More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1518 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1518  inner-membrane translocator  100 
 
 
345 aa  661    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2942  inner-membrane translocator  75.07 
 
 
345 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.550413  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1821  inner-membrane translocator  60.87 
 
 
345 aa  419  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.683409  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0908  inner-membrane translocator:ABC transporter related  65.61 
 
 
951 aa  413  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0412388  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4098  inner-membrane translocator:ABC transporter related  67.16 
 
 
950 aa  414  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0025  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  63.71 
 
 
351 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.746489  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3908  inner-membrane translocator  63.71 
 
 
351 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3042  inner-membrane translocator  62.57 
 
 
351 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3363  inner-membrane translocator  64.96 
 
 
350 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102738  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0090  inner-membrane translocator  62.57 
 
 
351 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01744  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  64.86 
 
 
350 aa  393  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.698868  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0091  inner-membrane translocator  63.14 
 
 
351 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3272  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  62.57 
 
 
351 aa  393  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0268  inner-membrane translocator  61.16 
 
 
345 aa  392  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0081  inner-membrane translocator  63.14 
 
 
351 aa  391  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3512  inner-membrane translocator  64.96 
 
 
350 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0408964 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3985  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  63.43 
 
 
351 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0990  inner-membrane translocator  63.9 
 
 
345 aa  386  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1602  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  63.43 
 
 
351 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2941  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  63.43 
 
 
351 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3370  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  63.43 
 
 
351 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0193  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  63.43 
 
 
351 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107939  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3000  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  63.43 
 
 
351 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.403467  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4059  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  63.14 
 
 
351 aa  381  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3323  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  63.43 
 
 
397 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0801  inner-membrane translocator  60.98 
 
 
346 aa  380  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0107  inner-membrane translocator  62.86 
 
 
351 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790851  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3236  inner-membrane translocator  57.88 
 
 
349 aa  376  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0230482  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2965  inner-membrane translocator  62.57 
 
 
394 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.235343  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0090  inner-membrane translocator  62.57 
 
 
394 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.823802  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4658  inner-membrane translocator  65.14 
 
 
350 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.14788 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4526  inner-membrane translocator  65.14 
 
 
350 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.141329  normal  0.558956 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0573  inner-membrane translocator  63.48 
 
 
342 aa  364  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.4403  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1229  inner-membrane translocator  64.06 
 
 
342 aa  363  2e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3952  inner-membrane translocator  57.58 
 
 
360 aa  347  2e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5328  inner-membrane translocator  58.17 
 
 
345 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0654205  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7085  ABC transporter, permease protein  56.93 
 
 
341 aa  325  6e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0693  inner-membrane translocator  49.57 
 
 
349 aa  321  9.000000000000001e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1995  inner-membrane translocator  53.62 
 
 
346 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3891  ABC transporter ATPase component  51.86 
 
 
954 aa  318  7e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3571  inner-membrane translocator  53.74 
 
 
346 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.16314 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0776  inner-membrane translocator  52.46 
 
 
345 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.300879  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4633  inner-membrane translocator  52.46 
 
 
345 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1892  inner-membrane translocator  54.86 
 
 
346 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.322186  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3249  branched chain amino acid ABC transporter permease  47.67 
 
 
347 aa  297  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.174248  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2424  inner-membrane translocator  57.51 
 
 
349 aa  287  2e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.69608  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0996  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  47.58 
 
 
357 aa  279  5e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.883581  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2875  inner-membrane translocator  49.14 
 
 
351 aa  268  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.781578  normal  0.470002 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1327  inner-membrane translocator  46.93 
 
 
343 aa  253  4.0000000000000004e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.492198  normal  0.0368007 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2317  inner-membrane translocator  47.62 
 
 
343 aa  252  5.000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1505  inner-membrane translocator  49.7 
 
 
351 aa  249  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122982  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0892  inner-membrane translocator  35.44 
 
 
290 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3104  inner-membrane translocator  32.38 
 
 
293 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0367  inner-membrane translocator  40.72 
 
 
291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622442  unclonable  0.0000000514338 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  31.48 
 
 
290 aa  132  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2188  inner-membrane translocator  30.29 
 
 
294 aa  130  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2039  inner-membrane translocator  32.38 
 
 
294 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000380808 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0996  inner-membrane translocator  30.21 
 
 
293 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0669  inner-membrane translocator  39.6 
 
 
294 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1483  inner-membrane translocator  31.38 
 
 
295 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1516  inner-membrane translocator  37.96 
 
 
291 aa  119  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1822  inner-membrane translocator  28.94 
 
 
294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1680  inner-membrane translocator  32.31 
 
 
291 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0385  inner-membrane translocator  32.46 
 
 
293 aa  117  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0679  inner-membrane translocator  30.96 
 
 
290 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4070  inner-membrane translocator  37.67 
 
 
295 aa  116  6.9999999999999995e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  29.33 
 
 
294 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2129  inner-membrane translocator  33.65 
 
 
294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3821  inner-membrane translocator  33.12 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1733  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
294 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.293981  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3500  inner-membrane translocator  32.01 
 
 
291 aa  109  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.334303  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4550  inner-membrane translocator  40.4 
 
 
290 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  29.48 
 
 
287 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  34.11 
 
 
290 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6586  inner-membrane translocator  28.74 
 
 
291 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0834  inner-membrane translocator  35.59 
 
 
300 aa  107  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000998369  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1046  inner-membrane translocator  33.65 
 
 
289 aa  106  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.316666 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1479  inner-membrane translocator  30.97 
 
 
302 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  29.52 
 
 
308 aa  104  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0290  inner-membrane translocator  28.49 
 
 
306 aa  103  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.52 
 
 
308 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  29.52 
 
 
308 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.52 
 
 
308 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0336  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.27 
 
 
294 aa  102  9e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.27 
 
 
294 aa  102  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1696  inner-membrane translocator  28.88 
 
 
291 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  29.88 
 
 
300 aa  101  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6490  inner-membrane translocator  28.45 
 
 
291 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0479005  normal  0.485877 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  29.85 
 
 
291 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  28.61 
 
 
319 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  27.01 
 
 
308 aa  99.4  8e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  28.61 
 
 
308 aa  99.4  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1672  inner-membrane translocator  32.7 
 
 
299 aa  99.4  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  30.3 
 
 
308 aa  99.4  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  28.61 
 
 
308 aa  99.4  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  28.61 
 
 
308 aa  99.4  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  27.33 
 
 
319 aa  99  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0466  inner-membrane translocator  28.37 
 
 
316 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0964978  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  28.61 
 
 
319 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  28.61 
 
 
319 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>