More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1258 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1258  inner-membrane translocator  100 
 
 		 291 aa  565  1e-160  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241594  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  47.26 
 
 		 291 aa  262  4e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2366  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  45.48 
 
 		 299 aa  262  4.999999999999999e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00045769  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  44.29 
 
 		 292 aa  239  4e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  44.79 
 
 		 293 aa  236  4e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1387  inner-membrane translocator  45.89 
 
 		 294 aa  232  4.0000000000000004e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1721  inner-membrane translocator  44.18 
 
 		 290 aa  228  6e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.021923  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2239  inner-membrane translocator  47.24 
 
 		 293 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  45.86 
 
 		 292 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0933  inner-membrane translocator  46.71 
 
 		 293 aa  226  4e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000263386  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  42.86 
 
 		 300 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  41.53 
 
 		 308 aa  225  9e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0229  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  40.07 
 
 		 308 aa  224  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.689889 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3973  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  39.4 
 
 		 308 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3667  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  39.4 
 
 		 308 aa  224  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.344938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0245  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  39.4 
 
 		 308 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0266  inner-membrane translocator  43.54 
 
 		 304 aa  223  3e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000146885  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3871  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  39.07 
 
 		 308 aa  222  4.9999999999999996e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.911793  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  40.86 
 
 		 308 aa  222  6e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  40.86 
 
 		 308 aa  222  6e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0099  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  39.74 
 
 		 308 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0105  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  39.74 
 
 		 308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4058  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  39.4 
 
 		 308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1943  inner-membrane translocator  47.93 
 
 		 291 aa  218  7e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2272  inner-membrane translocator  47.93 
 
 		 291 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.711778 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3394  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  46.76 
 
 		 291 aa  218  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  40.53 
 
 		 319 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3739  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  40.4 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  43.1 
 
 		 293 aa  217  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  40.73 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  40.53 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  40.73 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1581  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  45.33 
 
 		 289 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000593948  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3934  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  40.07 
 
 		 308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3754  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  40.07 
 
 		 308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3832  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  40.07 
 
 		 308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.377986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3875  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  40.07 
 
 		 308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  40.73 
 
 		 319 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3765  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  40.07 
 
 		 308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  40.73 
 
 		 319 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52703 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03306  leucine/isoleucine/valine transporter subunit  40.07 
 
 		 308 aa  216  4e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0258  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 308 aa  216  4e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03259  hypothetical protein  40.07 
 
 		 308 aa  216  4e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3936  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  40.07 
 
 		 308 aa  216  4e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0259  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  40.07 
 
 		 308 aa  216  4e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4774  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  40.07 
 
 		 308 aa  216  4e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3655  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  40.07 
 
 		 308 aa  216  4e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3865  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  40.07 
 
 		 308 aa  216  4e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0487  inner-membrane translocator  40.66 
 
 		 307 aa  216  5e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  39.87 
 
 		 308 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1725  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.14 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1112  inner-membrane translocator  40.8 
 
 		 302 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  40.53 
 
 		 308 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1751  inner-membrane translocator  40.2 
 
 		 304 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.48853  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.53 
 
 		 308 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.53 
 
 		 308 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0399  branched chain amino acid ABC transporter permease  44.67 
 
 		 294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.615306  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1791  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.14 
 
 		 302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  40.2 
 
 		 308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3860  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  39.87 
 
 		 308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0932593 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3336  inner-membrane translocator  41.72 
 
 		 307 aa  213  3.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  43.25 
 
 		 291 aa  212  7e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4918  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein BraD  40.53 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0534  inner-membrane translocator  45.49 
 
 		 290 aa  211  1e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000179103 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  42.61 
 
 		 293 aa  210  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0598  inner-membrane translocator  40.53 
 
 		 304 aa  210  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34105  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1622  inner-membrane translocator  40.52 
 
 		 304 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.937087 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2501  inner-membrane translocator  42.95 
 
 		 302 aa  209  4e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.123023 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3072  inner-membrane translocator  40.6 
 
 		 300 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  40.13 
 
 		 308 aa  209  5e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3323  inner-membrane translocator  40.85 
 
 		 309 aa  209  6e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4922  inner-membrane translocator  39.22 
 
 		 304 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.75867  hitchhiker  0.0000000000177319 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2209  branched chain amino acid ABC transporter permease  40.53 
 
 		 304 aa  208  8e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.396823  normal  0.65944 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4866  inner-membrane translocator  39.41 
 
 		 304 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  hitchhiker  0.000815383 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4757  inner-membrane translocator  41.56 
 
 		 317 aa  207  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  41.14 
 
 		 319 aa  207  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  42.21 
 
 		 316 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4744  inner-membrane translocator  39.41 
 
 		 304 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579328  hitchhiker  0.000000155208 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3328  inner-membrane translocator  40.94 
 
 		 300 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166964  normal  0.584188 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  42.21 
 
 		 316 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4658  inner-membrane translocator  40.33 
 
 		 304 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026431 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  42.21 
 
 		 316 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0785  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.61 
 
 		 316 aa  207  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  41.56 
 
 		 316 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5323  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter (permease protein)  40.4 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.446123 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0983  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  42.21 
 
 		 316 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156629  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1140  inner-membrane translocator  40.92 
 
 		 307 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125696  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1247  inner-membrane translocator  41.72 
 
 		 307 aa  206  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1174  inner-membrane translocator  40.92 
 
 		 307 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.258715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2611  inner-membrane translocator  40.53 
 
 		 304 aa  206  4e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.404951  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1157  inner-membrane translocator  40.92 
 
 		 307 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.197851  normal  0.0247648 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0728  inner-membrane translocator  39 
 
 		 303 aa  205  6e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4277  inner-membrane translocator  40.59 
 
 		 307 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.9657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2492  inner-membrane translocator  39.53 
 
 		 304 aa  205  7e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.366827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  41.86 
 
 		 338 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1288  inner-membrane translocator  39.87 
 
 		 309 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4304  branched-chain amino acid transport protein BraD  42.05 
 
 		 307 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50530  branched-chain amino acid transport protein BraD  42.05 
 
 		 307 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0142776 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4415  inner-membrane translocator  40.85 
 
 		 309 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.550314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0553  inner-membrane translocator  38.67 
 
 		 304 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0455233  normal  0.45373 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>