More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4054 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4054  inner-membrane translocator  100 
 
 		 299 aa  576  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1797  inner-membrane translocator  75.25 
 
 		 290 aa  421  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.160989 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1163  inner-membrane translocator  75.92 
 
 		 290 aa  421  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0535977  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1837  inner-membrane translocator  74.33 
 
 		 296 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000968352  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0298  inner-membrane translocator  74.58 
 
 		 290 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.474045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0914  inner-membrane translocator  74.58 
 
 		 291 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3707  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  74.58 
 
 		 291 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.229916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0356  inner-membrane translocator  73.24 
 
 		 292 aa  409  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0611  inner-membrane translocator  72.79 
 
 		 304 aa  390  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3520  inner-membrane translocator  71.91 
 
 		 291 aa  384  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2180  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  47.2 
 
 		 277 aa  252  6e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1769  inner-membrane translocator  46.31 
 
 		 292 aa  245  6e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.125196  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1698  inner-membrane translocator  46.31 
 
 		 292 aa  245  6e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0299512  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1683  inner-membrane translocator  42.23 
 
 		 294 aa  227  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00416283  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0479  inner-membrane translocator  44.93 
 
 		 294 aa  217  2e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3768  inner-membrane translocator  38.78 
 
 		 291 aa  195  6e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.179629 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3367  inner-membrane translocator  37.41 
 
 		 291 aa  188  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3304  inner-membrane translocator  38.8 
 
 		 289 aa  188  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2082  inner-membrane translocator  38.67 
 
 		 289 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.936766  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3500  inner-membrane translocator  38.54 
 
 		 291 aa  176  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.334303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5339  inner-membrane translocator  39.26 
 
 		 289 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13292  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1967  inner-membrane translocator  38.05 
 
 		 289 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.207347  normal  0.0517862 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0996  inner-membrane translocator  36.7 
 
 		 293 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3836  inner-membrane translocator  36.36 
 
 		 289 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4852  inner-membrane translocator  38.38 
 
 		 289 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2129  inner-membrane translocator  36.73 
 
 		 294 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  36.73 
 
 		 290 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2188  inner-membrane translocator  34.78 
 
 		 294 aa  171  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4061  inner-membrane translocator  38.13 
 
 		 291 aa  169  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  36.91 
 
 		 294 aa  169  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  35.79 
 
 		 290 aa  169  5e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2164  inner-membrane translocator  35.35 
 
 		 289 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.402468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0290  inner-membrane translocator  35.18 
 
 		 306 aa  166  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1822  inner-membrane translocator  36.15 
 
 		 294 aa  162  6e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2039  inner-membrane translocator  34.45 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000380808 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0834  inner-membrane translocator  37.72 
 
 		 300 aa  158  9e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000998369  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1516  inner-membrane translocator  37.07 
 
 		 291 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4550  inner-membrane translocator  35.45 
 
 		 290 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1733  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.92 
 
 		 294 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.293981  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4070  inner-membrane translocator  37.87 
 
 		 295 aa  152  7e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1672  inner-membrane translocator  36.21 
 
 		 299 aa  152  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0679  inner-membrane translocator  36.73 
 
 		 290 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0367  inner-membrane translocator  38.31 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622442  unclonable  0.0000000514338 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0892  inner-membrane translocator  32.78 
 
 		 290 aa  149  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3415  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.68 
 
 		 297 aa  148  8e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1651  inner-membrane translocator  34.11 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  34.35 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  33.99 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  33.99 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  33.55 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3104  inner-membrane translocator  36.05 
 
 		 293 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  35.86 
 
 		 308 aa  145  6e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3508  inner-membrane translocator  34.32 
 
 		 297 aa  145  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.771205  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1849  inner-membrane translocator  34.77 
 
 		 291 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal  0.118432 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  35.2 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1483  inner-membrane translocator  34.9 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.86 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6412  inner-membrane translocator  35.13 
 
 		 316 aa  143  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  35.53 
 
 		 308 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  35.53 
 
 		 308 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  35.53 
 
 		 308 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4757  inner-membrane translocator  32.91 
 
 		 317 aa  143  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.53 
 
 		 319 aa  142  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1833  inner-membrane translocator  32.01 
 
 		 297 aa  142  5e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.576158  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  35.53 
 
 		 319 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  35.53 
 
 		 319 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  35.2 
 
 		 308 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.2 
 
 		 308 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.2 
 
 		 308 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  32.91 
 
 		 316 aa  142  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000402  High-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein LivH  32.01 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.721803  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3499  inner-membrane translocator  37.33 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1619  inner-membrane translocator  31.16 
 
 		 290 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.755467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  34.32 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3135  inner-membrane translocator  32.34 
 
 		 297 aa  139  6e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.85693 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2283  inner-membrane translocator  31.15 
 
 		 295 aa  139  6e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3394  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.11 
 
 		 291 aa  139  7e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2440  putative amino-acid transmembrane ABC transporter protein  34.5 
 
 		 311 aa  139  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2753  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.42 
 
 		 290 aa  139  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110353  normal  0.248126 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.17 
 
 		 294 aa  138  8.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0298  inner-membrane translocator  33.22 
 
 		 297 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0907201  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2751  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 301 aa  137  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.96 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4940  inner-membrane translocator  34.22 
 
 		 291 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  31.19 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0353  inner-membrane translocator  35.79 
 
 		 294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0198535  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0822  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  32.59 
 
 		 316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  33.1 
 
 		 291 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.65 
 
 		 316 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  31.65 
 
 		 316 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0983  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.65 
 
 		 316 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156629  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1721  inner-membrane translocator  31.89 
 
 		 290 aa  136  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.021923  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  32.81 
 
 		 311 aa  136  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1865  inner-membrane translocator  34.58 
 
 		 294 aa  136  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3980  ABC transporter permease  31.86 
 
 		 287 aa  136  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0118656 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0785  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.33 
 
 		 316 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0336  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.81 
 
 		 294 aa  135  6.0000000000000005e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1479  inner-membrane translocator  32.55 
 
 		 302 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2366  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  30.23 
 
 		 299 aa  135  8e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00045769  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>