More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2129 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2129  inner-membrane translocator  100 
 
 
294 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2188  inner-membrane translocator  76.87 
 
 
294 aa  461  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  76.19 
 
 
294 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1822  inner-membrane translocator  77.55 
 
 
294 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2039  inner-membrane translocator  77.55 
 
 
294 aa  441  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000380808 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1672  inner-membrane translocator  77.59 
 
 
299 aa  434  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1733  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  77.55 
 
 
294 aa  424  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.293981  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0996  inner-membrane translocator  59.18 
 
 
293 aa  342  5e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0367  inner-membrane translocator  52.94 
 
 
291 aa  297  2e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622442  unclonable  0.0000000514338 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0892  inner-membrane translocator  50.86 
 
 
290 aa  290  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4070  inner-membrane translocator  50.68 
 
 
295 aa  276  3e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  48.11 
 
 
290 aa  271  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0385  inner-membrane translocator  52.38 
 
 
293 aa  264  1e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1516  inner-membrane translocator  49.15 
 
 
291 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0834  inner-membrane translocator  48.31 
 
 
300 aa  263  3e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000998369  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1680  inner-membrane translocator  49.83 
 
 
291 aa  262  6.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1483  inner-membrane translocator  45.21 
 
 
295 aa  249  4e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4550  inner-membrane translocator  49.31 
 
 
290 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0679  inner-membrane translocator  48.62 
 
 
290 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3104  inner-membrane translocator  44.56 
 
 
293 aa  237  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0669  inner-membrane translocator  47.28 
 
 
294 aa  233  2.0000000000000002e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1046  inner-membrane translocator  46.69 
 
 
289 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.316666 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1408  inner-membrane translocator  46.69 
 
 
317 aa  223  3e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3821  inner-membrane translocator  47.8 
 
 
293 aa  216  5e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1651  inner-membrane translocator  38.28 
 
 
291 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6490  inner-membrane translocator  37.88 
 
 
291 aa  193  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0479005  normal  0.485877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6586  inner-membrane translocator  37.88 
 
 
291 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1849  inner-membrane translocator  37.24 
 
 
291 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal  0.118432 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3768  inner-membrane translocator  38.06 
 
 
291 aa  188  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.179629 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2283  inner-membrane translocator  36.3 
 
 
295 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  36.69 
 
 
319 aa  182  7e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3367  inner-membrane translocator  38.06 
 
 
291 aa  177  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0356  inner-membrane translocator  37.97 
 
 
292 aa  177  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0914  inner-membrane translocator  37.72 
 
 
291 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.81 
 
 
291 aa  177  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  38.23 
 
 
293 aa  176  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3500  inner-membrane translocator  38.52 
 
 
291 aa  176  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.334303  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.74 
 
 
293 aa  177  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0110  inner-membrane translocator  37.46 
 
 
295 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185553  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3707  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.02 
 
 
291 aa  175  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.229916  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  37.41 
 
 
290 aa  175  8e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6015  inner-membrane translocator  37.2 
 
 
291 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00174131 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1837  inner-membrane translocator  37.33 
 
 
296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000968352  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  36.36 
 
 
292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1865  inner-membrane translocator  36.77 
 
 
294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2501  inner-membrane translocator  36.73 
 
 
302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.123023 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  37.37 
 
 
287 aa  173  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2608  inner-membrane translocator  36.51 
 
 
302 aa  172  5e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3687  inner-membrane translocator  36.9 
 
 
291 aa  172  6.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1696  inner-membrane translocator  36.86 
 
 
291 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  35.83 
 
 
308 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4054  inner-membrane translocator  36.73 
 
 
299 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  36.16 
 
 
319 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  36.16 
 
 
308 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0099  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  35.92 
 
 
308 aa  171  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4757  inner-membrane translocator  36.98 
 
 
317 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  34.29 
 
 
338 aa  170  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  35.05 
 
 
316 aa  170  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  36.16 
 
 
308 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0105  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  35.92 
 
 
308 aa  170  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3837  inner-membrane translocator  36.97 
 
 
287 aa  170  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622329  normal  0.114435 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  36.16 
 
 
319 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  36.16 
 
 
308 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2105  inner-membrane translocator  34.29 
 
 
309 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  36.16 
 
 
319 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.83 
 
 
308 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.83 
 
 
308 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  35.83 
 
 
308 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0229  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  33.98 
 
 
308 aa  170  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.689889 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  35.97 
 
 
308 aa  170  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  37.18 
 
 
308 aa  169  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  34.98 
 
 
300 aa  169  4e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2396  inner-membrane translocator  35.64 
 
 
302 aa  169  5e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.228148  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3508  inner-membrane translocator  32.43 
 
 
297 aa  169  5e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.771205  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1479  inner-membrane translocator  35.97 
 
 
302 aa  169  7e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4058  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  34.95 
 
 
308 aa  169  7e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.41 
 
 
316 aa  168  9e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  35.58 
 
 
308 aa  168  9e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  35.58 
 
 
308 aa  168  9e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1288  inner-membrane translocator  33.12 
 
 
309 aa  167  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0785  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.41 
 
 
316 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0983  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.08 
 
 
316 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156629  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  34.08 
 
 
316 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.08 
 
 
316 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3871  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  34.3 
 
 
308 aa  166  4e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.911793  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4061  inner-membrane translocator  37.37 
 
 
291 aa  166  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1163  inner-membrane translocator  37.33 
 
 
290 aa  166  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0535977  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  33.65 
 
 
309 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  35.48 
 
 
287 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6112  inner-membrane translocator  34.73 
 
 
316 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0822  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.37 
 
 
316 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221033  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2415  inner-membrane translocator  34.73 
 
 
316 aa  165  8e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911595  normal  0.010798 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2544  inner-membrane translocator  34.73 
 
 
316 aa  165  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995133  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2500  inner-membrane translocator  37.15 
 
 
287 aa  165  9e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0611  inner-membrane translocator  37.63 
 
 
304 aa  165  9e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5829  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.41 
 
 
316 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.903514  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1797  inner-membrane translocator  37.37 
 
 
290 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.160989 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3980  ABC transporter permease  36.04 
 
 
287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0118656 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3394  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.17 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0290  inner-membrane translocator  35.71 
 
 
306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>