More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5834 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5834  inner-membrane translocator  100 
 
 
290 aa  551  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317168 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5695  inner-membrane translocator  92.41 
 
 
290 aa  471  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00418313 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0644  inner-membrane translocator  78.62 
 
 
290 aa  403  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0220  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  42.21 
 
 
290 aa  201  9e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168677  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.36 
 
 
293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3394  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.86 
 
 
291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1581  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.05 
 
 
289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000593948  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  39.93 
 
 
292 aa  193  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3837  inner-membrane translocator  39.93 
 
 
287 aa  192  6e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622329  normal  0.114435 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  36.33 
 
 
292 aa  191  1e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0399  branched chain amino acid ABC transporter permease  39.58 
 
 
294 aa  190  2e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.615306  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.22 
 
 
291 aa  188  8e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  39.59 
 
 
293 aa  186  3e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3552  inner-membrane translocator  41.11 
 
 
289 aa  185  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  35.42 
 
 
287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  36.99 
 
 
287 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2272  inner-membrane translocator  42.05 
 
 
291 aa  181  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.711778 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1721  inner-membrane translocator  38.79 
 
 
290 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.021923  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1943  inner-membrane translocator  41.34 
 
 
291 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3980  ABC transporter permease  37.67 
 
 
287 aa  178  8e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0118656 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2006  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.72 
 
 
288 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.766894  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1258  inner-membrane translocator  38.16 
 
 
291 aa  176  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241594  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1533  inner-membrane translocator  36.93 
 
 
288 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575934  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5101  inner-membrane translocator  38.6 
 
 
603 aa  176  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208256  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2934  inner-membrane translocator  37.15 
 
 
297 aa  175  7e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.84432  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2425  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  36.59 
 
 
288 aa  175  8e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.674149  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1438  inner-membrane translocator  36.59 
 
 
288 aa  175  8e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5318  inner-membrane translocator  37.89 
 
 
603 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0891799  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2239  inner-membrane translocator  37.59 
 
 
293 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2534  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.54 
 
 
603 aa  172  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3936  inner-membrane translocator  37.54 
 
 
603 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2253  inner-membrane translocator  36.88 
 
 
301 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0266  inner-membrane translocator  36.39 
 
 
304 aa  172  7.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000146885  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3584  inner-membrane translocator  37.54 
 
 
603 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  35.22 
 
 
301 aa  171  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2500  inner-membrane translocator  36.49 
 
 
287 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2751  inner-membrane translocator  36.21 
 
 
301 aa  170  3e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  35.16 
 
 
311 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  36.63 
 
 
308 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3336  inner-membrane translocator  38.18 
 
 
307 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  34.02 
 
 
300 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1391  inner-membrane translocator  36.43 
 
 
294 aa  166  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1136  inner-membrane translocator  36.59 
 
 
286 aa  166  4e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0602243  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1454  inner-membrane translocator  35.29 
 
 
288 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.566264  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3749  inner-membrane translocator  36.21 
 
 
295 aa  165  9e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2366  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.87 
 
 
299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00045769  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  36.21 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2166  inner-membrane translocator  40.7 
 
 
286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  35.12 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  36.21 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0099  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  36.12 
 
 
308 aa  163  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0793  inner-membrane translocator  34.52 
 
 
290 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1066  inner-membrane translocator  36.61 
 
 
297 aa  163  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00641991  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0861  inner-membrane translocator  38.11 
 
 
287 aa  163  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0728  inner-membrane translocator  33.78 
 
 
303 aa  163  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6490  inner-membrane translocator  37.02 
 
 
291 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0479005  normal  0.485877 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  34.56 
 
 
308 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  34.56 
 
 
308 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  34.56 
 
 
319 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  34.56 
 
 
319 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.56 
 
 
319 aa  162  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2501  inner-membrane translocator  35.84 
 
 
302 aa  162  7e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.123023 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  34.56 
 
 
308 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  35.83 
 
 
309 aa  162  9e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0611  inner-membrane translocator  36.77 
 
 
300 aa  161  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1905  inner-membrane translocator  36.3 
 
 
290 aa  161  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.419507 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4058  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  35.79 
 
 
308 aa  161  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0835  inner-membrane translocator  34.88 
 
 
301 aa  161  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0933  inner-membrane translocator  34.95 
 
 
293 aa  161  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000263386  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6412  inner-membrane translocator  35.24 
 
 
316 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  33.68 
 
 
290 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2284  inner-membrane translocator  40.97 
 
 
285 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3104  inner-membrane translocator  35.28 
 
 
310 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.60376 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  34.21 
 
 
308 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1928  inner-membrane translocator  38.3 
 
 
290 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.45272  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1387  inner-membrane translocator  37.15 
 
 
294 aa  159  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.29 
 
 
316 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19640  high affinity branched chain amino acid ABC transporter, permease component  37.71 
 
 
307 aa  159  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0105896  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3973  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  35.23 
 
 
308 aa  159  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2318  inner-membrane translocator  36.39 
 
 
308 aa  159  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3667  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  35.23 
 
 
308 aa  159  5e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.344938  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0245  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  35.23 
 
 
308 aa  159  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0105  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  35.88 
 
 
308 aa  159  5e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  36.71 
 
 
291 aa  159  6e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  33.55 
 
 
319 aa  159  6e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  34.56 
 
 
308 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.56 
 
 
308 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.56 
 
 
308 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2115  inner-membrane translocator  31.67 
 
 
304 aa  159  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.592251  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0400  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.04 
 
 
298 aa  159  6e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  34.29 
 
 
316 aa  159  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2479  inner-membrane translocator  36.39 
 
 
308 aa  159  7e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5975  inner-membrane translocator  36.52 
 
 
285 aa  159  7e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0487  inner-membrane translocator  34.65 
 
 
307 aa  159  7e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0563  inner-membrane translocator  35.5 
 
 
306 aa  159  7e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0182389  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3871  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  34.11 
 
 
308 aa  158  8e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.911793  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  34.48 
 
 
293 aa  158  9e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6112  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
316 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  32.75 
 
 
294 aa  158  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1619  inner-membrane translocator  34.86 
 
 
290 aa  158  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.755467  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>