More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3363 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A3363  inner-membrane translocator  100 
 
 
350 aa  675    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102738  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3512  inner-membrane translocator  92.86 
 
 
350 aa  594  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0408964 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0025  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  75.43 
 
 
351 aa  514  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.746489  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01744  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  79.14 
 
 
350 aa  508  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.698868  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3908  inner-membrane translocator  75.14 
 
 
351 aa  510  1e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3042  inner-membrane translocator  73.14 
 
 
351 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4658  inner-membrane translocator  78.29 
 
 
350 aa  488  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.14788 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4526  inner-membrane translocator  78.29 
 
 
350 aa  488  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.141329  normal  0.558956 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0090  inner-membrane translocator  70.86 
 
 
351 aa  481  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3272  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  71.14 
 
 
351 aa  479  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0091  inner-membrane translocator  71.14 
 
 
351 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0081  inner-membrane translocator  71.43 
 
 
351 aa  481  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0107  inner-membrane translocator  71.14 
 
 
351 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790851  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2965  inner-membrane translocator  70.86 
 
 
394 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.235343  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0090  inner-membrane translocator  70.86 
 
 
394 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.823802  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3985  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  70.29 
 
 
351 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3000  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  70.57 
 
 
351 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.403467  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3370  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  70.57 
 
 
351 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2941  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  70.57 
 
 
351 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0193  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  70.57 
 
 
351 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107939  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3323  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  70.86 
 
 
397 aa  463  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1602  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  70.57 
 
 
351 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4059  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  70.29 
 
 
351 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3236  inner-membrane translocator  63.9 
 
 
349 aa  430  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0230482  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1518  inner-membrane translocator  64.96 
 
 
345 aa  388  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0268  inner-membrane translocator  60.29 
 
 
345 aa  387  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0908  inner-membrane translocator:ABC transporter related  62 
 
 
951 aa  383  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0412388  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4098  inner-membrane translocator:ABC transporter related  62.64 
 
 
950 aa  382  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2942  inner-membrane translocator  63.14 
 
 
345 aa  380  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.550413  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0990  inner-membrane translocator  61.6 
 
 
345 aa  375  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0801  inner-membrane translocator  57.95 
 
 
346 aa  370  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1821  inner-membrane translocator  53.14 
 
 
345 aa  365  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.683409  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1229  inner-membrane translocator  60 
 
 
342 aa  357  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0573  inner-membrane translocator  60.57 
 
 
342 aa  347  2e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.4403  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3952  inner-membrane translocator  55.14 
 
 
360 aa  340  2e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5328  inner-membrane translocator  58.12 
 
 
345 aa  340  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0654205  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1995  inner-membrane translocator  54.57 
 
 
346 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3571  inner-membrane translocator  54.86 
 
 
346 aa  332  6e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.16314 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7085  ABC transporter, permease protein  54.78 
 
 
341 aa  325  6e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4633  inner-membrane translocator  51.98 
 
 
345 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1892  inner-membrane translocator  54.99 
 
 
346 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.322186  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0693  inner-membrane translocator  48.12 
 
 
349 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0776  inner-membrane translocator  52.57 
 
 
345 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.300879  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3249  branched chain amino acid ABC transporter permease  50.14 
 
 
347 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.174248  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2424  inner-membrane translocator  58.17 
 
 
349 aa  297  2e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.69608  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3891  ABC transporter ATPase component  50.42 
 
 
954 aa  292  6e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2875  inner-membrane translocator  48.43 
 
 
351 aa  280  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.781578  normal  0.470002 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0996  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  45.33 
 
 
357 aa  279  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.883581  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1505  inner-membrane translocator  48.09 
 
 
351 aa  261  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122982  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2317  inner-membrane translocator  46.11 
 
 
343 aa  253  5.000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1327  inner-membrane translocator  43.18 
 
 
343 aa  244  1.9999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.492198  normal  0.0368007 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0367  inner-membrane translocator  37.63 
 
 
291 aa  152  8.999999999999999e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622442  unclonable  0.0000000514338 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  30.82 
 
 
294 aa  139  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0892  inner-membrane translocator  39.27 
 
 
290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  31.31 
 
 
290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3104  inner-membrane translocator  35.62 
 
 
293 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1516  inner-membrane translocator  32.65 
 
 
291 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2129  inner-membrane translocator  30.06 
 
 
294 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1822  inner-membrane translocator  29.75 
 
 
294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2188  inner-membrane translocator  36.32 
 
 
294 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2039  inner-membrane translocator  36.89 
 
 
294 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000380808 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0669  inner-membrane translocator  39 
 
 
294 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1733  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.84 
 
 
294 aa  116  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.293981  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1483  inner-membrane translocator  34.53 
 
 
295 aa  116  6e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4550  inner-membrane translocator  41.62 
 
 
290 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1680  inner-membrane translocator  39.09 
 
 
291 aa  113  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0996  inner-membrane translocator  33.66 
 
 
293 aa  113  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1672  inner-membrane translocator  36.19 
 
 
299 aa  113  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0679  inner-membrane translocator  40.11 
 
 
290 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  33.05 
 
 
300 aa  108  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1046  inner-membrane translocator  29.25 
 
 
289 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.316666 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0834  inner-membrane translocator  34.63 
 
 
300 aa  106  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000998369  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  34.98 
 
 
287 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3821  inner-membrane translocator  37.36 
 
 
293 aa  102  7e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3515  ABC transporter membrane spanning protein  32.32 
 
 
300 aa  99.8  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1408  inner-membrane translocator  33.5 
 
 
317 aa  99  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0385  inner-membrane translocator  33.91 
 
 
293 aa  98.6  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0290  inner-membrane translocator  33.02 
 
 
306 aa  97.8  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  32.84 
 
 
290 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4070  inner-membrane translocator  34.74 
 
 
295 aa  97.8  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  32.88 
 
 
292 aa  96.7  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0598  inner-membrane translocator  32.89 
 
 
304 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34105  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  26.06 
 
 
291 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2739  inner-membrane translocator  29.09 
 
 
290 aa  95.5  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4918  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein BraD  32.44 
 
 
304 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.44 
 
 
291 aa  94.7  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  26.86 
 
 
319 aa  94  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4866  inner-membrane translocator  32 
 
 
304 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  hitchhiker  0.000815383 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4744  inner-membrane translocator  32 
 
 
304 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579328  hitchhiker  0.000000155208 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3328  inner-membrane translocator  29.8 
 
 
300 aa  93.6  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166964  normal  0.584188 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2397  inner-membrane translocator  30.48 
 
 
300 aa  93.6  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00620383 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  34.01 
 
 
287 aa  93.2  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0553  inner-membrane translocator  32 
 
 
304 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0455233  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3072  inner-membrane translocator  29.29 
 
 
300 aa  92.4  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117603  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1581  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.48 
 
 
289 aa  92  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000593948  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4922  inner-membrane translocator  31.56 
 
 
304 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.75867  hitchhiker  0.0000000000177319 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.28 
 
 
293 aa  92.4  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64890  putative permease of ABC branched chain amino acid transporter  31.58 
 
 
304 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4658  inner-membrane translocator  31.56 
 
 
304 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026431 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0728  inner-membrane translocator  31.56 
 
 
303 aa  90.1  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>