More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0669 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0669  inner-membrane translocator  100 
 
 
294 aa  560  1e-158  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3821  inner-membrane translocator  62.63 
 
 
293 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  48.98 
 
 
294 aa  267  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3104  inner-membrane translocator  50.17 
 
 
293 aa  260  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2129  inner-membrane translocator  47.28 
 
 
294 aa  251  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2188  inner-membrane translocator  44.9 
 
 
294 aa  241  7e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0996  inner-membrane translocator  47.02 
 
 
293 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0367  inner-membrane translocator  46.13 
 
 
291 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622442  unclonable  0.0000000514338 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0892  inner-membrane translocator  46.37 
 
 
290 aa  231  9e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2039  inner-membrane translocator  45.64 
 
 
294 aa  231  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000380808 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1680  inner-membrane translocator  49.3 
 
 
291 aa  230  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  43.94 
 
 
290 aa  228  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1672  inner-membrane translocator  48.28 
 
 
299 aa  227  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0834  inner-membrane translocator  44.14 
 
 
300 aa  226  3e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000998369  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1822  inner-membrane translocator  42.86 
 
 
294 aa  225  6e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4550  inner-membrane translocator  50.69 
 
 
290 aa  225  8e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1046  inner-membrane translocator  45.14 
 
 
289 aa  223  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.316666 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0385  inner-membrane translocator  47.89 
 
 
293 aa  224  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1483  inner-membrane translocator  46.15 
 
 
295 aa  219  5e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1733  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  45.73 
 
 
294 aa  219  6e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.293981  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1516  inner-membrane translocator  44.64 
 
 
291 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0679  inner-membrane translocator  48.96 
 
 
290 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4070  inner-membrane translocator  43.01 
 
 
295 aa  209  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1408  inner-membrane translocator  46.53 
 
 
317 aa  209  5e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  39.74 
 
 
311 aa  176  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  35.52 
 
 
291 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0110  inner-membrane translocator  37.37 
 
 
295 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185553  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  39.26 
 
 
319 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2866  inner-membrane translocator  39.74 
 
 
311 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.631221  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  36.42 
 
 
338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  36.21 
 
 
309 aa  159  5e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3172  inner-membrane translocator  34.88 
 
 
309 aa  157  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.538875  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.23 
 
 
291 aa  156  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0461  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
298 aa  156  4e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3364  inner-membrane translocator  36.54 
 
 
309 aa  155  8e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.320486 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2712  inner-membrane translocator  36.54 
 
 
309 aa  155  8e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  34.88 
 
 
309 aa  154  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  37.33 
 
 
293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  35.91 
 
 
301 aa  152  5e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6490  inner-membrane translocator  35.21 
 
 
291 aa  152  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0479005  normal  0.485877 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  36.55 
 
 
290 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0473  inner-membrane translocator  38.13 
 
 
301 aa  152  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5354  inner-membrane translocator  35.22 
 
 
309 aa  152  8e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.764467 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  35.83 
 
 
316 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3768  inner-membrane translocator  35.31 
 
 
291 aa  151  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.179629 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3796  inner-membrane translocator  34.55 
 
 
309 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2708  inner-membrane translocator  34.77 
 
 
311 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.489693  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6586  inner-membrane translocator  35.56 
 
 
291 aa  150  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2318  inner-membrane translocator  34.77 
 
 
311 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249302  hitchhiker  0.00247249 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0835  inner-membrane translocator  37.29 
 
 
301 aa  150  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0785  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.85 
 
 
316 aa  149  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.53 
 
 
316 aa  149  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1003  inner-membrane translocator  34.84 
 
 
290 aa  149  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0359  inner-membrane translocator  36.43 
 
 
300 aa  149  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  38.64 
 
 
293 aa  149  4e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.53 
 
 
316 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  34.53 
 
 
316 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0983  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.85 
 
 
316 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156629  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2105  inner-membrane translocator  34.88 
 
 
309 aa  149  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1838  inner-membrane translocator  36.55 
 
 
290 aa  149  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2366  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.12 
 
 
299 aa  148  8e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00045769  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1288  inner-membrane translocator  35.55 
 
 
309 aa  149  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2440  putative amino-acid transmembrane ABC transporter protein  34.77 
 
 
311 aa  148  9e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5829  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.85 
 
 
316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.903514  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  32.67 
 
 
300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3367  inner-membrane translocator  36.01 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4757  inner-membrane translocator  36.48 
 
 
317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0797  inner-membrane translocator  34.53 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.320354 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1865  inner-membrane translocator  36.14 
 
 
294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6412  inner-membrane translocator  36.16 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0822  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.83 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221033  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1136  inner-membrane translocator  35.79 
 
 
286 aa  147  3e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0602243  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6112  inner-membrane translocator  34.53 
 
 
316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3500  inner-membrane translocator  37.68 
 
 
291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.334303  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2415  inner-membrane translocator  34.53 
 
 
316 aa  145  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911595  normal  0.010798 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2544  inner-membrane translocator  34.53 
 
 
316 aa  145  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995133  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1651  inner-membrane translocator  34.14 
 
 
291 aa  146  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1886  inner-membrane translocator  34.2 
 
 
316 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2522  inner-membrane translocator  34.2 
 
 
316 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2497  inner-membrane translocator  34.2 
 
 
316 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260851  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1479  inner-membrane translocator  34.44 
 
 
302 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  35.71 
 
 
292 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5834  inner-membrane translocator  36.77 
 
 
290 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317168 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1182  branched-chain amino acid ABC-type transport system permease components  33.23 
 
 
481 aa  144  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.729657  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2739  inner-membrane translocator  32.04 
 
 
290 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3837  inner-membrane translocator  36.43 
 
 
287 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622329  normal  0.114435 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1696  inner-membrane translocator  34.75 
 
 
291 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5101  inner-membrane translocator  35.86 
 
 
603 aa  142  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208256  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0466  inner-membrane translocator  36.33 
 
 
316 aa  141  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0964978  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0611  inner-membrane translocator  34.58 
 
 
300 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0266  inner-membrane translocator  35.76 
 
 
304 aa  141  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000146885  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0933  inner-membrane translocator  34.01 
 
 
293 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000263386  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5318  inner-membrane translocator  35.52 
 
 
603 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0891799  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2500  inner-membrane translocator  33.9 
 
 
287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0245  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  33.22 
 
 
308 aa  140  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3687  inner-membrane translocator  35.66 
 
 
291 aa  140  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3304  inner-membrane translocator  36.97 
 
 
289 aa  140  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1123  putative amino-acid transmembrane ABC transporter protein  35.57 
 
 
335 aa  140  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121709  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1849  inner-membrane translocator  33.79 
 
 
291 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal  0.118432 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1258  inner-membrane translocator  31.56 
 
 
291 aa  140  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>