More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1675 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1675  inner-membrane translocator  100 
 
 		 299 aa  568  1e-161  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.644536  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1609  inner-membrane translocator  97.99 
 
 		 299 aa  523  1e-147  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171183  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1470  inner-membrane translocator  65.88 
 
 		 303 aa  355  5e-97  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000609121  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0266  inner-membrane translocator  62.58 
 
 		 304 aa  337  9.999999999999999e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000146885  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1066  inner-membrane translocator  60.14 
 
 		 297 aa  332  3e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00641991  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0612  inner-membrane translocator  57.09 
 
 		 297 aa  321  9.000000000000001e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2934  inner-membrane translocator  54.73 
 
 		 297 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.84432  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0861  inner-membrane translocator  55.71 
 
 		 287 aa  295  5e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  52.67 
 
 		 300 aa  294  1e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0636  inner-membrane translocator  56.08 
 
 		 297 aa  289  4e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000266086  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0400  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  52.88 
 
 		 298 aa  288  5.0000000000000004e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0611  inner-membrane translocator  50.34 
 
 		 300 aa  278  6e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1036  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  51.37 
 
 		 298 aa  278  6e-74  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.203386  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1161  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  51.37 
 
 		 298 aa  277  1e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0771  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  51.03 
 
 		 298 aa  275  7e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.171374  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  53.12 
 
 		 298 aa  275  1.0000000000000001e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1387  inner-membrane translocator  52.82 
 
 		 294 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  49.49 
 
 		 292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  49.5 
 
 		 293 aa  268  7e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2501  inner-membrane translocator  50.83 
 
 		 302 aa  268  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.123023 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  46.15 
 
 		 292 aa  267  1e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  48.99 
 
 		 293 aa  265  8e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  48.32 
 
 		 293 aa  263  3e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0933  inner-membrane translocator  52.88 
 
 		 293 aa  259  3e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000263386  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0461  inner-membrane translocator  47.14 
 
 		 298 aa  258  6e-68  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  47.47 
 
 		 291 aa  258  7e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2239  inner-membrane translocator  49.33 
 
 		 293 aa  258  9e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3394  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  51.69 
 
 		 291 aa  258  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0534  inner-membrane translocator  48.31 
 
 		 290 aa  256  3e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000179103 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0797  inner-membrane translocator  46.35 
 
 		 316 aa  256  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.320354 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5829  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  45.71 
 
 		 316 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.903514  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2415  inner-membrane translocator  45.71 
 
 		 316 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911595  normal  0.010798 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6112  inner-membrane translocator  45.71 
 
 		 316 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2544  inner-membrane translocator  45.71 
 
 		 316 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995133  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  49.66 
 
 		 291 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1391  inner-membrane translocator  48.33 
 
 		 294 aa  253  3e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0785  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  45.4 
 
 		 316 aa  253  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2522  inner-membrane translocator  45.4 
 
 		 316 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1886  inner-membrane translocator  45.4 
 
 		 316 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2497  inner-membrane translocator  45.4 
 
 		 316 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260851  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  45.08 
 
 		 316 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  45.08 
 
 		 316 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  45.08 
 
 		 316 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0983  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  45.08 
 
 		 316 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156629  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  44.76 
 
 		 316 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1581  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  47.46 
 
 		 289 aa  248  6e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000593948  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0399  branched chain amino acid ABC transporter permease  46.94 
 
 		 294 aa  248  9e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.615306  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4757  inner-membrane translocator  44.44 
 
 		 317 aa  247  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0822  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  45.4 
 
 		 316 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6412  inner-membrane translocator  44.13 
 
 		 316 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  45.69 
 
 		 338 aa  245  6.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1721  inner-membrane translocator  47.96 
 
 		 290 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.021923  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1943  inner-membrane translocator  53.04 
 
 		 291 aa  242  6e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2712  inner-membrane translocator  44.73 
 
 		 309 aa  240  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3364  inner-membrane translocator  44.73 
 
 		 309 aa  240  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.320486 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2272  inner-membrane translocator  52.7 
 
 		 291 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.711778 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  44.09 
 
 		 309 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  44.41 
 
 		 309 aa  239  4e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3172  inner-membrane translocator  44.9 
 
 		 309 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.538875  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3144  inner-membrane translocator  44.76 
 
 		 316 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00376696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  43.45 
 
 		 311 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2105  inner-membrane translocator  43.45 
 
 		 309 aa  235  6e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5354  inner-membrane translocator  43.77 
 
 		 309 aa  235  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764467 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4394  inner-membrane translocator  48.4 
 
 		 310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4260  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  48.72 
 
 		 310 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4415  inner-membrane translocator  48.4 
 
 		 310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4415  inner-membrane translocator  48.55 
 
 		 309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.550314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1123  putative amino-acid transmembrane ABC transporter protein  45.05 
 
 		 335 aa  233  3e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121709  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3104  inner-membrane translocator  46.79 
 
 		 310 aa  233  3e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.60376 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0476  inner-membrane translocator  52.25 
 
 		 294 aa  232  4.0000000000000004e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000639069  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  42.58 
 
 		 301 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  43.83 
 
 		 308 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  44.66 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1288  inner-membrane translocator  43.45 
 
 		 309 aa  231  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  43.83 
 
 		 319 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  43.83 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  43.83 
 
 		 319 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  43.49 
 
 		 308 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  43.51 
 
 		 308 aa  230  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0759  inner-membrane translocator  44.09 
 
 		 311 aa  230  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000754526 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3796  inner-membrane translocator  43.77 
 
 		 309 aa  230  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  44.01 
 
 		 308 aa  229  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  43.41 
 
 		 319 aa  229  4e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2318  inner-membrane translocator  44.73 
 
 		 311 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249302  hitchhiker  0.00247249 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0259  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.39 
 
 		 301 aa  229  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  43.17 
 
 		 319 aa  229  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2708  inner-membrane translocator  44.73 
 
 		 311 aa  229  5e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.489693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  44.01 
 
 		 308 aa  229  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  44.01 
 
 		 308 aa  229  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  44.01 
 
 		 308 aa  229  6e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2440  putative amino-acid transmembrane ABC transporter protein  45.37 
 
 		 311 aa  228  9e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0835  inner-membrane translocator  43 
 
 		 301 aa  228  9e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3072  inner-membrane translocator  44.19 
 
 		 300 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3871  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  40.85 
 
 		 308 aa  228  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.911793  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2397  inner-membrane translocator  45.13 
 
 		 300 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00620383 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2253  inner-membrane translocator  42.02 
 
 		 301 aa  228  1e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  43.17 
 
 		 308 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  43.17 
 
 		 308 aa  228  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2866  inner-membrane translocator  44.09 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.631221  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3323  inner-membrane translocator  43.99 
 
 		 309 aa  226  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>