More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3104 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3104  inner-membrane translocator  100 
 
 
293 aa  568  1e-161  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  45.24 
 
 
294 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0996  inner-membrane translocator  45.86 
 
 
293 aa  245  6.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2188  inner-membrane translocator  43.58 
 
 
294 aa  242  7e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  47.06 
 
 
290 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0669  inner-membrane translocator  50.35 
 
 
294 aa  236  4e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2129  inner-membrane translocator  44.56 
 
 
294 aa  231  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0367  inner-membrane translocator  44.29 
 
 
291 aa  230  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622442  unclonable  0.0000000514338 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0892  inner-membrane translocator  43.94 
 
 
290 aa  229  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3821  inner-membrane translocator  48.46 
 
 
293 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1822  inner-membrane translocator  42.91 
 
 
294 aa  226  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1672  inner-membrane translocator  45.36 
 
 
299 aa  226  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2039  inner-membrane translocator  43.58 
 
 
294 aa  225  6e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000380808 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1680  inner-membrane translocator  47.4 
 
 
291 aa  217  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1046  inner-membrane translocator  45.83 
 
 
289 aa  217  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.316666 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1516  inner-membrane translocator  43.79 
 
 
291 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1483  inner-membrane translocator  42.81 
 
 
295 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1733  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  44.26 
 
 
294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.293981  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0834  inner-membrane translocator  45.52 
 
 
300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000998369  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4070  inner-membrane translocator  45.39 
 
 
295 aa  208  9e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4550  inner-membrane translocator  45.7 
 
 
290 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0385  inner-membrane translocator  42.27 
 
 
293 aa  195  8.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1865  inner-membrane translocator  40.61 
 
 
294 aa  193  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0679  inner-membrane translocator  44.64 
 
 
290 aa  191  9e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1408  inner-membrane translocator  41.4 
 
 
317 aa  191  9e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  36.69 
 
 
319 aa  180  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  36.75 
 
 
300 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  36.68 
 
 
291 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0461  inner-membrane translocator  35.23 
 
 
298 aa  165  6.9999999999999995e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  34.78 
 
 
293 aa  162  6e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  36.55 
 
 
290 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.29 
 
 
316 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  35.81 
 
 
308 aa  157  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  33.99 
 
 
301 aa  158  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0359  inner-membrane translocator  36.21 
 
 
300 aa  157  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4757  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
317 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  33.97 
 
 
316 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.97 
 
 
316 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0983  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.97 
 
 
316 aa  156  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156629  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0785  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.97 
 
 
316 aa  157  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0110  inner-membrane translocator  37.07 
 
 
295 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185553  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.33 
 
 
293 aa  156  5.0000000000000005e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3500  inner-membrane translocator  38.54 
 
 
291 aa  155  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.334303  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  34.67 
 
 
292 aa  155  7e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2500  inner-membrane translocator  35.82 
 
 
287 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2396  inner-membrane translocator  34.44 
 
 
302 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.228148  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  32.05 
 
 
316 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0835  inner-membrane translocator  35.55 
 
 
301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0290  inner-membrane translocator  35.74 
 
 
306 aa  153  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1651  inner-membrane translocator  31.38 
 
 
291 aa  152  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5829  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.65 
 
 
316 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.903514  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0797  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
316 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.320354 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6412  inner-membrane translocator  33.97 
 
 
316 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.15 
 
 
291 aa  151  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2283  inner-membrane translocator  33.79 
 
 
295 aa  151  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  35.29 
 
 
308 aa  151  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2522  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
316 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  35.29 
 
 
308 aa  151  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2608  inner-membrane translocator  34.87 
 
 
302 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1886  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
316 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2739  inner-membrane translocator  30.45 
 
 
290 aa  151  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2497  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
316 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260851  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2415  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
316 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911595  normal  0.010798 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2544  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
316 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995133  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6112  inner-membrane translocator  33.01 
 
 
316 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  33.76 
 
 
308 aa  149  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0822  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.05 
 
 
316 aa  149  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221033  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  34.08 
 
 
308 aa  149  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  32.53 
 
 
291 aa  148  9e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.76 
 
 
319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  33.76 
 
 
308 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3768  inner-membrane translocator  33.45 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.179629 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  33.44 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  33.76 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  33.76 
 
 
319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  33.76 
 
 
319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2253  inner-membrane translocator  33.99 
 
 
301 aa  146  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6490  inner-membrane translocator  35.17 
 
 
291 aa  146  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0479005  normal  0.485877 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4054  inner-membrane translocator  36.05 
 
 
299 aa  145  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2366  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.44 
 
 
299 aa  144  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00045769  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6586  inner-membrane translocator  34.83 
 
 
291 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4940  inner-membrane translocator  37.11 
 
 
291 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1849  inner-membrane translocator  31.38 
 
 
291 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal  0.118432 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3707  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.76 
 
 
291 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.229916  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3144  inner-membrane translocator  32.05 
 
 
316 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00376696  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  33.76 
 
 
308 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1619  inner-membrane translocator  32.86 
 
 
290 aa  143  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.755467  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3367  inner-membrane translocator  34.16 
 
 
291 aa  143  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0914  inner-membrane translocator  35.76 
 
 
291 aa  143  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3304  inner-membrane translocator  34.83 
 
 
289 aa  142  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1479  inner-membrane translocator  34.67 
 
 
302 aa  142  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2751  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
301 aa  142  8e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2440  putative amino-acid transmembrane ABC transporter protein  32.25 
 
 
311 aa  142  9e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6015  inner-membrane translocator  35.42 
 
 
291 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00174131 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  34.44 
 
 
308 aa  141  9.999999999999999e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0473  inner-membrane translocator  34.2 
 
 
301 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3836  inner-membrane translocator  35.99 
 
 
289 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2239  inner-membrane translocator  35.02 
 
 
293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>