 		 308 aa  241  7.999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  46.49 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  46.49 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3394  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  50.17 
 
 		 291 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  44.34 
 
 		 301 aa  239  5e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1609  inner-membrane translocator  48.32 
 
 		 299 aa  239  5e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171183  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2751  inner-membrane translocator  45.67 
 
 		 301 aa  239  5e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0099  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  47.18 
 
 		 308 aa  238  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3667  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  46.84 
 
 		 308 aa  237  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.344938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0229  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  46.51 
 
 		 308 aa  237  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.689889 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3973  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  46.84 
 
 		 308 aa  237  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0245  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  46.84 
 
 		 308 aa  237  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0105  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  46.84 
 
 		 308 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2318  inner-membrane translocator  45.93 
 
 		 311 aa  235  6e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249302  hitchhiker  0.00247249 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2708  inner-membrane translocator  45.93 
 
 		 311 aa  235  7e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.489693  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2440  putative amino-acid transmembrane ABC transporter protein  45.6 
 
 		 311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3681  inner-membrane translocator  43.09 
 
 		 305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.911027  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1791  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  45 
 
 		 302 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  44.55 
 
 		 308 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  43.97 
 
 		 309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2866  inner-membrane translocator  45.93 
 
 		 311 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.631221  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  44.55 
 
 		 319 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  44.55 
 
 		 308 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  44.55 
 
 		 319 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2608  inner-membrane translocator  44.97 
 
 		 302 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  44.55 
 
 		 308 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1725  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  45 
 
 		 302 aa  232  4.0000000000000004e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0259  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.85 
 
 		 301 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3172  inner-membrane translocator  43.83 
 
 		 309 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.538875  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3871  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  46.18 
 
 		 308 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.911793  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5323  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter (permease protein)  43.23 
 
 		 305 aa  232  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.446123 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  43.89 
 
 		 308 aa  232  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4058  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  46.51 
 
 		 308 aa  232  5e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.89 
 
 		 308 aa  232  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.89 
 
 		 308 aa  232  5e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  44.55 
 
 		 319 aa  232  6e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2396  inner-membrane translocator  45.3 
 
 		 302 aa  231  8.000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.228148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  43.71 
 
 		 308 aa  231  9e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3796  inner-membrane translocator  44.3 
 
 		 309 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1622  inner-membrane translocator  41.72 
 
 		 304 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.937087 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2272  inner-membrane translocator  50 
 
 		 291 aa  231  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.711778 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  43.89 
 
 		 308 aa  229  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1943  inner-membrane translocator  49.66 
 
 		 291 aa  229  3e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3323  inner-membrane translocator  42.67 
 
 		 309 aa  230  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1779  inner-membrane translocator  42.11 
 
 		 305 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601101  normal  0.644499 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2253  inner-membrane translocator  44.67 
 
 		 301 aa  229  4e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4415  inner-membrane translocator  47.56 
 
 		 309 aa  229  5e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.550314  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1161  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  44.71 
 
 		 298 aa  228  6e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1036  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  44.71 
 
 		 298 aa  228  7e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.203386  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1112  inner-membrane translocator  44.33 
 
 		 302 aa  228  9e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0612  inner-membrane translocator  42.57 
 
 		 297 aa  228  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2318  inner-membrane translocator  44.22 
 
 		 308 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0759  inner-membrane translocator  43.83 
 
 		 311 aa  226  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000754526 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0835  inner-membrane translocator  44.19 
 
 		 301 aa  227  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  42.67 
 
 		 309 aa  226  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0400  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  43.15 
 
 		 298 aa  226  4e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0728  inner-membrane translocator  45.15 
 
 		 303 aa  226  4e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0487  inner-membrane translocator  42.47 
 
 		 307 aa  226  5.0000000000000005e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3336  inner-membrane translocator  46.56 
 
 		 307 aa  225  6e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>