More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0636 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0636  inner-membrane translocator  100 
 
 
297 aa  580  1.0000000000000001e-165  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000266086  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0612  inner-membrane translocator  70.03 
 
 
297 aa  421  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1066  inner-membrane translocator  70.37 
 
 
297 aa  424  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00641991  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2934  inner-membrane translocator  56.57 
 
 
297 aa  344  8.999999999999999e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.84432  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0861  inner-membrane translocator  59.93 
 
 
287 aa  334  1e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0266  inner-membrane translocator  55.59 
 
 
304 aa  332  3e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000146885  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0400  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  50.34 
 
 
298 aa  318  1e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0611  inner-membrane translocator  52.19 
 
 
300 aa  315  4e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1675  inner-membrane translocator  56.08 
 
 
299 aa  308  5e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.644536  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1036  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  48.31 
 
 
298 aa  303  2.0000000000000002e-81  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.203386  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1161  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  48.31 
 
 
298 aa  303  3.0000000000000004e-81  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0771  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  47.64 
 
 
298 aa  300  2e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.171374  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1609  inner-membrane translocator  56.42 
 
 
299 aa  300  2e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171183  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  48.99 
 
 
298 aa  295  5e-79  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1470  inner-membrane translocator  50.98 
 
 
303 aa  275  5e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000609121  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1391  inner-membrane translocator  48.5 
 
 
294 aa  273  3e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  49.66 
 
 
292 aa  273  3e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  46.15 
 
 
300 aa  272  5.000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  46.92 
 
 
293 aa  262  6e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  46.1 
 
 
292 aa  262  6e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0476  inner-membrane translocator  51.37 
 
 
294 aa  258  7e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000639069  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0933  inner-membrane translocator  47.46 
 
 
293 aa  250  3e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000263386  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2239  inner-membrane translocator  44.07 
 
 
293 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  42.86 
 
 
316 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  42.86 
 
 
316 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  42.86 
 
 
316 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0785  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.54 
 
 
316 aa  246  4e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0983  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  42.54 
 
 
316 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156629  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  46.78 
 
 
291 aa  246  4.9999999999999997e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  45 
 
 
293 aa  241  9e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5829  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  42.22 
 
 
316 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.903514  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  44.56 
 
 
293 aa  240  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1387  inner-membrane translocator  46.03 
 
 
294 aa  241  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2522  inner-membrane translocator  42.22 
 
 
316 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1886  inner-membrane translocator  42.22 
 
 
316 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2497  inner-membrane translocator  42.22 
 
 
316 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260851  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3394  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  46.42 
 
 
291 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6112  inner-membrane translocator  42.22 
 
 
316 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2415  inner-membrane translocator  41.9 
 
 
316 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911595  normal  0.010798 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2544  inner-membrane translocator  41.9 
 
 
316 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995133  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1721  inner-membrane translocator  45.24 
 
 
290 aa  239  4e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.021923  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0797  inner-membrane translocator  41.59 
 
 
316 aa  239  5e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.320354 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  42.86 
 
 
316 aa  239  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0461  inner-membrane translocator  43.43 
 
 
298 aa  237  2e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0399  branched chain amino acid ABC transporter permease  44.11 
 
 
294 aa  236  3e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.615306  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  43.34 
 
 
291 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0534  inner-membrane translocator  43.96 
 
 
290 aa  233  2.0000000000000002e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000179103 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3172  inner-membrane translocator  41.21 
 
 
309 aa  232  5e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.538875  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2501  inner-membrane translocator  45.36 
 
 
302 aa  232  6e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.123023 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0822  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  42.54 
 
 
316 aa  232  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221033  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1581  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.61 
 
 
289 aa  231  1e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000593948  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1165  inner-membrane translocator  44.98 
 
 
306 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.893809 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4757  inner-membrane translocator  42.22 
 
 
317 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3292  hypothetical protein  41 
 
 
301 aa  230  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518243 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6412  inner-membrane translocator  42.22 
 
 
316 aa  229  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  41.91 
 
 
308 aa  227  1e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  41.8 
 
 
311 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  43.28 
 
 
301 aa  226  4e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5354  inner-membrane translocator  40.89 
 
 
309 aa  226  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.764467 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  40.13 
 
 
338 aa  225  7e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3144  inner-membrane translocator  41.9 
 
 
316 aa  223  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00376696  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0835  inner-membrane translocator  43.73 
 
 
301 aa  224  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  40.32 
 
 
309 aa  223  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0563  inner-membrane translocator  42.9 
 
 
306 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0182389  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2115  inner-membrane translocator  42.53 
 
 
304 aa  222  7e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.592251  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2712  inner-membrane translocator  39.68 
 
 
309 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3364  inner-membrane translocator  39.68 
 
 
309 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.320486 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0759  inner-membrane translocator  42.63 
 
 
311 aa  219  3.9999999999999997e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000754526 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3104  inner-membrane translocator  42.36 
 
 
310 aa  219  3.9999999999999997e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.60376 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  41.35 
 
 
319 aa  219  5e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0521  inner-membrane translocator  43.89 
 
 
304 aa  219  5e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3072  inner-membrane translocator  42.43 
 
 
300 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117603  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1779  inner-membrane translocator  42.02 
 
 
305 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601101  normal  0.644499 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3681  inner-membrane translocator  42.02 
 
 
305 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.911027  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2608  inner-membrane translocator  40.91 
 
 
302 aa  216  4e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1943  inner-membrane translocator  45.73 
 
 
291 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4415  inner-membrane translocator  46.33 
 
 
310 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4394  inner-membrane translocator  46.33 
 
 
310 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5323  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter (permease protein)  42.63 
 
 
305 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.446123 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2272  inner-membrane translocator  45.73 
 
 
291 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.711778 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4260  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  46.33 
 
 
310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2751  inner-membrane translocator  42.21 
 
 
301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1622  inner-membrane translocator  42.48 
 
 
304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.937087 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2318  inner-membrane translocator  42.44 
 
 
311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249302  hitchhiker  0.00247249 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2866  inner-membrane translocator  42.12 
 
 
311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.631221  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2708  inner-membrane translocator  42.44 
 
 
311 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.489693  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2105  inner-membrane translocator  38.59 
 
 
309 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2366  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.47 
 
 
299 aa  212  5.999999999999999e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00045769  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4415  inner-membrane translocator  44.95 
 
 
309 aa  212  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.550314  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1123  putative amino-acid transmembrane ABC transporter protein  40.51 
 
 
335 aa  211  9e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121709  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3871  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  39.74 
 
 
308 aa  211  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.911793  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2440  putative amino-acid transmembrane ABC transporter protein  41.8 
 
 
311 aa  211  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3328  inner-membrane translocator  41.12 
 
 
300 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166964  normal  0.584188 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2611  inner-membrane translocator  43.41 
 
 
304 aa  211  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.404951  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2253  inner-membrane translocator  41.91 
 
 
301 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2209  branched chain amino acid ABC transporter permease  41.8 
 
 
304 aa  210  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.396823  normal  0.65944 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1288  inner-membrane translocator  38.26 
 
 
309 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2396  inner-membrane translocator  39.94 
 
 
302 aa  209  5e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.228148  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  36.08 
 
 
309 aa  209  6e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  40.79 
 
 
308 aa  207  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>