More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0266 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0266  inner-membrane translocator  100 
 
 		 304 aa  593  1e-168  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000146885  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2934  inner-membrane translocator  57.57 
 
 		 297 aa  343  2e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.84432  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1675  inner-membrane translocator  62.58 
 
 		 299 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.644536  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0612  inner-membrane translocator  54.93 
 
 		 297 aa  316  3e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1066  inner-membrane translocator  53.77 
 
 		 297 aa  311  1e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00641991  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1609  inner-membrane translocator  61.92 
 
 		 299 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171183  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0861  inner-membrane translocator  56.66 
 
 		 287 aa  303  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0636  inner-membrane translocator  55.59 
 
 		 297 aa  291  1e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000266086  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1470  inner-membrane translocator  55.78 
 
 		 303 aa  284  1.0000000000000001e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000609121  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0400  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  50.51 
 
 		 298 aa  284  1.0000000000000001e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0611  inner-membrane translocator  50.51 
 
 		 300 aa  282  6.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  49.67 
 
 		 300 aa  277  2e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1036  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  46.13 
 
 		 298 aa  270  2e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.203386  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1161  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  46.13 
 
 		 298 aa  270  2.9999999999999997e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0771  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  45.81 
 
 		 298 aa  268  8e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.171374  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1391  inner-membrane translocator  49.17 
 
 		 294 aa  267  2e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  48.5 
 
 		 291 aa  263  3e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  48.49 
 
 		 292 aa  261  1e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  49.16 
 
 		 293 aa  259  3e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  49.49 
 
 		 292 aa  258  9e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  48.17 
 
 		 298 aa  258  1e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0399  branched chain amino acid ABC transporter permease  49.01 
 
 		 294 aa  256  2e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.615306  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2501  inner-membrane translocator  50.17 
 
 		 302 aa  256  4e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.123023 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3394  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  51.67 
 
 		 291 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2239  inner-membrane translocator  49.01 
 
 		 293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0933  inner-membrane translocator  51.32 
 
 		 293 aa  252  7e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000263386  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  47.67 
 
 		 293 aa  250  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0461  inner-membrane translocator  47.54 
 
 		 298 aa  247  2e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1387  inner-membrane translocator  49.83 
 
 		 294 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  46.28 
 
 		 293 aa  245  8e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1581  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  47.32 
 
 		 289 aa  241  1e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000593948  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  49 
 
 		 291 aa  239  5e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1943  inner-membrane translocator  52 
 
 		 291 aa  238  8e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2272  inner-membrane translocator  51.67 
 
 		 291 aa  237  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.711778 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3104  inner-membrane translocator  45.91 
 
 		 310 aa  235  6e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.60376 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1721  inner-membrane translocator  47.21 
 
 		 290 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.021923  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2115  inner-membrane translocator  45.83 
 
 		 304 aa  232  5e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.592251  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1165  inner-membrane translocator  45.71 
 
 		 306 aa  232  6e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.893809 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  44.34 
 
 		 308 aa  232  6e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0476  inner-membrane translocator  51.86 
 
 		 294 aa  232  7.000000000000001e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000639069  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  44.34 
 
 		 308 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  44.34 
 
 		 308 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  44.34 
 
 		 308 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  45.11 
 
 		 308 aa  231  9e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  44.34 
 
 		 308 aa  231  9e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  45.11 
 
 		 308 aa  231  9e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  44.34 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  44.34 
 
 		 319 aa  231  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  44.34 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0521  inner-membrane translocator  46.08 
 
 		 304 aa  231  1e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3667  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  43.59 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.344938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0245  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  43.59 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3973  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  43.59 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  43.69 
 
 		 308 aa  230  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  44.34 
 
 		 319 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  44.34 
 
 		 319 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  44.09 
 
 		 301 aa  229  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0105  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  45.28 
 
 		 308 aa  229  4e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  42.54 
 
 		 308 aa  229  5e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0835  inner-membrane translocator  43.23 
 
 		 301 aa  229  5e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  42.19 
 
 		 316 aa  229  6e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  43.12 
 
 		 316 aa  228  8e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  42.19 
 
 		 316 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  42.19 
 
 		 316 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0983  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  42.19 
 
 		 316 aa  227  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156629  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0534  inner-membrane translocator  46.36 
 
 		 290 aa  228  1e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000179103 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0229  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  43.65 
 
 		 308 aa  226  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.689889 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0785  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.5 
 
 		 316 aa  226  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0797  inner-membrane translocator  42.19 
 
 		 316 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.320354 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5829  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  42.19 
 
 		 316 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.903514  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0487  inner-membrane translocator  41.9 
 
 		 307 aa  226  5.0000000000000005e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2522  inner-membrane translocator  41.88 
 
 		 316 aa  225  9e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1886  inner-membrane translocator  41.88 
 
 		 316 aa  225  9e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2497  inner-membrane translocator  41.88 
 
 		 316 aa  225  9e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260851  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  43.55 
 
 		 308 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0598  inner-membrane translocator  43.91 
 
 		 304 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34105  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6112  inner-membrane translocator  41.88 
 
 		 316 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0099  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  44.3 
 
 		 308 aa  224  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4918  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein BraD  43.59 
 
 		 304 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3871  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  42.81 
 
 		 308 aa  223  3e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.911793  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2415  inner-membrane translocator  41.88 
 
 		 316 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911595  normal  0.010798 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4058  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  43.45 
 
 		 308 aa  223  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2544  inner-membrane translocator  41.88 
 
 		 316 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995133  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0822  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  43.44 
 
 		 316 aa  223  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4757  inner-membrane translocator  42.81 
 
 		 317 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2492  inner-membrane translocator  42.81 
 
 		 304 aa  222  8e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.366827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2751  inner-membrane translocator  41.67 
 
 		 301 aa  221  8e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2479  inner-membrane translocator  43.91 
 
 		 308 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6412  inner-membrane translocator  42.5 
 
 		 316 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2318  inner-membrane translocator  43.97 
 
 		 308 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3336  inner-membrane translocator  45.6 
 
 		 307 aa  219  5e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0728  inner-membrane translocator  42.36 
 
 		 303 aa  219  6e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2253  inner-membrane translocator  41.03 
 
 		 301 aa  218  1e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3292  hypothetical protein  40.85 
 
 		 301 aa  217  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00518243 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3681  inner-membrane translocator  42.02 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.911027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  40.51 
 
 		 311 aa  216  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2493  inner-membrane translocator  44.94 
 
 		 320 aa  216  5e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.440826  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1779  inner-membrane translocator  41.37 
 
 		 305 aa  215  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601101  normal  0.644499 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4415  inner-membrane translocator  47.1 
 
 		 309 aa  215  8e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.550314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  40.94 
 
 		 309 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>