More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_0090 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_0090  inner-membrane translocator  100 
 
 
351 aa  678    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3272  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  96.01 
 
 
351 aa  640    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0091  inner-membrane translocator  94.87 
 
 
351 aa  633  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0081  inner-membrane translocator  94.59 
 
 
351 aa  632  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0107  inner-membrane translocator  96.01 
 
 
351 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790851  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0090  inner-membrane translocator  95.73 
 
 
394 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.823802  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2965  inner-membrane translocator  95.73 
 
 
394 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.235343  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3985  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  87.14 
 
 
351 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3370  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  87.43 
 
 
351 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2941  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  87.43 
 
 
351 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0193  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  87.43 
 
 
351 aa  555  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107939  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3323  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  86.86 
 
 
397 aa  556  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1602  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  87.43 
 
 
351 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3000  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  87.43 
 
 
351 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.403467  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3042  inner-membrane translocator  81.77 
 
 
351 aa  552  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4059  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  87.14 
 
 
351 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3908  inner-membrane translocator  80.63 
 
 
351 aa  545  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0025  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  80.34 
 
 
351 aa  545  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.746489  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3363  inner-membrane translocator  70.86 
 
 
350 aa  464  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102738  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01744  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  69.71 
 
 
350 aa  458  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.698868  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3512  inner-membrane translocator  70.86 
 
 
350 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0408964 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4658  inner-membrane translocator  69.14 
 
 
350 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.14788 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4526  inner-membrane translocator  69.14 
 
 
350 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.141329  normal  0.558956 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3236  inner-membrane translocator  59.14 
 
 
349 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0230482  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0908  inner-membrane translocator:ABC transporter related  61.43 
 
 
951 aa  381  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0412388  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1518  inner-membrane translocator  62.57 
 
 
345 aa  375  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0268  inner-membrane translocator  56.57 
 
 
345 aa  375  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2942  inner-membrane translocator  61.14 
 
 
345 aa  364  1e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.550413  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0801  inner-membrane translocator  55.84 
 
 
346 aa  363  2e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0990  inner-membrane translocator  58.86 
 
 
345 aa  355  5.999999999999999e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1821  inner-membrane translocator  50.57 
 
 
345 aa  347  1e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.683409  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4098  inner-membrane translocator:ABC transporter related  57.97 
 
 
950 aa  347  2e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1229  inner-membrane translocator  54.29 
 
 
342 aa  335  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0573  inner-membrane translocator  56.29 
 
 
342 aa  324  1e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.4403  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3571  inner-membrane translocator  54.13 
 
 
346 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.16314 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3952  inner-membrane translocator  51.8 
 
 
360 aa  319  3.9999999999999996e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1995  inner-membrane translocator  54.13 
 
 
346 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5328  inner-membrane translocator  55.56 
 
 
345 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0654205  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0776  inner-membrane translocator  52 
 
 
345 aa  309  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.300879  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7085  ABC transporter, permease protein  52.48 
 
 
341 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1892  inner-membrane translocator  54.42 
 
 
346 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.322186  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0693  inner-membrane translocator  50.58 
 
 
349 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4633  inner-membrane translocator  51.41 
 
 
345 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3249  branched chain amino acid ABC transporter permease  48.43 
 
 
347 aa  300  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.174248  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2424  inner-membrane translocator  57.43 
 
 
349 aa  293  3e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.69608  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3891  ABC transporter ATPase component  47.01 
 
 
954 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0996  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  43.5 
 
 
357 aa  276  5e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.883581  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2875  inner-membrane translocator  48.73 
 
 
351 aa  271  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.781578  normal  0.470002 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1505  inner-membrane translocator  48.4 
 
 
351 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122982  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1327  inner-membrane translocator  42.34 
 
 
343 aa  229  4e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.492198  normal  0.0368007 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2317  inner-membrane translocator  42.54 
 
 
343 aa  229  6e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0367  inner-membrane translocator  33.73 
 
 
291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622442  unclonable  0.0000000514338 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3104  inner-membrane translocator  35.43 
 
 
293 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  30.7 
 
 
290 aa  123  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0892  inner-membrane translocator  35.87 
 
 
290 aa  116  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1483  inner-membrane translocator  29.7 
 
 
295 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2188  inner-membrane translocator  28.07 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2129  inner-membrane translocator  30.4 
 
 
294 aa  113  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  34.48 
 
 
294 aa  113  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1516  inner-membrane translocator  36.57 
 
 
291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2039  inner-membrane translocator  28.48 
 
 
294 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000380808 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0669  inner-membrane translocator  39.27 
 
 
294 aa  104  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0679  inner-membrane translocator  29.76 
 
 
290 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0996  inner-membrane translocator  33 
 
 
293 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1822  inner-membrane translocator  31.55 
 
 
294 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1672  inner-membrane translocator  30.84 
 
 
299 aa  100  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1733  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  32.06 
 
 
294 aa  98.6  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.293981  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1680  inner-membrane translocator  33.18 
 
 
291 aa  96.7  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  30.7 
 
 
300 aa  95.9  8e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  30.96 
 
 
287 aa  93.6  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  31.37 
 
 
290 aa  93.2  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4550  inner-membrane translocator  37.06 
 
 
290 aa  93.2  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0834  inner-membrane translocator  31.55 
 
 
300 aa  92.8  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000998369  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0290  inner-membrane translocator  27.36 
 
 
306 aa  92.4  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1046  inner-membrane translocator  33.64 
 
 
289 aa  92  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.316666 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  30.46 
 
 
287 aa  92.4  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3821  inner-membrane translocator  33.7 
 
 
293 aa  90.1  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2608  inner-membrane translocator  25.66 
 
 
302 aa  86.7  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  30.95 
 
 
291 aa  86.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  29.3 
 
 
293 aa  86.3  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3980  ABC transporter permease  29.95 
 
 
287 aa  85.5  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0118656 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3500  inner-membrane translocator  33.91 
 
 
291 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.334303  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6586  inner-membrane translocator  26.32 
 
 
291 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5101  inner-membrane translocator  31.11 
 
 
603 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.208256  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6490  inner-membrane translocator  26.39 
 
 
291 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0479005  normal  0.485877 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1408  inner-membrane translocator  32.52 
 
 
317 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.58 
 
 
293 aa  83.6  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0385  inner-membrane translocator  31.82 
 
 
293 aa  83.2  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3837  inner-membrane translocator  34.31 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622329  normal  0.114435 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  28.57 
 
 
301 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3336  inner-membrane translocator  32.43 
 
 
307 aa  82  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5318  inner-membrane translocator  31.58 
 
 
603 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0891799  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3584  inner-membrane translocator  31.1 
 
 
603 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.11 
 
 
294 aa  81.3  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.844252  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3515  ABC transporter membrane spanning protein  27.78 
 
 
300 aa  81.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2534  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.1 
 
 
603 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0336  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  29.11 
 
 
294 aa  81.6  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4070  inner-membrane translocator  29.89 
 
 
295 aa  81.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3936  inner-membrane translocator  31.1 
 
 
603 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.240526  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4866  inner-membrane translocator  28 
 
 
304 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  hitchhiker  0.000815383 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>