More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0801 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0801  inner-membrane translocator  100 
 
 
346 aa  667    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0268  inner-membrane translocator  79.19 
 
 
345 aa  529  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0990  inner-membrane translocator  73.62 
 
 
345 aa  453  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0091  inner-membrane translocator  57.55 
 
 
351 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0081  inner-membrane translocator  57.55 
 
 
351 aa  361  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3908  inner-membrane translocator  56.86 
 
 
351 aa  358  7e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0090  inner-membrane translocator  56.41 
 
 
351 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0025  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  56.57 
 
 
351 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.746489  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1518  inner-membrane translocator  60.98 
 
 
345 aa  355  5e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01744  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  58.81 
 
 
350 aa  355  7.999999999999999e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.698868  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3042  inner-membrane translocator  56.29 
 
 
351 aa  354  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3272  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  56.41 
 
 
351 aa  353  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2941  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  56.7 
 
 
351 aa  352  4e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0193  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  56.7 
 
 
351 aa  352  4e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107939  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3000  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  56.7 
 
 
351 aa  352  4e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.403467  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3370  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  56.7 
 
 
351 aa  352  4e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1602  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  56.7 
 
 
351 aa  352  4e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4059  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  56.7 
 
 
351 aa  352  7e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4098  inner-membrane translocator:ABC transporter related  59.94 
 
 
950 aa  350  2e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3985  putative amino acid uptake ABC transporter, permease protein  56.98 
 
 
351 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4526  inner-membrane translocator  59.43 
 
 
350 aa  349  4e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.141329  normal  0.558956 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4658  inner-membrane translocator  59.43 
 
 
350 aa  349  4e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.14788 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3363  inner-membrane translocator  58.24 
 
 
350 aa  347  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102738  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2942  inner-membrane translocator  59.94 
 
 
345 aa  347  2e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.550413  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3512  inner-membrane translocator  58.29 
 
 
350 aa  345  6e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0408964 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3323  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  56.98 
 
 
397 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0908  inner-membrane translocator:ABC transporter related  57.31 
 
 
951 aa  340  2e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0412388  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3236  inner-membrane translocator  52.56 
 
 
349 aa  340  2e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0230482  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0107  inner-membrane translocator  56.41 
 
 
351 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790851  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2965  inner-membrane translocator  56.41 
 
 
394 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.235343  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0090  inner-membrane translocator  56.41 
 
 
394 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.823802  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1821  inner-membrane translocator  52.6 
 
 
345 aa  333  2e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.683409  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1229  inner-membrane translocator  55.33 
 
 
342 aa  325  9e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7085  ABC transporter, permease protein  56.21 
 
 
341 aa  321  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0573  inner-membrane translocator  56.36 
 
 
342 aa  319  5e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.4403  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3571  inner-membrane translocator  54.05 
 
 
346 aa  318  6e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.16314 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3952  inner-membrane translocator  55.12 
 
 
360 aa  317  3e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1995  inner-membrane translocator  52.6 
 
 
346 aa  316  5e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5328  inner-membrane translocator  56.65 
 
 
345 aa  315  5e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0654205  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3891  ABC transporter ATPase component  50.14 
 
 
954 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0693  inner-membrane translocator  46.57 
 
 
349 aa  299  4e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1892  inner-membrane translocator  54.18 
 
 
346 aa  299  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.322186  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0996  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  47.61 
 
 
357 aa  294  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.883581  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0776  inner-membrane translocator  52 
 
 
345 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.300879  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3249  branched chain amino acid ABC transporter permease  46.82 
 
 
347 aa  290  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.174248  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2424  inner-membrane translocator  56.36 
 
 
349 aa  287  1e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.69608  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4633  inner-membrane translocator  48.86 
 
 
345 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2875  inner-membrane translocator  47.26 
 
 
351 aa  252  6e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.781578  normal  0.470002 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2317  inner-membrane translocator  46.48 
 
 
343 aa  241  2e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1327  inner-membrane translocator  45.63 
 
 
343 aa  238  9e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.492198  normal  0.0368007 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1505  inner-membrane translocator  47.48 
 
 
351 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.122982  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0892  inner-membrane translocator  31.96 
 
 
290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0367  inner-membrane translocator  31.18 
 
 
291 aa  129  7.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622442  unclonable  0.0000000514338 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2188  inner-membrane translocator  29.82 
 
 
294 aa  122  9e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  30 
 
 
290 aa  120  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1516  inner-membrane translocator  37.67 
 
 
291 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  29.91 
 
 
294 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2039  inner-membrane translocator  29.52 
 
 
294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000380808 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  32.64 
 
 
300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3104  inner-membrane translocator  38.35 
 
 
293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0385  inner-membrane translocator  32.62 
 
 
293 aa  109  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2129  inner-membrane translocator  33.65 
 
 
294 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1822  inner-membrane translocator  27.71 
 
 
294 aa  106  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1680  inner-membrane translocator  38.39 
 
 
291 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0669  inner-membrane translocator  36.65 
 
 
294 aa  103  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0260  inner-membrane translocator  31.11 
 
 
287 aa  103  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  28.48 
 
 
291 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0679  inner-membrane translocator  34.51 
 
 
290 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1733  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.73 
 
 
294 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.293981  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2396  inner-membrane translocator  28.32 
 
 
302 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.228148  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  30.64 
 
 
291 aa  101  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  29.71 
 
 
293 aa  100  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  33.47 
 
 
308 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1892  branched-chain amino acid AbC-type transport system permease  27.64 
 
 
308 aa  100  3e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.339228  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0996  inner-membrane translocator  33.48 
 
 
293 aa  100  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2366  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  31.69 
 
 
299 aa  99.4  9e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00045769  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1483  inner-membrane translocator  42.18 
 
 
295 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2500  inner-membrane translocator  30.87 
 
 
287 aa  98.6  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.47 
 
 
308 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  33.47 
 
 
308 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  33.47 
 
 
308 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  31.86 
 
 
292 aa  97.4  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  33.47 
 
 
308 aa  97.4  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2608  inner-membrane translocator  27.33 
 
 
302 aa  97.4  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3821  inner-membrane translocator  35.29 
 
 
293 aa  97.1  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  33.06 
 
 
308 aa  96.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  33.06 
 
 
319 aa  96.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  33.06 
 
 
308 aa  96.7  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  33.06 
 
 
319 aa  96.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  33.06 
 
 
319 aa  96.3  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1408  inner-membrane translocator  37.69 
 
 
317 aa  96.3  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  33.06 
 
 
308 aa  96.3  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  26.57 
 
 
319 aa  95.1  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3660  inner-membrane translocator  31.47 
 
 
287 aa  95.5  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.741665  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  29.74 
 
 
293 aa  95.5  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4070  inner-membrane translocator  28.08 
 
 
295 aa  95.1  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  28.53 
 
 
308 aa  95.5  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4550  inner-membrane translocator  36.56 
 
 
290 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1391  inner-membrane translocator  31.33 
 
 
294 aa  94.7  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1479  inner-membrane translocator  27.86 
 
 
302 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>