More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0393 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  100 
 
 
294 aa  568  1e-161  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0336  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  99.66 
 
 
294 aa  564  1e-160  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3749  inner-membrane translocator  75.51 
 
 
295 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1619  inner-membrane translocator  58.95 
 
 
290 aa  340  1e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.755467  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1533  inner-membrane translocator  43.71 
 
 
288 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575934  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2425  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  43.36 
 
 
288 aa  218  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.674149  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1438  inner-membrane translocator  43.36 
 
 
288 aa  218  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1454  inner-membrane translocator  41.61 
 
 
288 aa  212  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.566264  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1928  inner-membrane translocator  41.2 
 
 
290 aa  211  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.45272  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5994  branched chain amino acid ABC transporter permease  41.55 
 
 
290 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0717664 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1707  inner-membrane translocator  38.03 
 
 
294 aa  206  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.666506  normal  0.0117709 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1905  inner-membrane translocator  39.3 
 
 
290 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.419507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0793  inner-membrane translocator  37.86 
 
 
290 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1581  inner-membrane translocator  37.29 
 
 
308 aa  189  7e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2006  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.11 
 
 
288 aa  185  7e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.766894  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  37.29 
 
 
293 aa  185  7e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  36.27 
 
 
287 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0896  inner-membrane translocator  37.23 
 
 
295 aa  183  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  37.97 
 
 
300 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  37.63 
 
 
287 aa  182  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1563  inner-membrane translocator  41.32 
 
 
283 aa  182  8.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0005  inner-membrane translocator  37.27 
 
 
294 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.901395  hitchhiker  0.00000431174 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  37.19 
 
 
291 aa  179  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  40.89 
 
 
293 aa  179  4.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0862  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.48 
 
 
288 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0185519  normal  0.209309 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3980  ABC transporter permease  36.95 
 
 
287 aa  177  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0118656 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  34.46 
 
 
308 aa  176  5e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0313  inner-membrane translocator  37.19 
 
 
291 aa  175  8e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.477934 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1829  inner-membrane translocator  40.21 
 
 
289 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000486818  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2500  inner-membrane translocator  37.67 
 
 
287 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0220  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  38.38 
 
 
290 aa  170  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168677  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2112  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.71 
 
 
291 aa  166  5.9999999999999996e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5975  inner-membrane translocator  38.68 
 
 
285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.599678  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2501  inner-membrane translocator  36.73 
 
 
302 aa  162  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.123023 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0481  branched chain amino acid ABC transporter permease  35.64 
 
 
292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2127  inner-membrane translocator  35.76 
 
 
292 aa  162  9e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172623  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0892  inner-membrane translocator  37.15 
 
 
290 aa  161  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  35.89 
 
 
290 aa  161  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1091  inner-membrane translocator  37.76 
 
 
325 aa  160  3e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3394  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.08 
 
 
291 aa  159  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1194  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.84 
 
 
287 aa  159  4e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1096  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.84 
 
 
287 aa  159  4e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1099  inner-membrane translocator  35.54 
 
 
292 aa  159  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110891  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3837  inner-membrane translocator  38.75 
 
 
287 aa  159  8e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622329  normal  0.114435 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  34.23 
 
 
301 aa  157  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1391  inner-membrane translocator  35.84 
 
 
294 aa  157  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0327  inner-membrane translocator  34.98 
 
 
293 aa  157  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0975712  normal  0.166918 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0362  inner-membrane translocator  36.27 
 
 
296 aa  157  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1581  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.97 
 
 
289 aa  156  4e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000593948  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2588  inner-membrane translocator  34.26 
 
 
290 aa  156  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3646  inner-membrane translocator  34.84 
 
 
287 aa  156  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.362219  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1387  inner-membrane translocator  36.73 
 
 
294 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2253  inner-membrane translocator  34.2 
 
 
301 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3095  inner-membrane translocator  34.77 
 
 
309 aa  155  6e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2366  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.99 
 
 
299 aa  155  1e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00045769  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2141  inner-membrane translocator  34.84 
 
 
292 aa  155  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.694846 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1258  inner-membrane translocator  36.81 
 
 
291 aa  154  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241594  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3552  inner-membrane translocator  38.33 
 
 
289 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  34.48 
 
 
293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1949  inner-membrane translocator  35.93 
 
 
292 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.926324  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0259  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  34.9 
 
 
301 aa  153  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2272  inner-membrane translocator  36.33 
 
 
291 aa  152  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.711778 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1652  inner-membrane translocator  33.22 
 
 
291 aa  152  7e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124335  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2166  inner-membrane translocator  35.42 
 
 
286 aa  152  8.999999999999999e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0534  inner-membrane translocator  37.02 
 
 
290 aa  151  1e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000179103 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1943  inner-membrane translocator  35.99 
 
 
291 aa  151  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1848  inner-membrane translocator  35.27 
 
 
292 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.623579  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0473  inner-membrane translocator  35.91 
 
 
301 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2885  putative ABC transporter permiase component  34.66 
 
 
277 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0257829 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3619  inner-membrane translocator  35.19 
 
 
305 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.551009 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5641  inner-membrane translocator  34.04 
 
 
289 aa  149  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  31.86 
 
 
290 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0644  inner-membrane translocator  36.71 
 
 
290 aa  149  6e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2608  inner-membrane translocator  31.63 
 
 
302 aa  149  7e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0461  inner-membrane translocator  35.49 
 
 
298 aa  149  7e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2918  inner-membrane translocator  36.52 
 
 
290 aa  148  9e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2115  inner-membrane translocator  33.67 
 
 
304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.592251  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5834  inner-membrane translocator  33.92 
 
 
290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317168 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1664  inner-membrane translocator  36.36 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2751  inner-membrane translocator  32.79 
 
 
301 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1676  inner-membrane translocator  38.33 
 
 
285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0527356 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2331  inner-membrane translocator  36.4 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.729625  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  33.92 
 
 
294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0399  branched chain amino acid ABC transporter permease  36.14 
 
 
294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.615306  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2188  inner-membrane translocator  33.1 
 
 
294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0852  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  39.73 
 
 
289 aa  145  6e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.416371  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2396  inner-membrane translocator  31.97 
 
 
302 aa  145  6e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.228148  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5101  inner-membrane translocator  34.01 
 
 
603 aa  145  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208256  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1601  inner-membrane translocator  32.51 
 
 
287 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.549265  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1163  inner-membrane translocator  33.45 
 
 
290 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0535977  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1797  inner-membrane translocator  33.79 
 
 
290 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.160989 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3500  inner-membrane translocator  34.03 
 
 
291 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.334303  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1501  inner-membrane translocator  33.68 
 
 
291 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14327  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  33.91 
 
 
292 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5318  inner-membrane translocator  33.33 
 
 
603 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0891799  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  34.78 
 
 
308 aa  143  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  34.24 
 
 
308 aa  143  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2534  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33 
 
 
603 aa  143  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  34.24 
 
 
308 aa  143  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3768  inner-membrane translocator  33.8 
 
 
291 aa  144  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.179629 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>