More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2753 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2753  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  100 
 
 		 290 aa  554  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110353  normal  0.248126 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4242  inner-membrane translocator  40.62 
 
 		 292 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4820  inner-membrane translocator  40.77 
 
 		 290 aa  193  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0225289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  38.54 
 
 		 290 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7078  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein livH  39.36 
 
 		 292 aa  192  7e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1742  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 292 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0350501  normal  0.0888724 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1003  inner-membrane translocator  39.02 
 
 		 290 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0350  inner-membrane translocator  40.97 
 
 		 292 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.018915  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2739  inner-membrane translocator  37.63 
 
 		 290 aa  179  5.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3557  inner-membrane translocator  39.24 
 
 		 292 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.258255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2283  inner-membrane translocator  34.93 
 
 		 295 aa  175  8e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3499  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 291 aa  167  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0528  inner-membrane translocator  35.71 
 
 		 292 aa  167  2e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00118598  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3010  inner-membrane translocator  34.84 
 
 		 291 aa  166  4e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000508141  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  36.65 
 
 		 291 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 294 aa  163  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4940  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 291 aa  159  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23000  branched-chain amino acid ABC-type transport system, permease component  33.91 
 
 		 292 aa  158  9e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.135077  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1781  ABC transporter permease  35.76 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0603975  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1833  inner-membrane translocator  30.82 
 
 		 297 aa  156  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0298  inner-membrane translocator  32.32 
 
 		 297 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0907201  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  30.87 
 
 		 300 aa  152  8e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3508  inner-membrane translocator  31.42 
 
 		 297 aa  152  8e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.771205  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5716  putative high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  33.33 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.010418  normal  0.660211 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4573  inner-membrane translocator  33 
 
 		 301 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2609  inner-membrane translocator  29.79 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  30.48 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0478  inner-membrane translocator  35.19 
 
 		 290 aa  150  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164888  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0624  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 293 aa  149  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.568796  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1865  inner-membrane translocator  35.37 
 
 		 294 aa  149  6e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3135  inner-membrane translocator  30.82 
 
 		 297 aa  149  8e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.85693 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1479  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1568  inner-membrane translocator  32.66 
 
 		 297 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.308629  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4177  inner-membrane translocator  32.23 
 
 		 297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0998  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.18 
 
 		 289 aa  146  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.301783  normal  0.758902 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.42 
 
 		 291 aa  145  5e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0430  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 293 aa  145  6e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0151823  normal  0.0139514 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2307  inner-membrane translocator  31.69 
 
 		 297 aa  145  9e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00760667 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0996  inner-membrane translocator  31.36 
 
 		 293 aa  145  9e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1483  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 295 aa  145  9e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3415  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.69 
 
 		 297 aa  144  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2188  inner-membrane translocator  29.51 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1558  inner-membrane translocator  32.32 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1672  inner-membrane translocator  34.15 
 
 		 299 aa  144  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2396  inner-membrane translocator  32.11 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.228148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4095  inner-membrane translocator  36.33 
 
 		 294 aa  143  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1862  inner-membrane translocator  31.51 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  32.88 
 
 		 291 aa  143  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6490  inner-membrane translocator  31.96 
 
 		 291 aa  142  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0479005  normal  0.485877 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  31.71 
 
 		 290 aa  142  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1391  inner-membrane translocator  31.16 
 
 		 294 aa  142  7e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3841  inner-membrane translocator  34.81 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00122547  normal  0.924093 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0356  inner-membrane translocator  32.3 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6586  inner-membrane translocator  31.62 
 
 		 291 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1837  inner-membrane translocator  32.88 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000968352  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.48 
 
 		 293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4297  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.3 
 
 		 296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.315349  decreased coverage  0.00178163 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1838  inner-membrane translocator  32.53 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1596  inner-membrane translocator  36.46 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0461  inner-membrane translocator  31.63 
 
 		 298 aa  140  3e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2501  inner-membrane translocator  32.11 
 
 		 302 aa  139  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.123023 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2129  inner-membrane translocator  31.49 
 
 		 294 aa  139  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  31.91 
 
 		 319 aa  138  7.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2608  inner-membrane translocator  30.67 
 
 		 302 aa  138  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3837  inner-membrane translocator  30.45 
 
 		 287 aa  137  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622329  normal  0.114435 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3707  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.29 
 
 		 291 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.229916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  31.51 
 
 		 293 aa  137  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0914  inner-membrane translocator  32.29 
 
 		 291 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7157  ABC transporter membrane spanning protein (branched chain amino acid)  31.63 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.751279  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0399  branched chain amino acid ABC transporter permease  31.51 
 
 		 294 aa  137  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.615306  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0544  inner-membrane translocator  35.09 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000402  High-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein LivH  29.73 
 
 		 297 aa  136  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.721803  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2239  inner-membrane translocator  34.01 
 
 		 293 aa  136  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0611  inner-membrane translocator  33.68 
 
 		 304 aa  135  6.0000000000000005e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2180  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  35.59 
 
 		 277 aa  135  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2164  inner-membrane translocator  31.4 
 
 		 289 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0105  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  32.56 
 
 		 308 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2082  inner-membrane translocator  32.41 
 
 		 289 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.936766  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0505  inner-membrane translocator  33.45 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0978839  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0259  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.85 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0266  inner-membrane translocator  32.35 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000146885  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1387  inner-membrane translocator  30.95 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0099  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  32.56 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0550  inner-membrane translocator  32.42 
 
 		 293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.255736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  29.41 
 
 		 292 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3973  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  32.23 
 
 		 308 aa  133  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0402  inner-membrane translocator  32.99 
 
 		 296 aa  133  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0245  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  32.23 
 
 		 308 aa  133  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0861  inner-membrane translocator  31.27 
 
 		 287 aa  133  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3667  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  32.23 
 
 		 308 aa  133  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.344938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  31.35 
 
 		 308 aa  133  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  31.35 
 
 		 308 aa  133  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0892  inner-membrane translocator  30.24 
 
 		 290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2751  inner-membrane translocator  30.48 
 
 		 301 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  30.36 
 
 		 308 aa  133  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0336  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.43 
 
 		 294 aa  133  3.9999999999999996e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.43 
 
 		 294 aa  132  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4063  inner-membrane translocator  35.89 
 
 		 292 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2366  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.03 
 
 		 299 aa  132  9e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00045769  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  32.13 
 
 		 301 aa  132  9e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>