More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0861 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0861  inner-membrane translocator  100 
 
 
287 aa  551  1e-156  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2934  inner-membrane translocator  62.11 
 
 
297 aa  368  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.84432  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1066  inner-membrane translocator  58.89 
 
 
297 aa  329  4e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00641991  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0612  inner-membrane translocator  55.63 
 
 
297 aa  318  5e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0266  inner-membrane translocator  56.66 
 
 
304 aa  315  8e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000146885  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0400  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  54.9 
 
 
298 aa  314  9.999999999999999e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0636  inner-membrane translocator  59.93 
 
 
297 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000266086  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0611  inner-membrane translocator  54.74 
 
 
300 aa  302  5.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  54.2 
 
 
298 aa  300  1e-80  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1036  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  50.35 
 
 
298 aa  291  7e-78  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.203386  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1161  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  50.35 
 
 
298 aa  291  1e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1675  inner-membrane translocator  55.71 
 
 
299 aa  289  4e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.644536  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0771  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  49.65 
 
 
298 aa  287  1e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.171374  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1609  inner-membrane translocator  55.71 
 
 
299 aa  276  2e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171183  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  49.13 
 
 
300 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  49.31 
 
 
292 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3394  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  52.26 
 
 
291 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  49.12 
 
 
293 aa  263  3e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0933  inner-membrane translocator  52.08 
 
 
293 aa  261  1e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000263386  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0476  inner-membrane translocator  54.55 
 
 
294 aa  257  2e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000639069  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1391  inner-membrane translocator  48.61 
 
 
294 aa  256  3e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1721  inner-membrane translocator  49.13 
 
 
290 aa  256  4e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.021923  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1470  inner-membrane translocator  51.54 
 
 
303 aa  254  2.0000000000000002e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000609121  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  45.26 
 
 
292 aa  253  3e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  48.95 
 
 
293 aa  249  3e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  49.83 
 
 
291 aa  247  1e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1387  inner-membrane translocator  50.52 
 
 
294 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2501  inner-membrane translocator  47.59 
 
 
302 aa  241  7.999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.123023 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2239  inner-membrane translocator  49.3 
 
 
293 aa  241  9e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1581  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  48.08 
 
 
289 aa  239  4e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000593948  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0461  inner-membrane translocator  45.24 
 
 
298 aa  234  8e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0399  branched chain amino acid ABC transporter permease  44.6 
 
 
294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.615306  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1943  inner-membrane translocator  51.57 
 
 
291 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0534  inner-membrane translocator  47.57 
 
 
290 aa  232  5e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000179103 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2272  inner-membrane translocator  51.57 
 
 
291 aa  232  6e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.711778 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  46.69 
 
 
308 aa  231  1e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  45.1 
 
 
316 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  47.24 
 
 
291 aa  229  5e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  45.1 
 
 
316 aa  228  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  45.1 
 
 
316 aa  228  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0785  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  44.77 
 
 
316 aa  228  7e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0983  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  45.1 
 
 
316 aa  228  8e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156629  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0259  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.84 
 
 
301 aa  226  4e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2366  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  46.62 
 
 
299 aa  225  7e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00045769  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2115  inner-membrane translocator  44.82 
 
 
304 aa  224  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.592251  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2522  inner-membrane translocator  44.44 
 
 
316 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5829  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  44.12 
 
 
316 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.903514  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1886  inner-membrane translocator  44.44 
 
 
316 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2497  inner-membrane translocator  44.44 
 
 
316 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260851  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3292  hypothetical protein  42.41 
 
 
301 aa  224  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518243 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  45.87 
 
 
311 aa  223  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  44.77 
 
 
316 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0797  inner-membrane translocator  44.12 
 
 
316 aa  223  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.320354 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  43.14 
 
 
308 aa  223  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6412  inner-membrane translocator  44.77 
 
 
316 aa  223  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6112  inner-membrane translocator  44.12 
 
 
316 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  43.48 
 
 
308 aa  223  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2544  inner-membrane translocator  44.12 
 
 
316 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995133  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2415  inner-membrane translocator  44.12 
 
 
316 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911595  normal  0.010798 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  42.81 
 
 
308 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  42.81 
 
 
308 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  42.81 
 
 
319 aa  222  7e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  42.81 
 
 
319 aa  222  7e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  42.81 
 
 
319 aa  222  7e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  44.91 
 
 
293 aa  221  8e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0229  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  43.24 
 
 
308 aa  221  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.689889 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0835  inner-membrane translocator  45.05 
 
 
301 aa  221  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4757  inner-membrane translocator  45.1 
 
 
317 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1165  inner-membrane translocator  45.36 
 
 
306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.893809 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  42.47 
 
 
308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  43.43 
 
 
308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.47 
 
 
308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3871  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  42.91 
 
 
308 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.911793  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  44.7 
 
 
308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.47 
 
 
308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3796  inner-membrane translocator  44.01 
 
 
309 aa  219  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  43.38 
 
 
308 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  43.38 
 
 
308 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1123  putative amino-acid transmembrane ABC transporter protein  45.82 
 
 
335 aa  219  5e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121709  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2396  inner-membrane translocator  43.58 
 
 
302 aa  219  5e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.228148  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4260  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  48.84 
 
 
310 aa  218  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4394  inner-membrane translocator  48.84 
 
 
310 aa  217  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4415  inner-membrane translocator  48.68 
 
 
309 aa  217  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.550314  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4415  inner-membrane translocator  48.84 
 
 
310 aa  217  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  44.22 
 
 
338 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2318  inner-membrane translocator  44.82 
 
 
308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2712  inner-membrane translocator  41.91 
 
 
309 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3973  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  43.56 
 
 
308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0245  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  43.56 
 
 
308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3667  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  43.56 
 
 
308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.344938  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3364  inner-membrane translocator  41.91 
 
 
309 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.320486 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0099  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  42.9 
 
 
308 aa  216  4e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  42.81 
 
 
301 aa  216  4e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2105  inner-membrane translocator  42.57 
 
 
309 aa  215  5e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4058  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  42.57 
 
 
308 aa  216  5e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0521  inner-membrane translocator  44.97 
 
 
304 aa  215  5.9999999999999996e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  42.11 
 
 
309 aa  215  5.9999999999999996e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  43.87 
 
 
309 aa  215  5.9999999999999996e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0759  inner-membrane translocator  45.7 
 
 
311 aa  215  8e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000754526 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2866  inner-membrane translocator  46.18 
 
 
311 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.631221  normal  0.623408 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>