More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0356 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0356  inner-membrane translocator  100 
 
 		 292 aa  567  1e-160  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0914  inner-membrane translocator  82.53 
 
 		 291 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3707  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  82.53 
 
 		 291 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.229916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1837  inner-membrane translocator  78.38 
 
 		 296 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000968352  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3520  inner-membrane translocator  79.79 
 
 		 291 aa  424  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0611  inner-membrane translocator  80.14 
 
 		 304 aa  414  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4054  inner-membrane translocator  73.24 
 
 		 299 aa  408  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1797  inner-membrane translocator  74.32 
 
 		 290 aa  408  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.160989 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1163  inner-membrane translocator  73.97 
 
 		 290 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0535977  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0298  inner-membrane translocator  73.29 
 
 		 290 aa  403  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.474045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2180  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  50.36 
 
 		 277 aa  269  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1698  inner-membrane translocator  49.48 
 
 		 292 aa  258  9e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0299512  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1769  inner-membrane translocator  49.14 
 
 		 292 aa  257  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.125196  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1683  inner-membrane translocator  44.29 
 
 		 294 aa  242  3.9999999999999997e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00416283  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0479  inner-membrane translocator  47.06 
 
 		 294 aa  226  4e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3768  inner-membrane translocator  37.8 
 
 		 291 aa  189  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.179629 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  36.77 
 
 		 294 aa  187  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3367  inner-membrane translocator  37.98 
 
 		 291 aa  185  7e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2082  inner-membrane translocator  39.73 
 
 		 289 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.936766  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3500  inner-membrane translocator  37.93 
 
 		 291 aa  179  7e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.334303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  39.32 
 
 		 290 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2129  inner-membrane translocator  37.97 
 
 		 294 aa  177  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2188  inner-membrane translocator  35.27 
 
 		 294 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3304  inner-membrane translocator  35.17 
 
 		 289 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5339  inner-membrane translocator  36.95 
 
 		 289 aa  172  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13292  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0996  inner-membrane translocator  35.99 
 
 		 293 aa  172  5e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1967  inner-membrane translocator  36.9 
 
 		 289 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.207347  normal  0.0517862 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4852  inner-membrane translocator  36.05 
 
 		 289 aa  169  6e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4061  inner-membrane translocator  38.01 
 
 		 291 aa  168  8e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2164  inner-membrane translocator  34.48 
 
 		 289 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3836  inner-membrane translocator  35.17 
 
 		 289 aa  168  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2039  inner-membrane translocator  35.27 
 
 		 294 aa  165  8e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000380808 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1672  inner-membrane translocator  36.77 
 
 		 299 aa  165  8e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1822  inner-membrane translocator  36.08 
 
 		 294 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  36.18 
 
 		 290 aa  163  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3394  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.32 
 
 		 291 aa  159  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0290  inner-membrane translocator  33.55 
 
 		 306 aa  155  6e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  32.59 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.05 
 
 		 291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4757  inner-membrane translocator  32.59 
 
 		 317 aa  153  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0367  inner-membrane translocator  37.76 
 
 		 291 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622442  unclonable  0.0000000514338 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0892  inner-membrane translocator  34.13 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2753  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.3 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110353  normal  0.248126 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0834  inner-membrane translocator  36.46 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000998369  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1733  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.23 
 
 		 294 aa  150  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.293981  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2272  inner-membrane translocator  38.64 
 
 		 291 aa  150  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.711778 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1943  inner-membrane translocator  37.97 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5829  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.03 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.903514  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0822  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.65 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0797  inner-membrane translocator  31.35 
 
 		 316 aa  146  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.320354 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1865  inner-membrane translocator  34.03 
 
 		 294 aa  147  3e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0785  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.7 
 
 		 316 aa  146  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  30.38 
 
 		 316 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.38 
 
 		 316 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.38 
 
 		 316 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2415  inner-membrane translocator  31.03 
 
 		 316 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911595  normal  0.010798 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2544  inner-membrane translocator  31.03 
 
 		 316 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995133  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0983  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.38 
 
 		 316 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156629  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1516  inner-membrane translocator  38.78 
 
 		 291 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6112  inner-membrane translocator  31.03 
 
 		 316 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2522  inner-membrane translocator  30.72 
 
 		 316 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1886  inner-membrane translocator  30.72 
 
 		 316 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2497  inner-membrane translocator  30.72 
 
 		 316 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260851  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  33.12 
 
 		 311 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3144  inner-membrane translocator  32.28 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00376696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3980  ABC transporter permease  31.83 
 
 		 287 aa  143  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0118656 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4940  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 291 aa  143  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6412  inner-membrane translocator  31.66 
 
 		 316 aa  142  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6586  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 291 aa  142  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6490  inner-membrane translocator  33.56 
 
 		 291 aa  142  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0479005  normal  0.485877 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  31.76 
 
 		 292 aa  142  8e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1721  inner-membrane translocator  34 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.021923  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  32.35 
 
 		 319 aa  141  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  34.34 
 
 		 293 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1483  inner-membrane translocator  33.79 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  34.09 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2366  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.12 
 
 		 299 aa  141  1.9999999999999998e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00045769  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  31.82 
 
 		 287 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3499  inner-membrane translocator  37.37 
 
 		 291 aa  140  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4550  inner-membrane translocator  34.9 
 
 		 290 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6015  inner-membrane translocator  34.12 
 
 		 291 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00174131 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0998  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.14 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.301783  normal  0.758902 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0528  inner-membrane translocator  31.58 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00118598  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  30.1 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  32.45 
 
 		 301 aa  136  4e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  30.65 
 
 		 309 aa  136  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3364  inner-membrane translocator  29.77 
 
 		 309 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.320486 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2866  inner-membrane translocator  32.8 
 
 		 311 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.631221  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2712  inner-membrane translocator  29.77 
 
 		 309 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  32.78 
 
 		 308 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0679  inner-membrane translocator  35.74 
 
 		 290 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1652  inner-membrane translocator  31.03 
 
 		 291 aa  134  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124335  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  32.78 
 
 		 308 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2708  inner-membrane translocator  33.65 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.489693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2283  inner-membrane translocator  30.64 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2318  inner-membrane translocator  33.65 
 
 		 311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249302  hitchhiker  0.00247249 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4070  inner-membrane translocator  36.49 
 
 		 295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1479  inner-membrane translocator  32.77 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3172  inner-membrane translocator  31.31 
 
 		 309 aa  133  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.538875  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1696  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 291 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.699777 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>