More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1822 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1822  inner-membrane translocator  100 
 
 
294 aa  577  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1733  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  88.78 
 
 
294 aa  479  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.293981  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2129  inner-membrane translocator  77.55 
 
 
294 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  73.47 
 
 
294 aa  444  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2188  inner-membrane translocator  70.07 
 
 
294 aa  427  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1672  inner-membrane translocator  74.48 
 
 
299 aa  411  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2039  inner-membrane translocator  70.07 
 
 
294 aa  402  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000380808 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0996  inner-membrane translocator  56.9 
 
 
293 aa  335  3.9999999999999995e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0367  inner-membrane translocator  52.94 
 
 
291 aa  295  4e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622442  unclonable  0.0000000514338 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0892  inner-membrane translocator  47.24 
 
 
290 aa  277  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4070  inner-membrane translocator  49.32 
 
 
295 aa  267  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0385  inner-membrane translocator  51.03 
 
 
293 aa  266  4e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1516  inner-membrane translocator  50.69 
 
 
291 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0834  inner-membrane translocator  50.18 
 
 
300 aa  263  3e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000998369  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  45.52 
 
 
290 aa  262  6e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1680  inner-membrane translocator  45.67 
 
 
291 aa  244  9e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4550  inner-membrane translocator  48.28 
 
 
290 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1046  inner-membrane translocator  47.9 
 
 
289 aa  243  3.9999999999999997e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.316666 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1483  inner-membrane translocator  43.94 
 
 
295 aa  238  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0679  inner-membrane translocator  47.9 
 
 
290 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3104  inner-membrane translocator  42.91 
 
 
293 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1408  inner-membrane translocator  46.29 
 
 
317 aa  217  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0669  inner-membrane translocator  42.86 
 
 
294 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3821  inner-membrane translocator  45.33 
 
 
293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6490  inner-membrane translocator  36.24 
 
 
291 aa  188  9e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0479005  normal  0.485877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6586  inner-membrane translocator  35.54 
 
 
291 aa  186  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0110  inner-membrane translocator  39.24 
 
 
295 aa  185  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185553  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1651  inner-membrane translocator  34.15 
 
 
291 aa  179  7e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1849  inner-membrane translocator  34.49 
 
 
291 aa  175  7e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal  0.118432 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2283  inner-membrane translocator  36.3 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  36.68 
 
 
290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1696  inner-membrane translocator  35.79 
 
 
291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1865  inner-membrane translocator  35.07 
 
 
294 aa  171  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3768  inner-membrane translocator  36.46 
 
 
291 aa  171  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.179629 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  35.89 
 
 
291 aa  171  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.64 
 
 
319 aa  169  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  35.31 
 
 
308 aa  170  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  35.64 
 
 
308 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  35.64 
 
 
308 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  35.64 
 
 
319 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  35.64 
 
 
308 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  35.64 
 
 
319 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  35.02 
 
 
292 aa  169  7e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3500  inner-membrane translocator  36.04 
 
 
291 aa  168  8e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.334303  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6015  inner-membrane translocator  34.49 
 
 
291 aa  168  8e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00174131 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  34.36 
 
 
293 aa  168  8e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.98 
 
 
308 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.98 
 
 
308 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  34.98 
 
 
308 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  35.31 
 
 
308 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.03 
 
 
291 aa  167  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  32.89 
 
 
319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3687  inner-membrane translocator  33.8 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0356  inner-membrane translocator  36.08 
 
 
292 aa  163  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4054  inner-membrane translocator  36.15 
 
 
299 aa  161  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0402  inner-membrane translocator  34.03 
 
 
296 aa  161  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3837  inner-membrane translocator  34.28 
 
 
287 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622329  normal  0.114435 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3707  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.42 
 
 
291 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.229916  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0528  inner-membrane translocator  33.45 
 
 
292 aa  160  3e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00118598  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0914  inner-membrane translocator  35.76 
 
 
291 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  33.22 
 
 
338 aa  160  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  35.52 
 
 
292 aa  160  3e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  32.67 
 
 
309 aa  159  6e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  32.01 
 
 
309 aa  159  6e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3499  inner-membrane translocator  35.05 
 
 
291 aa  159  6e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1797  inner-membrane translocator  34.58 
 
 
290 aa  159  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.160989 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  31.72 
 
 
311 aa  159  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2501  inner-membrane translocator  34.92 
 
 
302 aa  158  8e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.123023 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
293 aa  158  8e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1163  inner-membrane translocator  34.36 
 
 
290 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0535977  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0298  inner-membrane translocator  34.84 
 
 
290 aa  158  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.474045  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  34.39 
 
 
291 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2479  inner-membrane translocator  34.65 
 
 
308 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1136  inner-membrane translocator  34.63 
 
 
286 aa  157  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0602243  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2105  inner-membrane translocator  31.91 
 
 
309 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3367  inner-membrane translocator  36.46 
 
 
291 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0611  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
300 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1479  inner-membrane translocator  33.88 
 
 
302 aa  157  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2440  putative amino-acid transmembrane ABC transporter protein  35.28 
 
 
311 aa  157  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  34.02 
 
 
293 aa  157  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2318  inner-membrane translocator  33.99 
 
 
308 aa  156  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0822  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.9 
 
 
316 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221033  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2500  inner-membrane translocator  35 
 
 
287 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1288  inner-membrane translocator  32.01 
 
 
309 aa  156  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  32.58 
 
 
316 aa  156  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3304  inner-membrane translocator  31.34 
 
 
289 aa  156  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1596  inner-membrane translocator  35.52 
 
 
292 aa  156  4e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3394  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
291 aa  155  6e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2739  inner-membrane translocator  34.27 
 
 
290 aa  155  6e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  33 
 
 
300 aa  155  6e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  34.52 
 
 
316 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0797  inner-membrane translocator  34.84 
 
 
316 aa  155  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.320354 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.52 
 
 
316 aa  155  8e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.52 
 
 
316 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5829  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.52 
 
 
316 aa  155  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.903514  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3172  inner-membrane translocator  32.67 
 
 
309 aa  155  9e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.538875  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2415  inner-membrane translocator  34.41 
 
 
316 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911595  normal  0.010798 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0785  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.19 
 
 
316 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1833  inner-membrane translocator  31.85 
 
 
297 aa  155  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2544  inner-membrane translocator  34.41 
 
 
316 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>